收藏本站
《生物化学与生物物理进展》 2013年12期
收藏 | 投稿 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

单细胞转录组研究进展

周超平  李鑫辉  
【摘要】:单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象,提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析,能揭示该细胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息,准确反映细胞间的异质性,深入理解其基因型和表型之间的相互关系,在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开发等领域都发挥重要作用.本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点,并就其面临挑战和未来发展前景进行了讨论,为该技术的进一步研究与应用提供参考.
【作者单位】上海交通大学系统生物医学教育部重点实验室;
【基金】:国家重点基础研究发展计划(973)(2010CB529205) 国家自然科学重大研究计划培育项目(91229108)资助~~
【分类号】:Q343
【正文快照】:
1单细胞转录组分析的特点在某一特定阶段,由细胞转录出来的全部RNA称为转录组,包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)[1-3].准确深入地分析转录组,有助于全面理解细胞基因表达和调控网络的作用.相同组织细胞的基因型几乎一致,但亚单位的表达往往不同,转录组更能反映甲基

【参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 王曦;汪小我;王立坤;冯智星;张学工;;新一代高通量RNA测序数据的处理与分析[J];生物化学与生物物理进展;2010年08期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 井赵斌;魏琳;俞靓;程积民;;转录组测序及其在牧草基因资源发掘中的应用前景[J];草业科学;2011年07期
2 邹权;李旭斌;林子雨;江弋;林琛;;下一代测序技术数据中的选择性剪切计算识别方法研究[J];电子学报;2012年02期
3 刘朋虎;邓优锦;江玉姬;谢宝贵;;草菇PGAM基因克隆、结构及其在同核、异核菌株中的表达量分析[J];福建农业学报;2012年03期
4 刘朋虎;林冬梅;林占熺;李晶;;DNA测序技术及其应用研究进展[J];福建农业学报;2012年10期
5 曹盈;;高通量测序技术在植物转录组研究中的应用[J];北京农业;2013年06期
6 宋作伟;黄茉莉;薛仁宇;曹广力;贡成良;;基于RNA-Seq技术检测分析家蚕卵巢发育高表达基因[J];蚕业科学;2013年04期
7 ;Nasopharyngeal carcinoma:Advances in genomics and molecular genetics[J];Science China(Life Sciences);2011年10期
8 ;Overview of available methods for diverse RNA-Seq data analyses[J];Science China(Life Sciences);2011年12期
9 周扬;屈武斌;卢一鸣;杨毅;张成岗;;TXT2DNA:基于DNA序列的文本编、解码及比对软件系统[J];军事医学;2011年04期
10 张礼;刘学军;;一种基于Gamma模型的RNA-seq数据分析方法[J];南京大学学报(自然科学版);2013年04期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 孙霞;郑成淑;王秀峰;邢世岩;束怀瑞;;菊花花芽分化期叶片和茎尖转录组表达分析[A];中国观赏园艺研究进展2011[C];2011年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 李贵阳;两株鳗弧菌全基因组序列测定及转录组比较分析[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
2 王丽鸳;基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D];中国农业科学院;2011年
3 翟焕趁;稻瘟病菌菌株FJ81278无毒基因Avr-Pid2的定位及深度测序分析[D];福建农林大学;2011年
4 刘朋虎;草菇同核、异核菌株间差异基因表达的研究[D];福建农林大学;2012年
5 叶海燕;日本三角涡虫(Dugesia japonica)线粒体蛋白质组、转录组研究[D];陕西师范大学;2012年
6 姜义仁;柞蚕微孢子虫检测及感染柞蚕中肠转录组及蛋白质组学研究[D];沈阳农业大学;2012年
7 周正富;甘蓝型油菜隐性核不育分子机理及相关基因功能分析[D];华中农业大学;2011年
8 赵华;恶性黑素瘤的转录组学及转移相关分子机制的研究[D];中国人民解放军军医进修学院;2013年
9 曾艳玲;油茶种仁糖酵解途径解析及醛缩酶基因家族功能研究[D];中南林业科技大学;2013年
10 黄琼林;青天葵转录组特征研究[D];广州中医药大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前8条
1 张琳;拟南芥种子发育过程转录组深度测序数据的分析[D];福建农林大学;2011年
2 方晓婷;入侵植物薇甘菊的转录组分析及其群体遗传特征初探[D];中山大学;2011年
3 张小通;中华补血草遗传体系的优化及转录组分析[D];山东师范大学;2012年
4 陈伟;褐飞虱对水稻挥发物的触角电位反应及其气味结合蛋白基因的克隆[D];华中农业大学;2012年
5 赵志兰;基于概率模型的RNA-Seq数据分析[D];南京航空航天大学;2012年
6 魏广兵;抗结核药物异烟肼(INH)引起家蚕氧化损伤的机制研究[D];苏州大学;2013年
7 宋作伟;过表达Bmovo-1对家蚕卵巢发育的影响及丝腺生物工厂分泌表达hIGF-I[D];苏州大学;2013年
8 卢冰心;基于Galaxy的高通量生物数据分析平台[D];华东师范大学;2013年
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 刘桂中,吴旻;单细胞cDNA的制备及扩增[J];中华医学遗传学杂志;1999年03期
2 吴松锋,朱云平,贺福初;转录组与蛋白质组比较研究进展[J];生物化学与生物物理进展;2005年02期
3 李禅;从单细胞到发育完全[J];国外科技动态;1996年03期
4 一平;用单细胞法培育人参[J];世界农业;1983年11期
5 黄骥,张红生,王东,曹雅君,杨金水;基因表达系列分析[J];遗传;2002年02期
6 袁倬斌,李向军,李珺,张君;单细胞成像观测研究进展[J];分析试验室;2004年04期
7 张昀;十三亿年前的单细胞真核生物[J];科学通报;1978年04期
8 谌琛;基因组信息学——现状和前景[J];中国分子心脏病学杂志;2003年05期
9 曾飞跃;周仁辉;黄永凯;罗湘颖;方芳;卢明;陈成;;神经干单细胞获得的一种方法[J];中国医学工程;2007年04期
10 祁云霞;刘永斌;荣威恒;;转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用[J];遗传;2011年11期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 孙淑芬;朱士兴;;中国古元古代滹沱群下部(约2400 Ma)的单细胞真核生物[A];面向21世纪的科技进步与社会经济发展(上册)[C];1999年
2 任恕;周宜开;吴蒙;;单细胞纳米测控技术的研究[A];新世纪科技与湖北经济发展——2001首届湖北科技论坛论文集[C];2001年
3 凌云扬;殷学锋;方肇伦;;在线衍生微流控芯片电泳和激光诱导荧光法测定单细胞中谷胱甘肽[A];第二届全国微全分析系统学术会议论文摘要集[C];2004年
4 李向军;袁倬斌;;单细胞分析研究进展[A];中国化学会第十四届有机分析及生物分析学术研讨会会议论文摘要集[C];2007年
5 黄建永;秦雷;熊春阳;方竞;;单细胞与弹性基底相互作用的力学问题研究[A];庆祝中国力学学会成立50周年暨中国力学学会学术大会’2007论文摘要集(上)[C];2007年
6 金晶;臧爱萍;陈海莹;蔡伟明;;水稻向重性反应过程中地上部基部两侧的转录组研究[A];中国空间科学学会第七次学术年会会议手册及文集[C];2009年
7 王桂文;姚辉璐;黎永青;;单个酵母细胞活化过程的实时拉曼光谱观察[A];第六届全国光生物学学术研讨会论文集[C];2004年
8 肖华;邹汉法;;毛细管电泳-激光诱导荧光联用在单细胞水平上测定K562/S细胞体积[A];第十五次全国色谱学术报告会文集(下册)[C];2005年
9 吴洪开;;纳米技术在单细胞化学成分分析中的应用[A];中国化学会第二十五届学术年会论文摘要集(上册)[C];2006年
10 汤湘;张志勇;张栋;刘巧泉;唐威华;;水稻花粉母细胞的转录组[A];2009中国植物学会植物细胞生物学学术年会论文摘要集[C];2009年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 本报记者 唐婷 朴淑渝;给细胞做“CT”[N];科技日报;2007年
2 常丽君;美首次观察到单细胞内分子化学反应[N];科技日报;2007年
3 中国科学院院士 贺福初;中国蛋白质组计划[N];科技日报;2002年
4 董仁威;35亿年的植物之旅[N];成都日报;2005年
5 苑文;生物经济 商机多多[N];市场报;2000年
6 许沈华;微生物与人“亦敌亦友”[N];家庭医生报;2007年
7 建一;探究生命演化过程[N];大众科技报;2002年
8 记者 刘向;大洋施“铁肥,固化二氧化碳沉海底”[N];新华每日电讯;2004年
9 ;细菌的启示[N];中华读书报;2003年
10 王雪飞 吴志军;首建人类器官蛋白质组“蓝图”[N];健康报;2006年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 陈作舟;EST转录组功能差异的数据挖掘系统及应用[D];浙江大学;2007年
2 李岩;小鼠胚胎干细胞定向分化为肝细胞过程中转录组和蛋白质组的动态变化[D];复旦大学;2009年
3 郭溆;基于转录组测序的石斛生物碱和人参皂苷生物合成相关基因的发掘、克隆及鉴定[D];北京协和医学院;2013年
4 李稚锋;真核基因剪接机制相关特征研究[D];国防科学技术大学;2006年
5 叶海燕;日本三角涡虫(Dugesia japonica)线粒体蛋白质组、转录组研究[D];陕西师范大学;2012年
6 王永志;传染性法氏囊病毒感染的生物标记与细胞SAGE文库的鉴定[D];浙江大学;2009年
7 范建华;小球藻异养/光诱导切换过程的分子响应及其功能基因组学研究[D];华东理工大学;2012年
8 柯细松;应用RNaseⅠ保护法高通量筛选小鼠胚胎的NSATs及序列分析[D];中国协和医科大学;2005年
9 李德茂;单细胞多核管状绿藻原生质团聚及发育研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2007年
10 史硕博;应用系统代谢工程方法改进产核黄素枯草芽孢杆菌的研究[D];天津大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李涛;阿达玛变换显微镜在单细胞成像分析中的应用[D];武汉大学;2004年
2 严清;血吸虫EST数据分析体系的构建与运用[D];上海交通大学;2008年
3 胡茂盛;三裂叶豚草生物吸附剂对含Cu~(2+)污水处理研究[D];东北林业大学;2007年
4 魏来;MeJA诱导人参细胞皂苷生物合成的比较转录组分析[D];中南大学;2007年
5 戴雅丽;基于文昌鱼(Branchiostoma floridae)ESTs的转录组比较分析及EST数据库构建[D];安徽农业大学;2007年
6 徐波;辣椒应答UV-B的转录组差异分析及相关功能基因的分离[D];福建农林大学;2008年
7 陈萍;荧光显微技术在酵母细胞研究中的应用[D];武汉大学;2005年
8 贺世明;吗啡对成瘾大鼠腹侧苍白球神经元放电的影响[D];第四军医大学;2001年
9 周新华;cHL H/RS及背景淋巴细胞BSAP表达与IgH基因重排检测[D];第一军医大学;2002年
10 柳强;奶牛X-,Y-精子抑制消减文库的构建[D];内蒙古农业大学;2009年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026