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《科学通报》 2000年01期
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红树科6属cpDNA和nrDNA序列相对速率检验及分歧时间估计

钟扬  施苏华  唐先华  黄椰林  谈凤笑  张晓艳  
【摘要】:基于红树科6属 10种及外类群的 cpDNA matK基因和 rbcL基因序列以及 nrDNA ITS区序列,分别构建了分子系统发育树.对不同系统发育树中有关分支间的核苷酸序列置换速率进行了差异显著性检验.根据相对速率检验结果,结合现有分子进化资料,推算这些属间的首次分歧时间为 132.25 Ma前,分布于内陆的竹节树族(除竹节树外)与分布于海岸的红树族间的平均分歧时间为 64.13 Ma前,而陆生的大叶竹节树和旁札木间的平均分歧时间为 19.92 Ma前。
【作者单位】中国科学院武汉植物研究所!武汉430074 中山大学生命科学学院!广州510275 中国科学院武汉植物研究所!武汉430074 中山大学生命科学学院!广州510275 中山大学生命科学学院!广州510275 中国科学院武汉植物研究所!武汉430074
【关键词】红树科 cpDNA nrDNA matK rbcL ITS相对速率检验 分歧时间
【基金】:国家杰出青年基金!(批准号:39825104) 国家自然科学基金!(批准号:39570052;39970057) 中国科学院留
【分类号】:Q949
【正文快照】:
红树科( RhizoPhoraceae)约有 16-18属 120余种,分布于热带、亚热带海岸和内陆l’,’],其中我国产 6属(含作为红树林主要成分的红树族 Rhizophoreae 4属及陆生的竹节材族LegllotidC。e 2属),共 13种 1变种[’

【引证文献】
中国期刊全文数据库 前5条
1 唐先华,赖旭龙,钟扬,李涛,杨淑娟;分子钟假说与化石记录[J];地学前缘;2002年02期
2 黄椰林,施苏华,谈凤笑,钟扬;一种从特殊植物材料中制备PCR模板的新方法[J];科学通报;2001年24期
3 李春香,陆树刚,杨群;耳蕨属(鳞毛蕨科)的亚洲起源:来自rbcL序列的证据[J];科学通报;2004年09期
4 郝家胜,李春香,孙晓燕,杨群;唇口目苔藓动物分子系统演化及其主要类群分歧时间的推测[J];科学通报;2005年12期
5 王庆彪;王莉;周仁超;赵晓敏;施苏华;杨永;钟扬;;用叶绿体和核糖体DNA序列探讨中国特有植物斑子麻黄的系统位置[J];科学通报;2006年01期
中国博士学位论文全文数据库 前4条
1 梁君荣;花尾胡椒鲷(Plectorhynchus cinctus)种质资源及其变异种的特异性分子标记研究[D];厦门大学;2002年
2 李金莲;中国蒙古马遗传多样性和分子系统进化研究[D];内蒙古农业大学;2006年
3 单家林;海南红树林植物区系与耐盐生物学研究[D];华南热带农业大学;2006年
4 王庆彪;裸子植物的分子系统发育及麻黄碱类化学成分的进化起源[D];复旦大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 孟冬梅;鸭科鸟类分子钟标定研究[D];四川农业大学;2004年
2 许崇梅;山东蓼族植物染色体和基于ITS序列探讨杠板归的系统位置的研究[D];山东师范大学;2004年
3 韩闯;木榄、海莲和尖瓣海莲种间亲和性和亲缘关系分析[D];厦门大学;2006年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 张弛,胡鸿钧,李中奎,李夜光,钟扬;衣藻属的系统发育分析——基于形态形状和nrDNA ITS序列[J];武汉植物学研究;2000年03期
2 王超,张宗申,王建波;植物多倍体起源与分子进化研究进展[J];武汉植物学研究;2000年04期
3 蔡联炳,王玉金;鹅观草属的系统发育分析[J];植物研究;2001年04期
4 肖中新,潘孝铭;分支系统学软件PHYLIP系统及其使用[J];安徽农业大学学报(自然科学版);2001年04期
5 张春英,戴思兰;我国观赏植物亲缘关系的研究现状[J];北京林业大学学报;1998年02期
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8 江世宏,卓晨雷;中国叩甲科昆虫12亚科的支序分类研究[J];华中农业大学学报;2001年04期
9 周昆叔;香港晚更新世晚期红树植物孢粉组合的发现[J];科学通报;1988年19期
10 张利,周永红,郑有良,张颖,刘世贵;仲彬草属6个物种的核型与进化研究[J];四川大学学报(自然科学版);2003年02期
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 倪穗;山茶属红山茶组植物系统学研究[D];南京林业大学;2007年
2 周涵韬;几种红树植物的遗传变异和抗盐特性的分子生态学研究[D];厦门大学;2001年
3 邓传远;几种红树植物的木材解剖学研究[D];厦门大学;2001年
4 杨冬之;茄科天仙子族:结构、分化和系统关系[D];中国科学院研究生院(植物研究所);2002年
5 杨瑞武;赖草属植物的系统与进化研究[D];四川农业大学;2003年
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7 张利;仲彬草属植物的细胞学和分子系统学研究[D];四川大学;2003年
8 张晓艳;睡莲类植物的系统发育研究[D];复旦大学;2003年
9 杨光伟;中国桑属(Morus L.)植物遗传结构及系统发育分析[D];西南农业大学;2003年
10 郑宏春;商陆属(商陆科)植物的结构、发育和系统学研究[D];西北大学;2004年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 姬凌云;欧盟国家城市节能技术类型研究[D];同济大学;2007年
2 贺晶;山茶属红山茶组植物RAPD分类研究[D];中南林学院;2001年
3 李敏;菝葜属草本菝葜组的系统进化研究[D];浙江大学;2001年
4 倪念春;国产葱属粗根组植物分子系统学研究[D];四川大学;2002年
5 郭宪光;中国鮡科鱼类分子系统发育和石爬鮡属物种有效性的研究[D];西南师范大学;2003年
6 张震;国产郁金香属的系统与区系学研究[D];新疆农业大学;2003年
7 唐荣华;重楼属植物的组织培养和分子系统学研究[D];四川大学;2003年
8 黄菲;叶甲科昆虫线粒体细胞色素b基因片段分子系统学研究[D];陕西师范大学;2004年
9 胡雅琴;基于rbcL、matK基因序列探讨松科系统进化的可能性及rbcL、matK基因SSCP分析[D];陕西师范大学;2004年
10 吕艳芳;利用ISSR分子标记和rDNA的ITS序列研究五针松亲缘关系[D];东北林业大学;2004年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 林鹏;;红树林的种类及其分布[J];林业科学;1987年04期
2 伍惠生,张德宁,马振波,甘诗麟,余仪;叉尾斗鱼一对相对性状单因子杂交试验[J];动物学杂志;1981年01期
3 龙良启,赵振山,汤保贵,熊帮喜;人工诱导泥鳅与大鳞副泥鳅雄核发育单倍体子代的RAPD分析[J];动物学杂志;2001年01期
4 汪永庆,王新国,徐来祥,张知彬;一种动物基因组DNA提取方法的改进[J];动物学杂志;2001年01期
5 耿德贵,王景明,江山,王芳;鱼类染色体显带的研究进展[J];动物学杂志;1999年01期
6 周玉,张俊辉,杨振国,朱世成,张凯,冯现维;温度和光照对神仙鱼胚胎发育的影响[J];水产科学;2001年03期
7 罗静,杨君兴,张亚平;鱼类多样性的遗传基础[J];动物学研究;2000年02期
8 王洪涛,顾为望,高丽丽;FMMU白化豚鼠DNA指纹图研究初报[J];第一军医大学学报;2001年02期
9 李学斌,李培庆,余小领,王清华;PCR SSCP技术及其在动物遗传变异研究中的应用[J];甘肃畜牧兽医;1999年06期
10 郑小东,王昭萍,王如才,于瑞海,孔令峰;双壳类动物染色体研究现状及进展[J];黄渤海海洋;2000年03期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 林栖凤;邓用川;黄薇;陈菊培;李冠一;;红树DNA导入茄子获得耐盐性后代的研究[A];中国生物化学与分子生物学会第八届会员代表大会暨全国学术会议论文摘要集[C];2001年
中国博士学位论文全文数据库 前5条
1 张红平;采用mtDNA序列研究中国家养山羊的遗传多样性与起源分化[D];四川农业大学;2003年
2 王继文;中国主要家鹅品种分子系统进化研究[D];四川农业大学;2003年
3 雷初朝;中国四个畜种(黄牛、水牛、牦牛、家驴)线粒体DNA遗传多样性研究[D];西北农林科技大学;2002年
4 赖松家;中国三个牛种遗传多样性和分子系统进化研究[D];四川农业大学;2004年
5 吴华;梅花鹿保护遗传学研究[D];浙江大学;2004年
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 孟冬梅;鸭科鸟类分子钟标定研究[D];四川农业大学;2004年
2 吕艳芳;利用ISSR分子标记和rDNA的ITS序列研究五针松亲缘关系[D];东北林业大学;2004年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前3条
1 易庆平;罗正荣;张青林;;植物总基因组DNA提取纯化方法综述[J];安徽农业科学;2007年25期
2 李宗菊,熊丽,桂敏,李金泽,刘小莉,刘飞虎;非洲菊基因组DNA提取及ISSR-PCR扩增模板浓度优化[J];云南植物研究;2004年04期
3 郝家胜,李春香,孙晓燕,杨群;唇口目苔藓动物分子系统演化及其主要类群分歧时间的推测[J];科学通报;2005年12期
中国博士学位论文全文数据库 前6条
1 李金莲;中国蒙古马遗传多样性和分子系统进化研究[D];内蒙古农业大学;2006年
2 史树德;石蒜属种间关系和杂交起源的研究[D];浙江大学;2005年
3 杨金权;鮈亚科鱼类分子系统发育、演化过程及生物地理学研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2005年
4 张青林;完全甜柿及部分雄性种质间的亲缘关系研究[D];华中农业大学;2006年
5 由继红;红松与濒危植物前红松的比较研究[D];东北师范大学;2004年
6 王莉;华南地胆草植物的居群遗传结构与精油成分变异分析[D];复旦大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 吴国盛;部分菊属与亚菊属植物亲缘关系研究[D];南京农业大学;2007年
2 颜勤;草鱼线粒体型超氧化物歧化酶的生化遗传特性的研究[D];湖南师范大学;2004年
3 向福;红豆杉的18S rRNA基因的分子进化研究[D];华中科技大学;2004年
4 赵志国;基于生物信息技术对部分禾本科植物系统分类研究[D];山西农业大学;2005年
5 薛华杰;基于ITS序列探讨东亚当归属的系统框架与法落海、紫花前胡等的系统地位[D];南京师范大学;2007年
6 郑凯迪;胭脂鱼胰蛋白酶原前体的cDNA克隆、序列分析及饲料对胰蛋白酶活性的影响[D];西南大学;2007年
7 李成梅;藓类植物羽藓科及其相关科属分子系统学研究[D];首都师范大学;2004年
8 许崇梅;山东蓼族植物染色体和基于ITS序列探讨杠板归的系统位置的研究[D];山东师范大学;2004年
9 车未艾;基于细胞核核糖体DNA内转录间隔区(ITS序列)探讨广义平藓科的系统发育关系[D];首都师范大学;2006年
10 易庆平;柿属植物DNA提取纯化检测技术体系的建立[D];华中农业大学;2006年
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 吴汝康;人类起源的新认识(结合介绍1980年7月佛罗伦萨讨论会)[J];自然杂志;1982年03期
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3 ;DNA限制酶切位点的似近分析及猕猴属五个种间进化关系初探[J];动物分类学报;1999年04期
4 吴平,程安进,杨群,周开亚;线粒体DNA在龟鳖目中的进化速率与古生物分化事件[J];自然科学进展;1999年12期
5 吴平,张克云,杨群;后生动物起源时间的分子钟研究[J];古生物学报;2000年03期
6 钟扬,施苏华,唐先华,黄椰林,谈凤笑,张晓艳;红树科6属cpDNA和nrDNA序列相对速率检验及分歧时间估计[J];科学通报;2000年01期
7 唐先华,赖旭龙,钟扬,李涛,杨淑娟;分子钟假说与化石记录[J];地学前缘;2002年02期
8 张原,张正旺,郑楠;雉科基部类群分子钟的标定[J];北京师范大学学报(自然科学版);2003年04期
9 施燕峰,单祥年,李健,张海军,郑爱玲;基于线粒体基因组探讨鲸偶蹄类七种动物的系统发育关系[J];动物学研究;2003年05期
10 吴孝兵,王义权,周开亚,朱伟铨,聂继山,王朝林;扬子鳄的线粒体全基因组与鳄类系统发生[J];科学通报;2003年18期
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1 禹娜;;淡水介形虫18S rRNA基因研究[A];甲壳动物学分会成立20周年暨刘瑞玉院士从事海洋科教工作55周年学术研讨会论文(摘要)集[C];2002年
2 周材权;周开亚;;鼢鼠亚科的分子进化速率和各种鼢鼠分歧的地质时间的估算[A];中国动物学会兽类学分会第六届会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集[C];2004年
3 李春香;陆树刚;杨群;;广义耳蕨属(鳞毛蕨科)的系统发育和起源[A];中国古生物学会第九届全国会员代表大会暨中国古生物学会第二十三次学术年会论文摘要集[C];2005年
4 郝家胜;杨群;;唇口目苔藓动物系统演化及其主要类群分歧时间的推测:基于16S rRNA基因的证据[A];中国古生物学会第九届全国会员代表大会暨中国古生物学会第二十三次学术年会论文摘要集[C];2005年
中国重要报纸全文数据库 前3条
1 张建松、杨育才;人和黑猩猩基因功能区域差异只有0.75%[N];光明日报;2003年
2 中国科学院院士 张亚平;家养动物的起源、进化与遗传多样性[N];光明日报;2004年
3 梅进;化石证据表明产卵哺乳动物进化速度慢[N];科学时报;2008年
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1 张传生;绵山羊不同性别的基因突变率及其系统进化的研究[D];山东农业大学;2002年
2 戴捷;藏狐(Vulpes ferrilata)系统发育研究[D];华东师范大学;2004年
3 孟冬梅;鸭科鸟类分子钟标定研究[D];四川农业大学;2004年
4 王江;原羚属及羚羊亚科属间系统发育关系研究[D];浙江大学;2004年
5 向福;红豆杉的18S rRNA基因的分子进化研究[D];华中科技大学;2004年
6 张原;分子系统学分析平台的建立和应用[D];中国科学院研究生院(植物研究所);2004年
7 蔡秀珍;芋属的分子系统学研究[D];湖南师范大学;2005年
8 牛黎明;21种雀形目鸟类细胞色素b基因序列分析及其系统发育研究[D];东北林业大学;2005年
9 国会艳;雀形目38种鸟类分子系统发育关系的初步研究[D];东北林业大学;2006年
10 唐晓嗣;系统发育树构建中的EM算法[D];暨南大学;2006年
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