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《海洋学报(中文版)》 2014年06期
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高温胁迫下坛紫菜的数字基因表达谱研究

赖晓娟  严小军  杨锐  骆其君  陈海敏  
【摘要】:坛紫菜是潮间带重要的经济藻种,对高温、渗透压等逆境具有独特的调控机制。本文采用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术研究了坛紫菜在高温胁迫下的基因表达差异,并分析其相应的响应方式;利用实时定量PCR技术对DGE部分数据进行验证;检测了其中较有代表性的应答基因hsp70的差异表达。结果显示,高温胁迫下坛紫菜中有256个unigene上调表达,以HSP、核糖体蛋白L12、延伸因子EF-Tu及部分光合作用相关基因为代表,3 820个unigene下调表达,主要为核酸、蛋白以及糖类等合成代谢相关基因。Gene Ontology分析表明,差异表达基因主要定位于质体等有膜细胞器,参与繁殖和发育过程,行使催化和连接酶活性的功能。Pathway分析显示,这些基因分布于107条pathway中。其中,下调表达基因最显著富集于mRNA监督和RNA转运途径,而上调表达基因部分富集于内质网的蛋白加工、RNA降解及光合作用途径。验证表明此次DGE结果具有较高准确性,hsp70基因对高温响应积极。综上所述,DGE结果反应出,在高温胁迫时,坛紫菜出现基础代谢减慢、合成速度下降、能量合成受阻、碳同化降低等现象,但光合作用前期未受影响,同时补救途径启动。

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【参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 朱竹君;骆其君;严小军;杨锐;何山;陈海敏;;琼胶寡糖聚合度对坛紫菜抗性诱导的影响[J];海洋学报(中文版);2012年06期
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 杨惠;条斑紫菜功能基因组及重复序列特征研究[D];中国海洋大学;2011年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 童冠文;;条斑紫菜经济性状研究进展[J];现代农业科技;2010年11期
2 穆新武;韩晓磊;蒋惠泉;杨立恩;姚春燕;许璞;;不同绿藻核rDNA间隔区ITS的序列和系统发育分析[J];常熟理工学院学报;2009年08期
3 杨立恩;金杰;朱建一;韩晓磊;穆新武;许璞;;紫菜(Porphyra)叶状体rbcL基因分类学分析[J];常熟理工学院学报;2009年08期
4 沈颂东;;许璞教授的紫菜属海藻遗传学研究工作评述[J];常熟理工学院学报;2010年10期
5 张耀东;沈颂东;林阿朋;张劲;;用18S rRNA序列探讨8种绿藻分子系统发育[J];大连水产学院学报;2009年01期
6 宋武林;;坛紫菜新品系“申福1、2号”规模化养殖技术研究[J];福建水产;2010年04期
7 计玮玮;邱翠花;焦云;郭延平;滕元文;;高温强光胁迫对砂梨叶片光合作用、D1蛋白和Deg1蛋白酶的影响[J];果树学报;2012年05期
8 潘攀;杨彦芳;王瑛;胡秀丽;;干旱高温复合胁迫下sHSPs基因在不同耐旱性玉米中的表达差异及其对ABA和H_2O_2的响应[J];西北植物学报;2013年08期
9 Lihong GUO;Xiaohong YANG;Chunyan SHAO;;Construction of Plant Expression Vector of Heat Shock Factor Gene AtHsfA1a from Arabidopsis[J];Agricultural Biotechnology;2013年04期
10 张健;刘美艳;申杰;刘丹;俞立璇;李雪华;;外源亚精胺对淹涝胁迫下黄瓜根HSP70表达的影响[J];广西植物;2013年05期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 陈伟洲;许俊宾;吴文婷;姜红霞;朱建一;陆勤勤;;三种紫菜叶状体对高温胁迫的生理响应[A];热带海洋科学学术研讨会暨第八届广东海洋湖沼学会、第七届广东海洋学会会员代表大会论文及摘要汇编[C];2013年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 王超;紫菜光合碳同化途径相关基因的表达分析[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
2 楚璞;莲膜联蛋白的鉴定及其在种子耐热性和活力中的功能研究[D];中山大学;2011年
3 陈熙;低叶绿素b水稻类囊体膜的蛋白质组学研究[D];南京农业大学;2009年
4 姜红霞;坛紫菜对阳光紫外辐射的生理生态学响应[D];汕头大学;2007年
5 乔利仙;紫菜遗传多样性分析及其6-磷酸海藻糖合成酶基因转化水稻的研究[D];中国海洋大学;2007年
6 李晓捷;杂交海带培育与应用研究[D];中国海洋大学;2008年
7 程晓杰;龙须菜杂种优势株的筛选及AFLP分析[D];中国海洋大学;2008年
8 李秉钧;中国养殖海带不同群体的遗传变异分析及海带配子体性别性状初步定位[D];中国海洋大学;2008年
9 王金锋;基于核酸序列的海藻生物地理和光适应性进化研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2010年
10 刘峰;黄海绿潮的成因以及绿潮浒苔的生理生态学和分子系统学研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李树芬;甜菜碱提高转基因番茄耐热性研究[D];山东农业大学;2010年
2 宋长芹;黄瓜GST基因对拟南芥的转化及转基因植株抗高温能力的增强[D];辽宁师范大学;2010年
3 童冠文;条斑紫菜经济性状的遗传分析[D];中国海洋大学;2010年
4 于一;条斑紫菜和坛紫菜SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用[D];中国海洋大学;2010年
5 邢永泽;生态因子对萱藻(Scytosiphon lomentaria)孢子体、配子体生长发育影响的研究[D];中国海洋大学;2010年
6 赵小波;条斑紫菜在不同生态条件下光合效率比较研究[D];中国海洋大学;2010年
7 王莉;坛紫菜生长发育的细胞学观察以及纯合品系的建立[D];中国海洋大学;2010年
8 张杨;龙须菜琼胶合成相关基因的克隆及其表达调控的研究[D];中国海洋大学;2010年
9 吕中贤;NDH-CET在缓解蓝藻PSII光抑制中的作用机制研究[D];上海师范大学;2011年
10 贺彭毅;不同耐高温棉花叶片光合作用特性研究[D];湖南农业大学;2011年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王丹;杨宇;;植物功能基因组的主要研究方法及其应用[J];现代农业科技;2009年01期
2 徐民俊;茅云翔;庄筠昀;张学成;;条斑紫菜孢子体cDNA文库构建及表达序列标签的初步分析[J];大连水产学院学报;2006年01期
3 王平荣;张帆涛;高家旭;孙小秋;邓晓建;;高等植物叶绿素生物合成的研究进展[J];西北植物学报;2009年03期
4 杨官品,沈怀舜,许璞,张学成;条斑紫菜丝状孢子体表达序列标签分析[J];高技术通讯;2002年02期
5 ;Analysis on Frequency and Density of Microsatellites in Coding Seauences of Several Eukarvotic Genomes[J];Genomics Proteomics & Bioinformatics;2004年01期
6 刘必谦,曾庆国,骆其君,王亚军,厉盛华;条斑紫菜(Porphyra yezoensis)dbEST中筛选微卫星位点及引物种间转移扩增[J];海洋与湖沼;2005年03期
7 庞国兴,王广策,胡松年,曾呈奎;坛紫菜(Porphyra haitanensis)丝状孢子体EST的获取及其生物信息学分析[J];海洋与湖沼;2005年05期
8 张全斌,赵婷婷,2,綦慧敏,2,李智恩,徐祖洪;紫菜的营养价值研究概况[J];海洋科学;2005年02期
9 袁昭岚;黄鹤忠;沈颂东;陈大鹏;朱建一;许璞;;条斑紫菜5个栽培品系的ISSR分析[J];海洋科学;2006年07期
10 ;Genome size and sequence composition of moso bamboo: A comparative study[J];Science in China(Series C:Life Sciences);2007年05期
中国博士学位论文全文数据库 前3条
1 高焕;中国对虾基因组串联重复序列分析及其分子标记的开发与应用[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2006年
2 栾生;日本囊对虾基因组串联重复序列分析及微卫星标记的开发与应用[D];中国海洋大学;2006年
3 张玲玲;栉孔扇贝fosmid文库的构建及基因组结构特征分析[D];中国海洋大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 宋来鹏;三疣梭子蟹基因组串联重复序列分析及微卫星标记的初步筛选[D];中国海洋大学;2008年
2 惠敏;扇贝微卫星标记的筛选及其在物种鉴定中的应用[D];中国海洋大学;2008年
3 逄巧巧;采用SSR和AFLP标记技术对龙须菜的遗传多样性分析[D];中国海洋大学;2009年
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王永川,李刚,潘国瑛,黄良民;广东紫菜和坛紫菜温度适应性的比较研究[J];水产学报;1982年04期
2 刘必谦,曾庆国,骆其君,杨锐,王亚军;坛紫菜体细胞单克隆叶状体途径及海上养殖[J];水产学报;2004年04期
3 江雨,黄秋,李勇斌,左正宏,王诚,陈奕欣;坛紫菜(Porphyra haitanensis)叶状体细胞对4种有机溶剂的敏感性比较[J];厦门大学学报(自然科学版);2005年03期
4 王育新;坛紫菜移动养殖产量翻番[J];水产养殖;1995年04期
5 游克仁;坛紫菜体细胞工程选育技术[J];福建农业;2001年12期
6 黄春恺;坛紫菜养殖海区采苗时间的正确选择[J];海洋渔业;2002年03期
7 陈昌生,纪德华,叶红莲,郑伟刚,黄世玉;坛紫菜自由丝状体的γ射线辐照及培养的研究[J];台湾海峡;2005年02期
8 王素娟,严兴洪;坛紫菜体细胞培养中类单孢子的观察[J];海洋与湖沼;1990年02期
9 骆其君,龚小敏;潮间带坛紫菜的半浮动筏式育苗试验[J];水产科学;2004年10期
10 蔡继晗;陈高峰;吕永林;丁雪燕;李凯;余海;蔡乘成;;申福二号等7个坛紫菜养殖群体的生长性能分析[J];水产养殖;2011年08期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 陈海敏;严小军;王秀娟;朱竹君;;坛紫菜的免疫防御方式研究[A];中国藻类学会第八次会员代表大会暨第十六次学术讨论会论文摘要集[C];2011年
2 陈昌生;谢潮添;纪德华;徐燕;史修周;梁艳;张元;周巍巍;赵玲敏;;坛紫菜新品系选育的研究[A];庆祝中国藻类学会成立30周年暨第十五次学术讨论会摘要集[C];2009年
3 张源;严兴洪;;坛紫菜(Porphyra haitanensis)减数分裂中等位基因异常分离的初步分析[A];中国藻类学会第八次会员代表大会暨第十六次学术讨论会论文摘要集[C];2011年
4 孙彬;黄健;马家海;宋武林;谢程亮;;坛紫菜品质分析[A];中国海洋湖沼学会藻类学分会第七届会员大会暨第十四次学术讨论会论文摘要集[C];2007年
5 陈伟洲;郭翠;宋志民;吴文婷;金玉林;;不同浓度铜离子对坛紫菜两种形态丝状体的生理生态影响[A];中国藻类学会第八次会员代表大会暨第十六次学术讨论会论文摘要集[C];2011年
6 黄林彬;严兴洪;;坛紫菜叶状体红烂病病原菌毒素的特性与诱导实验[A];中国藻类学会第八次会员代表大会暨第十六次学术讨论会论文摘要集[C];2011年
7 李家富;张涛;陆勤勤;朱建一;许璞;刘兆普;王长海;;坛紫菜叶状体营养细胞与生殖细胞叶绿素荧光特性比较[A];中国藻类学会第八次会员代表大会暨第十六次学术讨论会论文摘要集[C];2011年
8 徐燕;谢潮添;陈吕生;纪德华;高亚辉;;坛紫菜(Porphyra haitanensis)遗传连锁图谱的构建[A];2010年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2011年
9 姜红霞;高坤山;;坛紫菜对阳光紫外辐射的生理生态学响应[A];中国海洋湖沼学会藻类学分会第七届会员大会暨第十四次学术讨论会论文摘要集[C];2007年
10 周宸;林克冰;何丽斌;林琪;吴建绍;叶金聪;方琼珊;;坛紫菜叶状体病烂的病理学初步研究[A];第三届全国现代生态渔业管理与技术研究[C];2011年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 见习记者 陈小妹;我市坛紫菜养殖出现大面积烂苗现象[N];闽东日报;2008年
2 许金练;厦门南方坛紫菜种质库建设获肯定[N];中国渔业报;2009年
3 彭张记 袁华 袁群生;条斑紫菜与坛紫菜二茬养殖技术[N];中国渔业报;2006年
4 记者 黄元章;采取五项措施应对坛紫菜烂苗[N];闽东日报;2008年
5 李玉燕 剑锋 姜艳红;五颜六色的紫菜有望明年上市[N];农民日报;2006年
6 黄俊加;浅海坛紫菜浮筏式养殖新模式[N];福建科技报;2006年
7 本报记者 吴洪王永珍 通讯员 庄丽萍 陈舒平;转型转出新天地[N];福建日报;2008年
8 王忠民;紫菜升降式养殖技术(二)[N];福建科技报;2006年
9 王忠民;紫菜升降式养殖技术[N];中国渔业报;2006年
10 王忠民;紫菜升降式养殖技术(一)[N];福建科技报;2006年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 王莉;坛紫菜响应失水胁迫的转录组和表达谱特征分析[D];中国海洋大学;2013年
2 姜红霞;坛紫菜对阳光紫外辐射的生理生态学响应[D];汕头大学;2007年
3 方永军;基于EST的超高产橡胶树胶乳基因表达谱分析及其高产机理探讨以及坛紫菜丝状孢子体基因表达分析[D];浙江大学;2008年
4 王悠;海带对高温胁迫的生理生化响应和耐高温机理的初步研究[D];中国海洋大学;2003年
5 王娟;紫菜减数分裂与单性生殖的研究[D];中国海洋大学;2006年
6 赵扬;坛紫菜转鲎素基因研究[D];厦门大学;2005年
7 连姗姗;栉孔扇贝(Chlamys farreri)能量代谢与抗氧化胁迫能力评价指标体系的构建[D];中国海洋大学;2013年
8 梅俊学;紫菜叶状体无性繁殖的研究[D];中国科学院海洋研究所;2000年
9 杨惠;条斑紫菜功能基因组及重复序列特征研究[D];中国海洋大学;2011年
10 付峰;龙须菜紫外诱变育种及抗逆速生优良品系的选育[D];中国海洋大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 张元;坛紫菜对高温胁迫应答机制的初步研究[D];集美大学;2011年
2 何文君;高温胁迫对条斑紫菜丝状体生理影响及Hsp70基因的克隆和表达[D];辽宁师范大学;2009年
3 周巍巍;坛紫菜对低氮磷胁迫应答机制的初步研究[D];集美大学;2011年
4 史修周;坛紫菜品质测定条件的优化及新品系品质分析[D];集美大学;2010年
5 梁艳;坛紫菜新品系纯系主要经济性状的研究及DNA序列分析[D];集美大学;2009年
6 宋武林;坛紫菜新品系规模化培育与应用技术研究[D];南京农业大学;2009年
7 王莉;坛紫菜生长发育的细胞学观察以及纯合品系的建立[D];中国海洋大学;2010年
8 王凤霞;坛紫菜杂交、单色体选育及超微结构的观察[D];集美大学;2009年
9 侯同玉;坛紫菜新品系的选育与特性分析[D];上海海洋大学;2012年
10 郇丽;龙须菜性别相关分子标记的筛选与坛紫菜碳酸酐酶的表达分析[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2012年
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