胚胎附植期梅山猪EphrinA1全编码区克隆及生物信息学分析

【摘要】：为了研究促红细胞生成素产生肝细胞配体A1(Ephrin A1)对梅山猪胚胎附植期胚胎在子宫内膜间迁移和对子宫内膜黏附活动的影响,利用克隆测序、生物信息学和qRT-PCR方法,克隆了Ephrin A1基因的全长编码序列,对其表达的蛋白结构和功能进行了预测,并检测了其mRNA表达变化。梅山猪Ephrin A1基因编码区有5个c SNPs变异,其中2个导致氨基酸突变,分别为Glu29Asn和Trp33Arg,位于Ephrin A1外显子1和外显子2上。Ephrin A1编码序列中含5个外显子,编码205个氨基酸。Ephrin A1为不稳定的亲水性蛋白,有1个信号肽和一个保守区域,无跨膜区。另外,Ephrin A1在梅山猪胚胎附植期有较强的mRNA表达。表明Ephrin A1基因可能参与梅山猪的胚胎附植调控,其c SNPs有望成为影响猪产仔数基因的潜在分子标记。

【作者单位】：南京农业大学动物科技学院;江苏省农业科学院畜牧研究所/动物品种改良和繁育重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金项目(31201767) 江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(13)5042] 国家生猪现代产业技术体系南京综合试验站项目(nycytx-009) 江苏省科技支撑计划项目(BE2012333)
【分类号】：S865

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