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鹌鹑线粒体cytb基因和ND2基因的系统发育分析

雷莹  李静云  白俊艳  庞有志  杨又兵  张小辉  赵淑娟  陈宇  王新乐  董智豪  李淦  游祥宾  张小玲  王乾昆  
【摘要】:为了比较朝鲜鹌鹑种内变异及其与其他物种的亲缘关系,试验分别选用黑羽、白羽、栗羽、黄羽4种羽色鹌鹑各8只,对其线粒体cytb基因和ND2基因进行PCR扩增、测序,并与其他不同鸟类的相应基因进行序列比对分析,采用最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建系统发育树,分析朝鲜鹌鹑的种内突变位点及与其他物种的亲缘关系。结果表明:cytb基因在4种羽色鹌鹑之间没有突变位点。ND2基因有2个突变位点,并造成氨基酸突变,即在490 bp处碱基G突变为A,导致164位点处氨基酸由缬氨酸(V)变为异亮氨酸(I);在800 bp处碱基T突变为C,导致第267位点处氨基酸由异亮氨酸(I)变为苏氨酸(T)。与朝鲜鹌鹑亲缘关系最近的是日本鹌鹑,其次是中国鹌鹑。说明线粒体cytb和ND2基因适合用于鸟类亲缘关系分析,朝鲜鹌鹑是由日本鹌鹑改良而来的。

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