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《生命的化学》 2017年01期
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混合谱图所引发的肽段质谱数据分析的问题及其解决方案

邓亚美  谢丹丹  许少行  闻博  刘斯奇  
【摘要】:基于数据依赖性采集模式(DDA)的质谱分析是进行规模化蛋白质组学研究的常用方法。由于这类方法往往是液相色谱与质谱联用,因此肽段分离及其质量鉴定是该方法的核心指标。对于复杂肽段混合物而言,混合质谱图是广泛存在的;它们给肽段定性和定量都带来严重的问题。在当前的技术条件下,开发用于识别和分析混合质谱图的生物信息学工具是解决这一问题的可行方案。本文主要介绍了混合质谱图产生的原因和影响因素,以及识别和分析混合谱图的相关生物信息学工具的最新开发进展。
【作者单位】深圳华大基因研究院;中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室;深圳大学;
【基金】:国家国际科研合作专项(2014DFB30020)
【分类号】:Q51;O657.63
【正文快照】:
“鸟枪法(shotgun)”是当前蛋白质组分析的主要方法。生物样本中的蛋白质经蛋白酶(主要是胰蛋白酶)随机水解后产生大量肽段;肽段经液相色谱分馏后,送入质谱仪;然后肽段在特定的离子源上(主要是ESI)离子化,而离子化的肽段(也称为肽段母离子)经质谱检测获得一级质谱信息,然后这

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