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《计算机与应用化学》 2011年06期
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产甲烷常温菌和嗜热菌代谢网络特征的比较研究

陈璟  丁彦蕊  须文波  
【摘要】:以产甲烷的常温古细菌Methanosarcina acetivorans(MAC)和嗜热古细菌Methanopyrus kandleri(MKA)的代谢网络为研究对象,分析了网络的拓扑结构与功能之间的关联性。本文利用Networkx计算了代谢网络的度、度的中心性、紧密度中心性以及介数中心性等参数值,通过比较分析发现常温古细菌MAC和嗜热古细菌MKA存在氨基酸代谢以及碳水化合物代谢保守途径,且都具有明显更高的度。结果同时表明子途径00010(糖酵解/糖异生)、00020(柠檬酸循环)、00250(丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢)是常温古细菌MAC与嗜热古细菌MKA2个生物体的重要途径。

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【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 王文超;基于智能计算的微生物代谢网络与耐热性的关系研究[D];江南大学;2012年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
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【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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2 张万芹;康冀川;王开功;;产甲烷细菌保藏方法研究[J];安徽农业科学;2012年10期
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中国博士学位论文全文数据库 前10条
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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7 龚飞飞;冷季母牛舍空气中CH_4、CO_2和NH_3等气体浓度的变化及影响因素的研究[D];新疆农业大学;2011年
8 吴燕;半连续餐厨垃圾与猪粪混合厌氧消化性能及动力学研究[D];西南交通大学;2011年
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10 吕涛;厌氧滤池—人工湿地组合处理军队营区生活污水[D];西安建筑科技大学;2011年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 钱冠群;张林;张莉;;基于复杂网络的二阶段软件聚类方法[J];北京航空航天大学学报;2009年12期
2 佟琳琳;姜茂发;杨洪英;范有静;;锌离子对浸矿嗜热菌HQ0211生长控制的研究[J];东北大学学报(自然科学版);2007年04期
3 朱钥;李琦;;城市空间智能计算平台研究[J];地理与地理信息科学;2011年01期
4 殷铭,张兴华,戴先中;基于MATLAB的遗传算法实现[J];电子技术应用;2000年01期
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6 荣莉莉;郭天柱;王建伟;;复杂网络节点中心性[J];上海理工大学学报;2008年03期
7 何锋,马红武,赵学明,元英进,曾安平;生物信息学用于代谢网络研究的进展与展望[J];化工学报;2004年10期
8 贾嵘;张云;洪刚;;基于改进PSO的LSSVM参数优化在变压器故障诊断中的应用[J];电力系统保护与控制;2010年17期
9 曹阳;丁胄;;基于因子分析法的医药上市公司并购绩效评价[J];经济研究导刊;2011年27期
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中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 丁德武;苏云金芽胞杆菌代谢网络的重建与分析[D];江南大学;2008年
2 曹道友;基于改进遗传算法的应用研究[D];安徽大学;2010年
【相似文献】
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1 陈璟;丁彦蕊;须文波;;产甲烷常温古细菌和嗜热古细菌代谢网络拓扑结构与功能间的关联性研究[J];生命科学研究;2011年03期
2 李镇桐;第三型生命—古细菌[J];生物学教学;1994年02期
3 杨文翻;;古细菌在分子水平上更接近真核生物[J];生命世界;1987年03期
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6 林继红;陆德培;;古细菌(Archaebacteria)表面糖蛋白[J];生命的化学;1990年06期
7 Robert Pool;李大卫;;扩展生命的外围[J];世界科学;1991年06期
8 王冰,修志龙,唐焕文;基于复杂网络理论的代谢网络结构研究进展[J];中国生物工程杂志;2005年06期
9 黄立南,周惠,陈月琴,罗硕,蓝崇钰,屈良鹄;“传统”垃圾填埋场渗滤液中古细菌16S rRNA基因的RFLP分析[J];中山大学学报(自然科学版);2004年01期
10 倪水松;钱泽澍;;一株新的球状产甲烷菌的分离和特性[J];中国沼气;1989年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
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3 崔中利;王英;滕齐辉;张斌;曹慧;;淹水和旱作稻田土壤中产甲烷菌的多样性分异[A];第四次全国土壤生物和生物化学学术研讨会论文集[C];2007年
4 翁樑;张宏伟;王晓杰;王树民;滕冬梅;王智;冯雁;;超嗜热古细菌组蛋白工程菌的构建及表达的研究[A];科技、工程与经济社会协调发展——中国科协第五届青年学术年会论文集[C];2004年
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6 刘开朗;王加启;卜登攀;李旦;赵圣国;于萍;;瘤胃甲烷调控方法评述[A];中国奶业协会年会论文集2009(上册)[C];2009年
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10 卢冬梅;解桂秋;王智;丁天兵;冯雁;曹淑桂;;古细菌P.horikoshii无机焦磷酸酶的克隆、纯化以及酶学性质[A];中国生物化学与分子生物学会第八届会员代表大会暨全国学术会议论文摘要集[C];2001年
中国重要报纸全文数据库 前10条
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2 特约记者 刘泷 通讯员 武自然;4000年前的中心性祭祀遗址[N];内蒙古日报(汉);2000年
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5 胡科小;治中心性视网膜脉络膜炎方[N];民族医药报;2004年
6 记者 刘云涛;上海:代谢组学“联姻”中药研究结硕果[N];中国医药报;2006年
7 于丽珊;代谢组学与中医药研究受关注[N];中国中医药报;2006年
8 记者 杜舜 通讯员 蒋婷燕;“万种微生物计划协作组”深圳启动[N];南方日报;2009年
9 贾伟 刘平 王米渠;他山之石可以攻玉[N];中国医药报;2006年
10 上海复旦大学 附属中山医院眼科教授 王健瑚;双眼“中浆”该如何治疗[N];家庭医生报;2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
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2 彭佳扬;代谢网络中功能模块挖掘和进化分析研究[D];中南大学;2011年
3 周婷婷;基于代谢网络的系统发育重建方法研究[D];国防科学技术大学;2009年
4 赵建邦;基于代谢网络的功能模式发现及系统发生分析研究[D];西安电子科技大学;2011年
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6 裴彩霞;晋南牛和山羊瘤胃产甲烷菌多样性研究[D];南京农业大学;2008年
7 郝彤;基因组尺度人类代谢网络的亚细胞及组织定位[D];天津大学;2010年
8 王新峰;绞股蓝皂甙对山羊瘤胃菌群及微生物发酵特性和甲烷产量的影响[D];南京农业大学;2009年
9 肖栋;水和乳化液对煤层产甲烷菌群活性影响研究[D];中国矿业大学;2010年
10 赵静;细胞代谢网络的结构、功能与进化研究[D];上海交通大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 吕映辉;提高产甲烷菌活性的应用研究[D];山东轻工业学院;2007年
2 计博婧;代谢网络社团结构研究[D];南京邮电大学;2012年
3 余齐文;面向多细胞生物代谢网络重构系统的设计与应用研究[D];中国科学技术大学;2010年
4 齐存森;Klebsiella pneumoniae 342 基因组尺度代谢网络的构建与分析[D];大连理工大学;2011年
5 刘志强;基于多源数据融合的微生物代谢系统分析[D];中国科学技术大学;2011年
6 杨翠凤;猪后肠产甲烷菌群多样性及其与乙酸生成关系的研究[D];南京农业大学;2010年
7 王文超;基于智能计算的微生物代谢网络与耐热性的关系研究[D];江南大学;2012年
8 谢东强;COBRA模型上代谢调控约束的定量化研究[D];复旦大学;2012年
9 王英;代谢网络端通路计算方法的研究[D];复旦大学;2012年
10 高会艳;德氏乳杆菌基因组尺度代谢网络模型的构建与模拟计算[D];天津大学;2010年
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