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《华南农业大学学报》 2006年02期
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口蹄疫病毒R株基因组序列分析研究

林小敏  孙彦伟  余业东  罗满林  林绍荣  贺东生  
【摘要】:根据GenBank上发表的口蹄疫(foot-and-mouth d isease,FMD)全基因序列数据,设计了多对引物,采用RT-PCR的方法,分别对R株编码区和非编码区基因进行扩增,将各片段克隆至pMD18-T载体,进行核苷酸序列测定.按顺序拼接各基因的序列,将结果序列与GenBank上各FMDV毒株的序列进行比较和同源性分析.序列的比较和分析表明,R株编码区全长为6 966个核苷酸,共编码2 322个氨基酸;非编码区5′端内部核糖体结合位点(internal ribo-som e entry site,IRES)长约450个核苷酸,3′非翻译区(untranslatab le region,UTR)从TAA始至Poly(A)前长度为94个核苷酸,所测出Poly(A)尾长度为18个核苷酸.与GenBank世界流行毒株的序列比较,编码区核苷酸序列同源性为88%~90%,推导氨基酸序列同源性为88%~95%.

【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 朱丽杰;一株O型口蹄疫病毒分离株的全基因序列分析[D];东北农业大学;2007年
【同被引文献】
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9 王海烽;O型口蹄疫病毒VP1蛋白原核表达及结构预测[D];新疆农业大学;2009年
10 李平花;口蹄疫病毒结构蛋白VP2-3-1基因的克隆及其原核表达[D];甘肃农业大学;2003年
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