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豫西黑猪线粒体Cytb基因遗传多样性分析

雷莹  白俊艳  杨又兵  张小辉  赵淑娟  庞有志  张文涛  
【摘要】:为了评估河南省地方类群豫西黑猪的种质资源,分析其遗传多样性和基因混杂情况,试验以长白猪为对照,采用PCR扩增的方法,并用最大似然法(ML法)和邻接法(NJ法)构建分子进化树,对豫西黑猪线粒体Cytb基因进行了研究,并与GenBank中37个其他品种猪进行比对。结果表明:PCR扩增得到的线粒体Cytb基因条带明亮,大小为873 bp。去除差异序列获得的长度为769 bp的豫西黑猪线粒体Cytb基因片段中共有10个变异位点,其中有1个变异位点可造成蛋氨酸与苏氨酸之间的非同义突变;长白猪线粒体Cytb基因片段中共有8个变异位点。豫西黑猪与GenBank中已公布的37个其他品种猪序列进行比对后共发现25个变异位点,其中有4个变异位点(58,94,173,183位)可造成氨基酸突变。在构建的两种分子进化树中,豫西黑猪和长白猪均分布在两大支系中。说明豫西黑猪具有遗传多样性,并且与其他品种猪之间存在基因混杂情况。

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