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《农业生物技术学报》 2019年01期
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杉木木材形成功能基因内SSR标记的开发及应用

杭芸  俞金健  周世水  程健弘  黄华宏  林二培  童再康  
【摘要】:开发一套基于杉木(Cunninghamia lanceolata)木材形成相关功能基因的SSR标记,可为后续木材材质性状的分子标记辅助育种提供重要工具。本研究对参与杉木木材形成的10个基因序列进行SSR位点和引物设计,应用毛细管电泳检测引物的有效性和多态性,使用TAASEL(trait analysis by association,evolution and linkage)软件进行SSR位点组合间连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)及其与木材密度的关联分析。在与木材形成相关的7个功能基因中共检测到15个SSR位点。碱基重复形式有二碱基、三碱基、四碱基与六碱基,其中三碱基重复位点所占比例为46.7%。依据SSR位点两侧的保守序列设计了14对PCR扩增引物,其中有7对引物的扩增结果呈现多态性。结合已有的表达序列标签(expressed sequence tag, EST)-SSR数据进行LD分析,检测到644个SSR位点组合皆存在一定程度的LD(D'≠0),其中D'值大于0.5的组合有183个。关联分析发现来自杉木纤维素合成酶基因(C. lanceolata cellulose synthase 3,ClCesA3) 5'非翻译区(5'untranslated region, 5'UTR)的CLSSR4位点与杉木木材密度极显著关联(P0.01),该位点对性状变异的解释率为26.07%,且相应等位变异A201和A205对木材密度分别表现为增效和减效效应。本研究共设计筛选出了7对功能基因SSR多态性引物,其中来源于ClCesA3基因5'UTR的SSR位点与杉木木材密度显著关联,为分子标记辅助杉木木材性状改良提供了重要的标记和途径。

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【参考文献】
中国期刊全文数据库 前5条
1 文亚峰;韩文军;周宏;徐刚标;;杉木转录组SSR挖掘及EST-SSR标记规模化开发[J];林业科学;2015年11期
2 张圣;黄华宏;林二培;童再康;;杉木与台湾杉EST-SSR标记的开发与应用[J];林业科学;2013年10期
3 黄海燕;杜红岩;乌云塔娜;刘攀峰;;基于杜仲转录组序列的SSR分子标记的开发[J];林业科学;2013年05期
4 王保垒;王博文;陈清清;李百炼;张德强;;杨树抗逆转录因子基因内SSR标记的开发[J];林业科学;2011年08期
5 文自翔;赵团结;郑永战;刘顺湖;王春娥;王芳;盖钧镒;;中国栽培和野生大豆农艺及品质性状与SSR标记的关联分析Ⅱ.优异等位变异的发掘[J];作物学报;2008年08期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 杨加银;徐海风;程保山;;3个大豆品种及其骨干亲本的亲缘关系和指纹图谱分析[J];中国农学通报;2015年36期
2 郑婷婷;魏伟淋;杨向晖;林顺权;;基于枇杷转录组序列的SSR分子标记引物开发[J];亚热带植物科学;2015年04期
3 赵国淼;曾燕如;黄有军;李娟;贾宁;徐亚楠;唐研耀;;基于种子发育过程RNA-Seq的山核桃SSR位点分析[J];分子植物育种;2015年11期
4 符亚茹;李少珂;姚卫杰;李慧娥;;西藏砂生槐EST-SSR引物开发及多态性检测[J];江苏农业科学;2015年11期
5 邓德力;王斌;曾长英;郭鑫;彭明;;木薯干旱胁迫响应基因MeGSTU7自然变异分析[J];热带作物学报;2015年11期
6 文亚峰;韩文军;周宏;徐刚标;;杉木转录组SSR挖掘及EST-SSR标记规模化开发[J];林业科学;2015年11期
7 糜亚男;张水寒;蔡媛;梁雪娟;蒋超;秦优;;杜仲SSR标记的遗传多态性及其亲缘关系分析[J];时珍国医国药;2015年10期
8 蔡年辉;许玉兰;徐杨;邓丽丽;周丽;王大玮;何承忠;段安安;;云南松转录组SSR的分布及其序列特征[J];云南大学学报(自然科学版);2015年05期
9 黄琼林;何瑞;詹若挺;陈蔚文;;南药青天葵转录组SSR位点信息分析[J];北方园艺;2015年12期
10 李满堂;张仕林;邓鹏;侯喜林;王建军;;洋葱转录组SSR信息分析及其多态性研究[J];园艺学报;2015年06期
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 徐阳;陈金慧;李亚;洪舟;王颖;赵亚琦;王新民;施季森;;杉木EST-SSR与基因组SSR引物开发[J];南京林业大学学报(自然科学版);2014年01期
2 张圣;黄华宏;林二培;童再康;;杉木与台湾杉EST-SSR标记的开发与应用[J];林业科学;2013年10期
3 王为;王长彪;刘方;陈浩东;王琳;王春英;张香娣;王玉红;王坤波;;棉花非冗余性EST-SSR新标记的开发及其评价[J];作物学报;2012年08期
4 杨秀艳;孙晓梅;张守攻;谢允慧;韩华;;日本落叶松EST-SSR标记开发及二代优树遗传多样性分析[J];林业科学;2011年11期
5 杨华;陈琪;韦朝领;史成颖;方从兵;宛晓春;;茶树转录组中SSR位点的信息分析[J];安徽农业大学学报;2011年06期
6 孙清明;马文朝;马帅鹏;赵俊生;白丽军;陈洁珍;蔡长河;向旭;欧良喜;;荔枝EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发[J];中国农业科学;2011年19期
7 程晓凤;黄福江;刘明典;汪登强;;454测序技术开发微卫星标记的研究进展[J];生物技术通报;2011年08期
8 齐建勋;郝艳宾;朱艳;吴春林;王维霞;冷平;;核桃属种质资源的EST-SSR标记研究[J];园艺学报;2011年03期
9 周炎花;乔小燕;马春雷;乔婷婷;金基强;姚明哲;陈亮;;广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析[J];林业科学;2011年03期
10 程小毛;黄晓霞;;SSR标记开发及其在植物中的应用[J];中国农学通报;2011年05期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 杭芸;俞金健;周世水;程健弘;黄华宏;林二培;童再康;;杉木木材形成功能基因内SSR标记的开发及应用[J];农业生物技术学报;2019年01期
2 韩华;;杉木种植管理技术及应用实践阐释[J];绿色科技;2018年13期
3 刘岩友;;论杉木造林的主要环节技术[J];中国战略新兴产业;2018年44期
4 黎耀明;;岑溪市种植融水杉木管理技术与效益[J];农业与技术;2016年21期
5 徐敏;马青;王天龙;;我国速生杉木的改性研究进展[J];包装工程;2017年01期
6 平涛有;;富宁县人工杉木抚育技术及措施探讨[J];绿色科技;2016年23期
7 陈振生;马宏伦;陆素君;陈家平;冯光秒;韦海;;叶面施肥对杉木苗期生长的影响研究[J];湖北林业科技;2016年06期
8 林小琴;马志慧;何宗明;陈宇;彭亦如;林思祖;;杉木种子多酚提取工艺优化[J];森林与环境学报;2017年01期
9 ;国家重点研发计划“杉木高效培育技术研究”项目课题三“不同产区杉木高值化装饰材培育技术研究”简介[J];中南林业科技大学学报;2017年02期
10 朱贵华;;师宗县速生杉木的种植与管理[J];绿色科技;2017年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 杨国华;曾志光;黄晓春;;杉木良种繁育途径和方法的研究[A];全国林木遗传育种第五次学术报告会论文汇编[C];1986年
2 全国杉木种源试验协作组;;杉木种源分布区划分的研究[A];全国林木遗传育种第五次学术报告会论文汇编[C];1986年
3 曾志光;江香梅;;杉木选优挖兜移栽促萌试验研究[A];面向21世纪的中国林木遗传育种——中国林学会林木遗传育种第四届年会文集[C];1997年
4 郑仁华;林捷;曾粼祥;林心和;吕超爱;;老杉木基因资源保存及遗传品质研究[A];持续发展,再创辉煌——中国林学会林木遗传育种分会第五届年会文集[C];2002年
5 李恭学;陈益泰;;杉木无性系层次选育试验研究[A];中国林木遗传育种进展[C];1991年
6 樊程芳;杨明;王正富;赵权;甘绍瑊;吴茂良;熊名湜;曹德芳;;γ射线、微波和激光处理杉木种子的试验(摘要)[A];第五次核物理会议资料汇编(上册)[C];1982年
7 杨木;;杉木叶形遗传实验初报[A];全国林木遗传育种第五次学术报告会论文汇编[C];1986年
8 袁佳;刘元;李贤军;;高温炭化热处理对杉木材色的影响规律[A];第二届中国林业学术大会——S11 木材及生物质资源高效增值利用与木材安全论文集[C];2009年
9 雷布先;;融江流域杉木良种系统选择研究[A];林木遗传改良讨论会文集(杉木、马尾松等树种)[C];1991年
10 阮梓材;;杉木子代基因型X环境互作和稳定性的研究[A];林木遗传改良讨论会文集(杉木、马尾松等树种)[C];1991年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 叶代全;功勋不凡,四代杉木良种造福山林[N];中国绿色时报;2015年
2 胡定林;会东县建成我州最大杉木采种基地[N];凉山日报(汉);2010年
3 记者  谌贻照;“杉木王国”的革命[N];广西日报;2006年
4 本报记者 陈江 本报通讯员 覃聪颖;科技破瓶颈 杉木变大材[N];广西日报;2015年
5 本报记者 谌贻照;把杉木资源效益发挥到极致[N];广西日报;2012年
6 国家林业局国有林场和林木种苗工作总站;中国杉木育种的摇篮[N];中国绿色时报;2010年
7 记者 李仲宏;汶川20万亩杉木“造”钱4.4亿元[N];阿坝日报;2006年
8 本报记者 刘辉 通讯员 林峥嵘;这里有中国最大的“杉木种子基因库”[N];福建日报;2013年
9 冯达皓;顺昌优质杉木品种投入产业化生产[N];闽北日报;2008年
10 王建兰 尹维纳;杉木遗传改良及定向培育技术研究[N];中国绿色时报;2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 陈卫军;湘中丘陵杉木二代人工林生长及林地特征研究[D];中南林业科技大学;2013年
2 杨超;杉木人工林生态系统长期生产力的定位研究[D];中南林业科技大学;2011年
3 杨丽;毛竹镁原卟啉甲酯环化酶基因研究及SSR标记开发应用[D];中国林业科学研究院;2014年
4 刘贯水;毛竹SSR位点引物开发及部分竹种系统学分析[D];中国林业科学研究院;2010年
5 康海军;气候变化条件下杉木人工林适应性经营研究[D];福建农林大学;2016年
6 付尧;杉木人工林生态系统生物量及碳储量定量估测[D];北京林业大学;2016年
7 李昌荣;大花序桉生长和材性遗传变异及SSR关联分析[D];中国林业科学研究院;2017年
8 李霞;杉木分枝发育关键基因的克隆与功能鉴定[D];南京林业大学;2010年
9 贯春雨;日本落叶松×兴安落叶松RAPD、SSR遗传图谱构建与QTL定位[D];东北林业大学;2010年
10 洪舟;杉木杂种优势分子机理初探[D];南京林业大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 牛宁;优良杉木半同胞家系配方施肥与营养诊断研究[D];福建农林大学;2013年
2 陈细贞;全国“杉木王”种质资源调查及其遗传多样性分析[D];福建农林大学;2012年
3 黄木生;福建杉木王种质资源的调查及其遗传多样性分析[D];福建农林大学;2010年
4 彭珠清;闽台杉木种质资源亲缘关系的比较研究[D];福建农林大学;2013年
5 贾东宇;高温热处理对杉木声学性能的影响[D];北京林业大学;2010年
6 郝杰;几种离子束注入杉木的诱变效果比较研究[D];福建农林大学;2014年
7 张莉莉;铝、镁、钙复合作用对杉木幼苗生理生化特征的影响[D];福建农林大学;2014年
8 周道骏;不同铁、镁浓度处理对杉木幼苗生理特性的影响[D];福建农林大学;2015年
9 刘桌明;杉木针叶养分含量动态及其内吸收率研究[D];福建农林大学;2014年
10 刘海鹰;西南地区杉木优良无性系快速繁殖技术研究[D];四川农业大学;2013年
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