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《计算机研究与发展》 2005年10期
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基于支持向量机的肿瘤分类特征基因选取

李颖新  阮晓钢  
【摘要】:依据基因表达谱有效建立肿瘤分类模型的关键在于准确找出决定样本类别的一组特征基因·针对该问题,在分析肿瘤基因表达谱特征的基础上,研究了肿瘤分类特征基因选取问题·首先,提出了一种新的类别可分性判据以滤除分类无关基因,并采用支持向量机作为分类器进行特征基因分类性能的检验·然后,采用两两冗余分析及基于支持向量机分类模型的灵敏度分析法进行冗余基因的剔除·以急性白血病亚型分类特征基因选取为例进行实验,结果表明了上述方法的可行性和有效性·

【引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 李宏;面向应用领域的分类方法研究[D];中南大学;2007年
2 卢新国;基于DNA微阵列基因表达谱数据的癌症检测研究[D];湖南大学;2007年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 宇缨;;支持向量机及其在自然语言处理中的应用[J];东莞理工学院学报;2007年01期
2 李颖新,阮晓钢;基于基因表达谱的肿瘤亚型识别与分类特征基因选取研究[J];电子学报;2005年04期
3 李伟红;龚卫国;陈伟民;梁毅雄;尹克重;;基于SVM RFE的人脸特征选择方法[J];光电工程;2006年05期
4 阮晓钢;李颖新;李建更;龚道雄;王金莲;;基于基因表达谱的肿瘤特异基因表达模式研究[J];中国科学C辑;2006年01期
5 张军英,Y.J.Wang,J.Khan,R.Clarke;基于类别空间的基因选择[J];中国科学E辑;2003年12期
6 李颖新,朱云华,阮晓钢;基于支持向量机的肿瘤亚型识别[J];计算机工程与应用;2004年17期
7 夏国恩;曾绍华;金炜东;;支持向量回归机在铁路客运量时间序列预测中的应用[J];计算机应用研究;2006年10期
8 孙跃鹏,刘民,吴澄;面向色织生产过程的整经轴数智能预测算法[J];控制工程;2005年06期
9 刘沭华,张学工,孙素琴;中药材产地的近红外光谱自动鉴别和特征谱段选择[J];科学通报;2005年04期
10 姚凯丰,陆文凯,丁文龙,张善文,肖焕钦,李衍达;一种基于SVM特征选择的油气预测方法[J];天然气工业;2004年07期
中国重要会议论文全文数据库 前3条
1 WANG Juan~1 Gong Xue-jing~1 CI Lin-lin~2 YAO Kang-ze~3 Information and Science Technology Academy,Beijing Institute of Technology,Beijing,100081,China;2,3.Information and High Technology Institute,Beijing,100085,China;Method for Feature Selection in SAR ATR Systems[A];Proceedings of 6th International Symposium on Test and Measurement(Volume 6)[C];2005年
2 姚凯丰;陆文凯;张善文;肖焕钦;李衍达;;基于特征扩展和特征选择的油气预测方法[A];CPS/SEG2004国际地球物理会议论文集[C];2004年
3 Yao Kaifeng, Lu Wenkai State Key Laboratory of Intelligent Technology and Systems, Dept. of Automation, Tsinghua Vniversity , Beijing, China Zhang Shanwen, Xiao Huanqin Shengli Oil field Limited Company, Dongying, Shandong Province, China Li Yanda State Key Laboratory of Intelligent Technology and Systems, Dept. of Automation, Tsinghua University, Beijing , China;Hydrocarbon reservoir prediction using a feature expansion and feature selection method[A];Expanded Abstracts CPS/SEG 2004 International Geophysical Conference (Volume Ⅱ)[C];2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 蔡从中;支持向量机及其在生物材料功能研究中的应用[D];重庆大学;2003年
2 彭司华;计算智能在生物信息学中的应用研究[D];浙江大学;2004年
3 刘志刚;支撑向量机在光谱遥感影像分类中的若干问题研究[D];武汉大学;2004年
4 宋杰;生物信息数据挖掘中的若干方法及其应用研究[D];大连理工大学;2005年
5 胡跃;蛋白质指纹图谱和生物信息学在乳腺癌中的研究[D];浙江大学;2005年
6 张英;基于支持向量机的过程工业数据挖掘技术研究[D];浙江大学;2005年
7 李云;特征选择算法及其在基于内容图像检索中的应用研究[D];重庆大学;2005年
8 郑春红;支撑矢量机应用的关键技术研究[D];西安电子科技大学;2005年
9 何学文;基于支持向量机的故障智能诊断理论与方法研究[D];中南大学;2004年
10 郑胜;映射二乘向量机及其在天文导航中的应用[D];华中科技大学;2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 刘申岭;基于SVM的基因选择[D];西安电子科技大学;2004年
2 杨小涛;支持向量机算法研究及在基因表达数据分析中的应用[D];华中科技大学;2004年
3 姬翔;基于SVM的多病类诊断基因选择方法研究[D];西安电子科技大学;2005年
4 朱云华;基于基因表达谱的小圆蓝细胞瘤亚型识别研究[D];北京工业大学;2005年
5 沈小乔;基因表达数据分类算法及其应用研究[D];湖南大学;2005年
6 詹超;支持向量机在基因表达数据分类中的研究[D];武汉理工大学;2006年
7 郑一华;基于支持向量机的水质评价和预测研究[D];河海大学;2006年
8 王冰;SVM在肾结石分类和计算热力学参数中的应用[D];兰州大学;2006年
9 张楠;一个概念聚合和文档资源分类的计算模型[D];中国科学院研究生院(计算技术研究所);2006年
10 李侨;基于基因表达谱的基因挖掘算法研究[D];哈尔滨工业大学;2006年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 包海波,徐竹青,李东华;论政府在知识产权战略中的作用[J];中国软科学;2004年01期
2 吉根林,孙志挥;数据挖掘技术[J];中国图象图形学报;2001年08期
3 李晓黎,刘继敏,史忠植;基于支持向量机与无监督聚类相结合的中文网页分类器[J];计算机学报;2001年01期
4 朱永生,王成栋,张优云;二次损失函数支持向量机性能的研究[J];计算机学报;2003年08期
5 李红莲,王春花,袁保宗,朱占辉;针对大规模训练集的支持向量机的学习策略[J];计算机学报;2004年05期
6 郑恩辉;李平;宋执环;;不平衡数据知识挖掘:类分布对支持向量机分类的影响[J];信息与控制;2005年06期
7 刘慧婷,张旻,程家兴;基于多项式拟合算法的EMD端点问题的处理[J];计算机工程与应用;2004年16期
8 邓拥军,王伟,钱成春,王忠,戴德君;EMD方法及Hilbert变换中边界问题的处理[J];科学通报;2001年03期
9 杨叔子,史铁林,丁洪;机械设备诊断的理论、技术与方法[J];振动工程学报;1992年03期
10 杨建文;贾民平;;希尔伯特-黄谱的端点效应分析及处理方法研究[J];振动工程学报;2006年02期
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3 高飞;关联规则挖掘算法研究[D];西安电子科技大学;2001年
4 王明怡;微阵列数据挖掘技术的研究[D];浙江大学;2004年
5 许孝元;分类关联规则归纳算法及应用研究[D];华南理工大学;2005年
6 贺平;数据挖掘中的分类方法及其在质谱数据中的应用[D];四川大学;2005年
7 张绍武;基于支持向量机的蛋白质分类研究[D];西北工业大学;2004年
8 刘刚;数据挖掘技术与分类算法研究[D];中国人民解放军信息工程大学;2004年
9 任佳;分类关联规则挖掘及其在复杂工业过程中的应用研究[D];浙江大学;2006年
10 缪裕青;关联规则挖掘及其在基因表达数据中的应用[D];中国科学技术大学;2007年
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1 曾海平;基于经验模态分解法的滚动轴承故障诊断系统研究[D];浙江大学;2005年
2 陈立君;基于多分辨率分形维的木材表面纹理分类的研究[D];东北林业大学;2007年
3 唐孝;支持向量机(SVM)及其在心电图(ECG)分类识别中的应用[D];四川师范大学;2007年
4 易丽君;基于基因表达谱的数据挖掘方法研究[D];中南大学;2007年
5 张利军;数据挖掘系统及其应用研究——用关联特征提高朴素贝叶斯文本分类器的性能[D];西北工业大学;2003年
6 郑建华;基于支持向量机的数据挖掘[D];天津大学;2004年
7 朱云华;基于基因表达谱的小圆蓝细胞瘤亚型识别研究[D];北京工业大学;2005年
8 詹超;支持向量机在基因表达数据分类中的研究[D];武汉理工大学;2006年
9 熊娓;基于SVM和GA混合算法的基因芯片特征基因子集选取研究[D];吉林大学;2006年
10 赵晶晶;改进的遗传算法在样本选择中的应用研究[D];东北师范大学;2006年
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6 乔立岩;彭喜元;彭宇;;基于支持向量机的键盘密码输入异常检测方法研究[A];2004全国测控、计量与仪器仪表学术年会论文集(上册)[C];2004年
7 王晶;薛毅;;基于有效集法的改进支持向量机算法[A];2007中国控制与决策学术年会论文集[C];2007年
8 王伟强;付立波;高文;黄庆明;蒋树强;;一种基于笔画特征的叠加文字检测方法[A];全国网络与信息安全技术研讨会论文集(下册)[C];2007年
9 杨凌;刘玉树;;基于支持向量机的坦克识别算法[A];中国航空学会信号与信息处理专业全国第八届学术会议论文集[C];2004年
10 徐扬;陈实;田玉敏;;基于核主成分分析的步态识别[A];2008'中国信息技术与应用学术论坛论文集(二)[C];2008年
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1 清华大学 苏光大;非接触式人脸识别技术[N];计算机世界;2006年
2 ;选择合适的数据挖掘算法[N];计算机世界;2007年
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9 吴惠雄;基于支持向量机与聚类算法的中文文本分类研究[D];中南林业科技大学;2009年
10 丁胜;基于支持向量机的手写体字符识别[D];青岛大学;2006年
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