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《中国科学(C辑:生命科学)》 2006年01期
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基于基因表达谱的肿瘤特异基因表达模式研究

阮晓钢  李颖新  李建更  龚道雄  王金莲  
【摘要】:基于肿瘤基因表达谱,利用生物信息学的方法,从肿瘤与正常组织的样本分类入手就肿瘤特异表达基因的发现及其表达模式问题进行了分析和研究,进而探讨了肿瘤在基因表达上的特点.首先,在分析肿瘤基因表达谱特点的基础上,提出了基于Relief算法的样本分类特征基因选取策略;然后,以支持向量机为分类工具进行样本类型的识别,以分类错误率为标准选取样本分类特征基因,并对其中反映肿瘤与正常样本组织构成特点的组织特异表达基因进行排除以突出肿瘤样本真实的类别特征;最后结合统计学方法,从信息学的角度论证了分类特征基因在肿瘤组织中特异表达的确实性和普遍性,并对这些基因在肿瘤组织中呈现出的特异的表达模式进行了分析.

【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李颖新,阮晓钢;基于基因表达谱的肿瘤亚型识别与分类特征基因选取研究[J];电子学报;2005年04期
2 王正文;胃癌的基因治疗研究进展[J];国外医学.临床生物化学与检验学分册;2003年02期
3 刘仁虎,赵建伟,肖勇,孟金陵;拟南芥cDNA芯片和油菜-拟南芥比较作图相结合筛选甘蓝型油菜抗菌核病先验基因[J];中国科学C辑;2005年01期
4 李颖新,阮晓钢;基于支持向量机的肿瘤分类特征基因选取[J];计算机研究与发展;2005年10期
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6 张敏;朱晶;郭政;李霞;杨达;王磊;饶绍奇;;利用亚细胞位置特异的基因功能模块与表达调控网络识别疾病特征基因[J];科学通报;2006年13期
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中国重要会议论文全文数据库 前2条
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2 李建更;段艳华;阮晓钢;;提取肿瘤分类特征基因的一种新方法[A];2007年中国智能自动化会议论文集[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前7条
1 刘占文;解毒消痰方对甲醛干预S_(180)肉瘤细胞因子表达的影响[D];第二军医大学;2007年
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4 谭宇蕙;中药活性成分对自杀基因旁观者效应增效作用及机制研究[D];广州中医药大学;2005年
5 孙明;转染抑癌基因KLF6对前列腺癌PC-3细胞作用的实验研究[D];四川大学;2005年
6 付旭平;基因芯片数据分析[D];复旦大学;2005年
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1 周文瑾;基于聚类算法的基因芯片研究[D];长春理工大学;2007年
2 丁立军;几何学习在病毒分类与肿瘤分型中的应用[D];浙江工业大学;2007年
3 易丽君;基于基因表达谱的数据挖掘方法研究[D];中南大学;2007年
4 许相范;抗癌口服液体外对人MGC-803胃癌细胞株的抗增殖及诱导凋亡的研究[D];延边大学;2002年
5 王雨;环境因素、CYP2E1基因多态性及p27~(Kip1)蛋白表达与胃癌发生和发展关系的研究[D];中国医科大学;2003年
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7 刘萌;活体细胞凋亡核素检测技术的实验研究[D];北京大学;2005年
8 曹孙琼;抑制端粒酶活性与宫颈癌细胞增殖关系的研究[D];中国医科大学;2005年
9 朱云华;基于基因表达谱的小圆蓝细胞瘤亚型识别研究[D];北京工业大学;2005年
10 徐志远;塞来昔布对人肝癌细胞株的抗增殖及诱导凋亡的研究[D];中国医科大学;2006年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前4条
1 李颖新,阮晓钢;基于支持向量机的肿瘤分类特征基因选取[J];计算机研究与发展;2005年10期
2 李霞,张田文,郭政;一种基于递归分类树的集成特征基因选择方法[J];计算机学报;2004年05期
3 陆巍,忻健,王翼飞;基于非参数方法的肿瘤基因表达数据挖掘[J];上海大学学报(自然科学版);2003年06期
4 王海芸,李霞,郭政,张瑞杰;四种模式分类方法应用于基因表达谱分析的比较研究[J];生物医学工程学杂志;2005年03期
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7 顾奎兴;;世纪之交对肿瘤治疗的思考与展望[A];国际传统医药大会论文摘要汇编[C];2000年
8 冯翠萍;陈小君;刘昕;钟志强;;萌动激活赤灵芝孢子粉对小鼠肝癌的抑制作用及对肿瘤组织端粒酶活性的影响[A];2000全国肿瘤学术大会论文集[C];2000年
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9 马晓丽;Hedgehog信号途径主要分子在人类上消化道发生和肿瘤组织中表达的研究[D];山东大学;2005年
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