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《自动化学报》 2008年02期
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基因表达数据的聚类分析研究进展

岳峰  孙亮  王宽全  王永吉  左旺孟  
【摘要】:基因表达数据的爆炸性增长迫切需求自动、有效的数据分析工具.目前聚类分析己成为分析基因表达数据获取生物学信息的有力工具.为了更好地挖掘基因表达数据,近年来提出了许多改进的传统聚类算法和新聚类算法.本文首先简单介绍了基因表达数据的获取和表示,之后系统地介绍了近年来应用在基因表达数据分析中的聚类算法.根据聚类目标的不同将算法分为基于基因的聚类、基于样本的聚类和两路聚类,并对每类算法介绍了其生物学的含义及其难点,详细讨论了各种算法的基本原理及优缺点.最后总结了当前的基因表达数据的聚类分析方法,并对发展趋势作了进一步的展望.

【参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 于剑;论模糊C均值算法的模糊指标[J];计算机学报;2003年08期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前5条
1 李翠霞,于剑;一种模糊聚类算法归类的研究[J];北京交通大学学报;2005年02期
2 雷景生;马军;靳婷;;基于分级神经网络的Web文档模糊聚类技术[J];计算机研究与发展;2006年10期
3 徐艺萍;邓辉文;李阳旭;;一种改进的ART2网络学习算法[J];计算机应用;2006年03期
4 张敏,于剑;基于划分的模糊聚类算法[J];软件学报;2004年06期
5 王璐;蔡自兴;;改进的快速FCM算法[J];小型微型计算机系统;2005年10期
中国博士学位论文全文数据库 前5条
1 刘仁金;基于商空间的纹理图象分割研究[D];安徽大学;2005年
2 杨小兵;聚类分析中若干关键技术的研究[D];浙江大学;2005年
3 王璐;未知环境中移动机器人视觉环境建模与定位研究[D];中南大学;2007年
4 刘蓉;基于聚类算法的多属性复杂大群体决策方法研究[D];中南大学;2006年
5 尚文倩;文本分类及其相关技术研究[D];北京交通大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 叶海军;模糊聚类分析技术及其应用研究[D];合肥工业大学;2006年
2 吴文;长三角遥感水质分类技术研究[D];南京理工大学;2006年
3 闫兆振;自适应模糊C-均值聚类算法研究[D];山东科技大学;2006年
4 司瑾;多输入模糊推理与多目标模糊决策算法研究[D];长春理工大学;2007年
5 王兴双;数据挖掘在人力资源管理中的应用[D];长春理工大学;2007年
6 陈松生;基于模糊聚类的非监督学习研究[D];南京师范大学;2007年
7 刘小龙;模糊推理算法研究[D];西北大学;2006年
8 钟平;数据挖掘在火力发电厂中的应用研究[D];国防科学技术大学;2006年
9 王文平;聚类分析及其在图像分割中的应用[D];山东师范大学;2007年
10 侯宪龙;基于聚类算法的模糊控制器设计[D];江苏大学;2007年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前7条
1 吴正龙,王儒敬,滕明贵,许梅生;基于蚁群算法的分类规则挖掘算法[J];计算机工程与应用;2004年20期
2 杨燕,靳蕃,Mohamed Kamel;一种基于蚁群算法的聚类组合方法[J];铁道学报;2004年04期
3 张惟皎,刘春煌,尹晓峰;蚁群算法在数据挖掘中的应用研究[J];计算机工程与应用;2004年28期
4 梁栋,霍红卫;自适应蚁群算法在序列比对中的应用[J];计算机仿真;2005年01期
5 张航,罗熊;蚁群优化算法的研究现状及研究展望[J];信息与控制;2004年03期
6 姜长元;蚁群算法的理论及其应用[J];计算机时代;2004年06期
7 段海滨,王道波,朱家强,黄向华;蚁群算法理论及应用研究的进展[J];控制与决策;2004年12期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 忻斌健;吴启迪;;蚁群算法的研究现状及其应用[A];2001中国控制与决策学术年会论文集[C];2001年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 高新波,谢维信;模糊聚类理论发展及应用的研究进展[J];科学通报;1999年21期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 江虎军,杨新泉,冯锋,杜生明,王钦南,夏家辉;DNA芯片技术及其应用[J];中国科学基金;2000年06期
2 黄智伟,黄琛;微电子与生物技术融合的芯片技术[J];世界电子元器件;2000年11期
3 余志文,于军,徐静平,周文利;基因芯片中点阵的微电子加工技术[J];微电子学;2001年02期
4 朱疆,黄国亮,高峻雄,张旭,于军;DNA微阵列图象信息的自动提取[J];计算机工程与应用;2004年07期
5 张广治,何洁月;生物数据网格的应用研究[J];计算机工程;2004年02期
6 宫改云,毛用才,高新波,刘三阳;基于模糊c-均值聚类的微阵列基因表达数据分析[J];西安电子科技大学学报;2004年02期
7 贺宪民,贺佳;基因芯片数据的标准化及分析方法[J];中国卫生统计;2004年02期
8 ;改变世界的五位科技创新者[J];甘肃科技纵横;2004年03期
9 吴骋,贺佳,王志勇;基于LibSVMs软件的基因表达数据处理[J];中国卫生统计;2004年04期
10 李颖新,刘全金,阮晓钢;一种肿瘤基因表达数据的知识提取方法[J];电子学报;2004年09期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 韩玲;李雨;陈杞;;应用DNA芯片技术结合核技术对辐射致癌分子机理的研究[A];2000上海科技论坛BIO-X研讨会暨中德医学生物物理和上海流变学研讨会论文集[C];2000年
2 张坚;荆高山;许俊泉;周玉祥;程京;;利用微泵和微阀构建的用于细胞分离的流体系统[A];中国生物工程学会第三次全国会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集[C];2001年
3 蔡文廷;陈光伟;林昭庚;张永贤;徐松锟;;DNA微阵列分析桂附八味丸和六味地黄丸培养肾细胞株基因表达之不同[A];第二次世界中西医结合大会论文摘要集[C];2002年
4 杨忠;曾志雄;蔡文琴;杨梦苏;;DNA微阵列比较不同分化程度及维甲酸处理前后的星形胶质瘤细胞株研究胶质瘤进展相关基因[A];解剖学杂志——中国解剖学会2002年年会文摘汇编[C];2002年
5 俞作仁;关纪奎;葛晔华;马静;郭睿;李赛;薛社普;韩代书;;小鼠精子发生不同阶段生精细胞的基因表达谱-精子细胞变态相关基因的研究[A];解剖学杂志——中国解剖学会2002年年会文摘汇编[C];2002年
6 刘丽玲;王秀荣;陈化兰;;基因芯片的研究进展[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会成立20周年庆典暨第十次学术研讨会论文集(上)[C];2003年
7 程璐;高璐;朱蓓莉;陆祖宏;;用基因芯片检测结直肠癌患者的APC基因突变[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年
8 李岭;季星来;李妍;李春义;;生物信息学研究中临床数据解读方面可能存在的若干问题的探讨[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年
9 杨春梅;万柏坤;丁北生;;数据预处理和初始化方法对K-均值聚类的影响[A];中国仪器仪表学会第五届青年学术会议论文集[C];2003年
10 李鹏;阮晓钢;;一种预测多骨髓瘤的神经网络方法[A];第二十二届中国控制会议论文集(下)[C];2003年
中国重要报纸全文数据库 前8条
1 东娜;安捷伦推出第三套基因筛选微阵列试剂盒[N];科技日报;2002年
2 陆祖宏;生物信息技术及其在后基因组研究中的应用[N];科技日报;2002年
3 美国华人生物医药科技学会 刘镭;组织芯片技术研究进展[N];中国医学论坛报;2002年
4 新;基因表达受生物钟控制[N];医药经济报;2002年
5 香港麦迪信医学出版有限公司供稿;肿瘤干细胞将成治癌新靶点[N];医药经济报;2003年
6 本报记者 华凌;用生物芯片和病毒对抗食物中毒[N];科技日报;2005年
7 赵祥;美研发优质棉种筛选新技术[N];农民日报;2005年
8 魏衍亮;医药生物芯片市场硝烟正起[N];中国医药报;2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 齐弘炜;体外循环前后心肌及外周血单个核细胞细胞因子基因表达谱的初步研究[D];中国人民解放军军医进修学院;2003年
2 陆燕;基于混合线性模型和条件变量分析的DNA微阵列数据分析方法研究[D];浙江大学;2003年
3 李炯;电导检测型DNA微阵列系统的研制[D];东南大学;2003年
4 王洪敏;霍乱弧菌检测芯片的研制[D];第一军医大学;2004年
5 王明怡;微阵列数据挖掘技术的研究[D];浙江大学;2004年
6 连海;新城疫病毒HN基因与鸡贫血病毒VP3基因抗肿瘤作用及其信号传导机制[D];吉林大学;2006年
7 张焱;150天人胎脑海马基因表达信息的处理与分析[D];中国协和医科大学;2002年
8 郑春厚;独立分量分析算法及其应用研究[D];中国科学技术大学;2006年
9 杨锡南;基于基因芯片表达谱的癌症预后元分析方法研究[D];东南大学;2006年
10 杨春梅;基因表达数据聚类分析算法研究和应用[D];天津大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 刘月明;基因表达聚类分析方法研究[D];第三军医大学;2001年
2 杜文津;DNA微阵列技术对DMD基因缺失检测的基础与临床研究[D];第四军医大学;2002年
3 席卫文;DNA微阵列图像识别的相关技术与实现[D];中国人民解放军第一军医大学;2003年
4 张彦琦;基因调控网络建立的数学模型研究[D];第三军医大学;2003年
5 刘利平;基因模式的PICA获取及基于Boosting的模式分类[D];西安电子科技大学;2004年
6 张宏涛;抗痴呆化合物9714的比格犬长期毒性、伴随毒代动力学及毒理基因组学研究[D];吉林大学;2004年
7 李鹏;基于基因表达数据的肿瘤预测模型研究[D];北京工业大学;2004年
8 宫改云;FCM算法参数研究及其应用[D];西安电子科技大学;2004年
9 伍亚舟;基因芯片表达数据的标准化策略研究[D];第三军医大学;2004年
10 姬翔;基于SVM的多病类诊断基因选择方法研究[D];西安电子科技大学;2005年
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