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《计算机工程与应用》 2004年20期
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蛋白质结构预测方法的研究进展

殷志祥  
【摘要】:目前,在蛋白质结构预测方面,人们努力发展新的方法,该文主要介绍了蛋白质结构预测的方法和进展。详细地综述了几种方法,并简单地介绍了蛋白质结构预测的几个不同阶段,并提出了在蛋白质结构预测方面存在的一些困难。

【引证文献】
中国期刊全文数据库 前9条
1 王锋;;基于蛋白质二维HP晶格模型的ACO算法研究[J];电脑知识与技术;2010年35期
2 徐建华,朱家勇;生物信息学在蛋白质结构与功能预测中的应用[J];医学分子生物学杂志;2005年03期
3 王琦;冯二艳;王荣;任嘉红;;RACE法克隆甜菜NR基因及生物信息学分析[J];广西植物;2013年01期
4 张红亮;李立;;基于机器人机构学的蛋白质多肽链逆运动学研究[J];机械设计与制造;2010年03期
5 赵婷;姚雯轶;王立梅;;副干酪乳杆菌乳酸脱氢酶的生物信息学分析[J];食品科学;2011年17期
6 张红亮;李立;;基于总体最小二乘法的蛋白质肽链逆运动学拟合[J];中国生物化学与分子生物学报;2009年08期
7 孙侠;殷志祥;;蛋白质结构预测的理论方法及阶段[J];生物学杂志;2007年01期
8 陈永对;;生物信息学在基因组和蛋白质研究中的应用[J];中国临床康复;2006年41期
9 施卫萍;;生物信息学研究进展[J];安徽农学通报(下半月刊);2009年10期
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 孙鹏飞;基于计算智能技术的蛋白质结构预测方法研究[D];哈尔滨工程大学;2010年
2 成毅明;精子发生相关蛋白LM23的研究[D];北京协和医学院;2009年
3 孙静;协同刺激分子B7-H3两种异构体的基因演化及其生物学功能差异的研究[D];苏州大学;2011年
4 刘桂霞;蛋白质关联图预测研究[D];吉林大学;2007年
5 戴橄;日本血吸虫雌雄合抱相关蛋白的分离、鉴定及其DNA疫苗的研究[D];中南大学;2006年
6 白飞虎;多肽PIII拮抗胃癌腹膜侵袭转移作用的研究[D];第四军医大学;2007年
7 张超;冬小麦麸皮抗冻蛋白结构及其抗冻机理的研究[D];江南大学;2008年
8 陈矛;求解蛋白质折叠问题的拟物拟人算法[D];华中科技大学;2007年
9 吕淑敏;拟黑多刺蚁毒蕈碱型乙酰胆碱受体基因(mAchR)及抑瘤基因(QM)的克隆与表达研究[D];陕西师范大学;2008年
10 罗亮;蛋白质结构预测模型研究[D];华中科技大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 阎光甫;塔里木盆地放线菌网络数据库的建立[D];塔里木大学;2011年
2 于晓丽;蛋白质结构分类研究[D];华北电力大学(北京);2011年
3 熊丽东;红花转录组测序分析及其油体蛋白全长的获得[D];吉林农业大学;2011年
4 雷国庆;面向生物信息学结构预测领域的算法加速器设计[D];国防科学技术大学;2010年
5 徐丽华;鲤脑组织低温差异表达候选基因的筛选、cDNA全长克隆及功能预测[D];上海海洋大学;2011年
6 翁岸熹;BK通道三维结构模拟研究[D];华中科技大学;2011年
7 叶小娇;基于支持向量机的蛋白质二级结构预测编码方法研究[D];安徽师范大学;2011年
8 孙连海;α-淀粉酶结构与功能关系的研究[D];河南农业大学;2006年
9 姚婵;Reg4蛋白在结直肠肿瘤中的表达及其意义的研究[D];浙江大学;2006年
10 董梅;肌巨蛋白PEVK富含域的结构与功能研究[D];天津师范大学;2006年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前6条
1 许禄,胡昌玉;化学中的人工神经网络法[J];化学进展;2000年01期
2 邹承鲁;第二遗传密码[J];科学通报;2000年16期
3 倪红春,王翼飞,史定华;遗传算法在蛋白质结构预测中的应用[J];上海大学学报(自然科学版);2001年03期
4 ;21世纪的生命科学——邹承鲁教授访谈录[J];生物化学与生物物理进展;2000年01期
5 王志珍,邹承鲁;后基因组——蛋白质组研究[J];生物化学与生物物理学报;1998年06期
6 李晓琴,罗辽复;氨基酸组成聚类、蛋白质结构型和结构型的预测[J];生物物理学报;1998年04期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 孙帆,江珊;同步光软X射线显微术研究进展[J];安徽农业科学;2001年06期
2 王娟;王淑菊;孙伶;;遗传算法神经网络-光度法同时测定木耳中的铜和铁[J];安徽农业科学;2010年07期
3 徐丽;刘松财;张永亮;;蛋白质组学的研究进展[J];现代农业科技;2007年22期
4 何琴,高建华,刘伟;广义回归神经网络在烤烟内在质量分析中的应用[J];安徽农业大学学报;2005年03期
5 何琴,高建华,刘伟;概率神经网络在烤烟产地分类中的应用[J];安徽农业大学学报;2005年04期
6 杨正平;王聪;;蛋白质组学研究的新进展[J];安阳师范学院学报;2006年05期
7 张丽霞;张国强;陈瑞丽;;蛋白质组学研究的新进展[J];安阳工学院学报;2006年03期
8 蔡弘华;田德余;林振天;刘剑洪;洪伟良;;利用ANN法预估芳香族多硝基化合物的密度[J];火炸药学报;2007年03期
9 张海;王尧;陈冰;胡荣祖;高红旭;赵凤起;;用Boosting算法预测多硝基芳香族化合物的密度[J];火炸药学报;2007年05期
10 王伟,王硕仁,郭维琴;中药药理研究思路探微[J];中国医药学报;2000年03期
中国重要会议论文全文数据库 前4条
1 颜海燕;钟伯雄;沈飞英;陆云翀;;家蚕胚胎蛋白质双向电泳样品制备方法探讨[A];中国蚕学会第三届青年学术研讨会暨浙江省第二届青年学术论坛——蚕桑分论坛论文集(上册)[C];2001年
2 周鹏;商志才;;一种新的核序列自相关函数用于非同源蛋白质结构类预测[A];第十届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2009年
3 李杰芬;;功能基因组学与中医基础理论现代化[A];全国中西医结合基础理论学术研讨会论文集[C];2004年
4 吴超群;;蛋白质组学简介(Proteomics)[A];全国中西医结合血液病学术研讨会、浙江省中西医结合学会血液病专业委员会成立大会首次学术年会暨继续教育学习班论文汇编[C];2006年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 孙艳玲;猪卵泡囊肿的发病机理研究[D];吉林大学;2011年
2 于芳;应用蛋白质组学技术筛选神经母细胞瘤自行消退相关蛋白[D];中国人民解放军军医进修学院;2010年
3 成毅明;精子发生相关蛋白LM23的研究[D];北京协和医学院;2009年
4 龚佑静;小菜蛾对Bt毒素Cry1Ac抗性的生化与分子机理[D];南京农业大学;2010年
5 马军伟;基于机器学习方法的蛋白质亚细胞定位预测研究[D];大连理工大学;2011年
6 贾占奎;肾母细胞瘤血清标记物的筛选与鉴定[D];郑州大学;2012年
7 朱建国;日本血吸虫性别特异性基因克隆表达及其免疫保护功能研究[D];中国农业科学院;2001年
8 李许卿;双链DNA片断的碱基空间模式BSP[D];中国科学院云南天文台;2001年
9 朱海;健骨二仙丸防治骨质疏松症机理及蛋白质组研究[D];广州中医药大学;2002年
10 高永贵;溶菌酶和重组人干扰素-γ包涵体体外折叠复性的研究[D];浙江大学;2002年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 金宏;统计模拟肽及蛋白质的性质和活性[D];浙江大学;2010年
2 宋丽华;花生籽仁蛋白质含量近红外光谱模型的建立及育种应用[D];河北农业大学;2011年
3 于晓丽;蛋白质结构分类研究[D];华北电力大学(北京);2011年
4 王绍美;抗性不同的烤烟品种在胁迫条件下烟叶的差异蛋白质组学研究[D];中国农业科学院;2011年
5 陈富成;圆果黄麻不育类型鉴定及其蛋白质表达差异分析[D];福建农林大学;2011年
6 刘莎莎;基于功能化磁性介孔材料的肽组学分离分析新方法的研究[D];复旦大学;2011年
7 巩巧玲;药物小分子与血清白蛋白相互作用的光谱性质和分子模拟计算[D];温州大学;2011年
8 翁岸熹;BK通道三维结构模拟研究[D];华中科技大学;2011年
9 程学峰;酮类化合物的3D-QSPR研究[D];青海师范大学;2011年
10 王月;轮胎硫化温度场的有限元分析[D];东北大学;2009年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 孙琳琳;蒋继志;李丽;;生物信息学及在农作物抗性基因研究中的应用[J];安徽农学通报;2006年10期
2 朱贯泉,王重龙;仔猪断奶应激的影响因素及防制措施[J];安徽农业科学;2000年05期
3 黄啸;;生物信息学在蛋白质组学上的应用[J];安徽农业科学;2006年23期
4 王洪水;侯相山;;基因芯片技术研究进展[J];安徽农业科学;2007年08期
5 张桂荣;;玉米隐花色素基因cry2的电子克隆及生物信息学分析[J];安徽农业科学;2010年19期
6 汪明磊,李炜疆;脯氨酸顺式肽键的神经网络筛选[J];安徽农业大学学报;2003年04期
7 李志军,康建成;北极生长的多年海冰晶体结构分析[J];冰川冻土;2001年04期
8 朱建国,林矫矫,杨冠珍,倪振亚,陈兆国,吴祥甫,周元聪,蔡幼民;编码日本血吸虫抱雌沟蛋白及肌动蛋白的基因性别间的表达差异性[J];动物学报;2002年02期
9 李勇;丁雷;李言;侯宁;常玉梅;梁利群;雷清泉;;低温对鲤鱼的5个基因在不同组织中表达量的影响[J];动物学报;2008年03期
10 王涛,李伟生;最短路径子图[J];北方交通大学学报;2004年02期
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 王磊;免疫进化计算理论及应用[D];西安电子科技大学;2001年
2 靳利霞;蛋白质结构预测方法研究[D];大连理工大学;2002年
3 徐雪松;基于人工免疫系统的函数优化及其在复杂系统中的应用研究[D];浙江大学;2004年
4 王勇献;蛋白质二级结构预测的模型与方法研究[D];国防科学技术大学;2004年
5 孙勇智;人工免疫系统模型、算法及其应用研究[D];浙江大学;2005年
6 童庆;面向基因预测的信息处理方法研究[D];中国科学技术大学;2006年
7 李玉岗;生物大分子序列比对和蛋白质结构分类算法[D];中国科学院研究生院(计算技术研究所);2004年
8 杨燕;基于计算智能的聚类组合算法研究[D];西南交通大学;2006年
9 燕忠;基于蚁群优化算法的若干问题的研究[D];东南大学;2005年
10 张振慧;蛋白质分类问题的特征提取算法研究[D];国防科学技术大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王启贵;通过侯选基因法对影响鸡肉质性状基因的研究[D];东北农业大学;2001年
2 曹建华;猪分子生物学数据库的建立及其初步应用[D];华中农业大学;2003年
3 张海霞;蛋白质二级结构预测方法研究[D];大连理工大学;2004年
4 毛黎明;分布式并行处理与复杂网络在蛋白质折叠中的应用[D];武汉理工大学;2005年
5 陈晴;基于条件随机场的自动分词技术的研究[D];东北大学;2005年
6 刘玉明;家蚕EST分析系统的构建及初步分析[D];浙江大学;2005年
7 陈孝卫;数据挖掘技术在蛋白质二级结构预测中的应用研究[D];暨南大学;2005年
8 贺丽清;促性腺激素对拟黑多刺蚁品级分化及性腺发育作用研究[D];陕西师范大学;2006年
9 梁刚锋;蛋白质二级结构的建模与预测[D];国防科学技术大学;2005年
10 刘月兰;生物信息学数据库的设计与实现[D];黑龙江大学;2005年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 繁萍;张瑞强;张卫;丰琳琅;陈忍霞;赵静;;PmC47-8株OmpH蛋白结构的初步预测[J];安徽农业科学;2012年16期
2 徐建华;朱家勇;金小宝;许琴英;张秀明;庄俊华;马艳;王艳;;多聚组氨酸标签的Attacin抗菌肽基因克隆及其在CHO细胞中稳定表达[J];广东医学;2007年12期
3 徐建华;朱家勇;庄俊华;张秀明;;基于Internet的生物信息资源快速查找与利用[J];广东药学院学报;2006年02期
4 徐建华;朱家勇;金小宝;许琴英;;家蝇幼虫抗菌肽Attacin基因的克隆表达及抑菌生物学活性(英文)[J];医学分子生物学杂志;2007年01期
5 张睿;黄晋英;张永梅;;计算智能方法及应用研究[J];电脑开发与应用;2012年10期
6 王琦;冯二艳;王荣;任嘉红;;RACE法克隆甜菜NR基因及生物信息学分析[J];广西植物;2013年01期
7 裴杰;阎萍;冯瑞林;梁春年;郭宪;曾玉峰;包鹏甲;朱新书;褚敏;;新疆巴州牦牛Lfcin基因的克隆与分子特征[J];华北农学报;2009年05期
8 繁萍;张瑞强;张卫;丰琳琅;陈忍霞;赵静;;PmC47-8株OmpH蛋白结构的初步预测(英文)[J];Agricultural Science & Technology;2012年06期
9 张毅;梅挺;;基于加权决策树的蛋白质序列分类算法研究[J];计算机与数字工程;2012年05期
10 刘君;熊忠阳;王银辉;;蛋白质二级结构的协同训练预测方法[J];计算机应用研究;2011年05期
中国重要会议论文全文数据库 前2条
1 屠云洁;苏一军;张学余;李国辉;;鸡MHC B-G座位克隆与生物信息学分析[A];安全优质的家禽生产——第十五次全国家禽学术讨论会论文集[C];2011年
2 杨长平;;生物信息学在畜禽基因组研究中的应用[A];中国农业信息科技创新与学科发展大会论文汇编[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 孙鹏飞;基于计算智能技术的蛋白质结构预测方法研究[D];哈尔滨工程大学;2010年
2 张妙霞;野生香蕉(Musa spp., AB group)抗寒相关基因的克隆与表达分析[D];福建农林大学;2010年
3 郭新军;拟黑多刺蚁肌细胞增强因子2与肌钙蛋白Ⅰ亚基基因的克隆及其在发育中的表达研究[D];陕西师范大学;2010年
4 丁阳平;小檗碱衍生物设计、合成及生理活性研究[D];西南大学;2011年
5 夏飞;生物序列分析算法硬件加速器关键技术研究[D];国防科学技术大学;2011年
6 刘君;融合计算智能的蛋白质结构预测研究[D];重庆大学;2011年
7 杨玉芳;三七总皂苷对顺铂、马兜铃酸肾损害的保护作用研究[D];广西医科大学;2012年
8 张永红;小麦条锈菌cDNA文库构建和表达序列标签(ESTs)分析[D];西北农林科技大学;2006年
9 吕淑敏;拟黑多刺蚁毒蕈碱型乙酰胆碱受体基因(mAchR)及抑瘤基因(QM)的克隆与表达研究[D];陕西师范大学;2008年
10 张建林;双胸蚓组织热稳定性核酸酶的分离纯化及其cDNA克隆[D];山西医科大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 韩聪;家蚕OCIAD2基因的克隆表达及其定位研究[D];浙江理工大学;2010年
2 兰任;基于并行混合粒子群算法的蛋白质结构预测[D];大连理工大学;2010年
3 朱均燕;模拟退火算法在蛋白质结构预测中的应用[D];福建农林大学;2011年
4 胡丹凤;黄瓜芽黄突变体的蛋白组学研究[D];石河子大学;2010年
5 田家欢;彩色棉纤维色素相关基因的表达差异及CHI基因的克隆与分析[D];四川农业大学;2011年
6 武江勇;基于机器人机构学的F_0F_1ATP合成酶马达能量储存研究[D];西南交通大学;2011年
7 高海燕;镰孢菌属Q7-31菌株木聚糖酶基因的异源表达及酶学特性研究[D];青海大学;2011年
8 仪茜茜;坛紫菜hsp70真核表达载体的构建及表达[D];宁波大学;2011年
9 赵瑞昌;小麦麸皮中蛋白质、淀粉的分离技术研究[D];南京农业大学;2009年
10 王静杰;胡子鲶Dmrt1基因全长cDNA的克隆和时空表达[D];广东海洋大学;2011年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前8条
1 蔡淑安,许禄,杨翌秋,胡昌玉;老年性白内障晶状体中金属元素的人工神经网分析[J];高等学校化学学报;1994年07期
2 陈方泽,陈丙珍,何小荣;遗传算法与神经网络(Ⅰ)──用改进的遗传算法训练神经网络[J];化工学报;1996年03期
3 郭明,许禄;酚类化合物的QSAR研究[J];环境科学学报;1998年02期
4 郭明,许禄;有机化合物的疏水参数与拓扑指数相关性的研究[J];化学学报;1996年12期
5 胡昌玉,许禄;计算机自动结构解析专家系统研究——ESESOC-Ⅱ结构产生器[J];中国科学(B辑 化学 生命科学 地学);1994年10期
6 王志珍,邹承鲁;后基因组——蛋白质组研究[J];生物化学与生物物理学报;1998年06期
7 郭明,许禄;酚类化合物的多元回归分析及神经网络法研究[J];物理化学学报;1996年11期
8 许禄,杨翌秋,胡昌玉;神经网络和Eu~(2+)离子在复合氟化物基体中跃迁发射的研究[J];中国稀土学报;1995年01期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 殷志祥;蛋白质结构预测方法的研究进展[J];计算机工程与应用;2004年20期
2 曾志平,王勇献,凌君,刘昆;蛋白质二级结构预测中的HMM及I/O HMM方法研究[J];电脑与信息技术;2002年05期
3 靳利霞,唐焕文;蛋白质结构预测方法简述[J];自然杂志;2001年04期
4 李明;苏显中;于敏;郑全喜;;蛋白质结构预测研究进展[J];生物技术;2009年03期
5 宁正元;林世强;;蛋白质结构的预测及其应用[J];福建农林大学学报(自然科学版);2006年03期
6 郭雨珍;冯恩民;;蛋白质结构研究现状与展望[J];生物信息学;2007年04期
7 刘云玲;陶兰;;蛋白质结构预测方法探析[J];生物信息学;2007年04期
8 姚志萍,朱德煦,毕汝昌;尿胰蛋白酶抑制剂的空间结构预测[J];科学通报;1996年17期
9 曾炳佳;曹以诚;杜正平;陈晓曦;;同源建模关键步骤的研究动态[J];生物学杂志;2008年02期
10 殷志祥,张家秀;神经网络在蛋白质结构预测中的应用[J];中国科技信息;2005年11期
中国重要会议论文全文数据库 前8条
1 吴爱平;田丽青;胡云;曹洋;苗智超;蒋太交;;蛋白质结构预测平台TJ_Jiang及其在CASP8中的表现[A];第十一次中国生物物理学术大会暨第九届全国会员代表大会摘要集[C];2009年
2 桑延超;彭志红;李谦;;PSO-GA协同优化算法及其在蛋白质结构预测中的应用[A];2007年中国智能自动化会议论文集[C];2007年
3 过涛;孙之荣;;膜蛋白跨膜区段序列分析和预测[A];第七届全国生物膜学术讨论会论文摘要汇编[C];1999年
4 靳利霞;唐焕文;;基于能量极小化的蛋白质结构预测[A];中国运筹学会第六届学术交流会论文集(上卷)[C];2000年
5 胡秀珍;黄延昭;肖奕;;密码子上下文关联与蛋白质结构[A];第九次全国生物物理大会学术会议论文摘要集[C];2002年
6 朱永锋;崔光照;;基于构象空间退火算法的蛋白质结构预测[A];科技、工程与经济社会协调发展——河南省第四届青年学术年会论文集(上册)[C];2004年
7 王志新;;自然界中究竟有多少种蛋白质折叠类型[A];生命科学与生物技术:中国科协第三届青年学术年会论文集[C];1998年
8 鄒忠毅;韩榕生;李定国;;导引模擬退火法在蛋白质结构分析上的应用[A];Some Problems on the Protein Structure Analyses--Proceedings of CCAST (World Laboratory) Workshop[C];2002年
中国重要报纸全文数据库 前7条
1 中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室 王志珍;蛋白质的折叠:破译“第二遗传密码”[N];科技日报;2001年
2 记者 李大庆;我科学家在全球蛋白结构预测比赛中喜获佳绩[N];科技日报;2010年
3 中科院生物学部 张春霆;对生物信息学的展望[N];北京科技报;2000年
4 陈志楠;挖掘“不为人知的艺术”[N];科技日报;2009年
5 王雪飞 吴黎;中国生物信息学研究快速发展[N];健康报;2002年
6 春晓;国外生物信息学的发展与现状[N];中国医药报;2002年
7 本报记者何世文;他们在解密第二遗传密码[N];科技日报;2002年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 黄旭;从头预测蛋白质结构元启发方法研究[D];苏州大学;2011年
2 罗亮;蛋白质结构预测模型研究[D];华中科技大学;2010年
3 孙鹏飞;基于计算智能技术的蛋白质结构预测方法研究[D];哈尔滨工程大学;2010年
4 靳利霞;蛋白质结构预测方法研究[D];大连理工大学;2002年
5 熊正大;链式几何结构的拟人型优化方法[D];华中科技大学;2011年
6 谷俊峰;蛋白质结构预测中几个关键问题的研究[D];大连理工大学;2009年
7 郭雨珍;蛋白质结构预测和比较的优化研究[D];大连理工大学;2007年
8 欧阳霞辉;拟黑多刺蚁和意大利蜜蜂雌激素相关受体基因的克隆与表达研究[D];陕西师范大学;2007年
9 吕志鹏;蛋白质结构预测的现实求解方法[D];华中科技大学;2007年
10 何洁月;面向蛋白质结构预测的计算生物学技术研究[D];东南大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 魏艳宇;蛋白质结构预测中二面角统计势研究[D];华中师范大学;2012年
2 吴进珍;并行蚁群优化在蛋白质结构预测中的应用研究[D];苏州大学;2010年
3 宁静;蛋白质结构预测的多agent模拟退火算法研究[D];福建农林大学;2012年
4 朱均燕;模拟退火算法在蛋白质结构预测中的应用[D];福建农林大学;2011年
5 刘现;蛋白质结构预测的粒子群优化算法研究[D];福建农林大学;2011年
6 范岩;基于监督流形学习算法的固有不规则蛋白质结构预测研究[D];哈尔滨工程大学;2011年
7 邓海游;蛋白质结构预测中基于原子对距离分布的统计势研究[D];华中师范大学;2011年
8 肖衡;基于CUDA的AB非格点蛋白质结构预测的并行化研究[D];武汉科技大学;2011年
9 岳晓辉;基于禁忌搜索算法的蛋白质结构预测的研究[D];大连理工大学;2006年
10 何莲莲;蛋白质结构预测的算法研究[D];武汉大学;2005年
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