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《黑龙江畜牧兽医》 2017年06期
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番鸭细小病毒YL08株VP1基因重组分析

黎明  董慧莹  于天飞  
【摘要】:为确定番鸭细小病毒(MDPV)YL08株的起源和进化过程,基于VP1全基因序列,将YL08株与其他6株MDPV中国大陆株进行了基因重组分析。系统进化树分析表明:7株MDPV可分成3组,MDPV-Ⅰ、MDPV-Ⅱ和MDPV-Ⅲ。MDPV-Ⅰ仅仅包括1株MDPV,为黑龙江的YL08株;MDPV-Ⅱ包括3株MDPV,为广东GD株以及福建P株和P1株;MDPV-Ⅲ包括2株MDPV,为广西MDPV-GX5株和上海SAAS-SHNH株。通过Sim Plot软件和系统进化树进行的重组分析表明,MDPV YL08株来源于MDPV-Ⅱ和MDPV-Ⅲ之间的重组。这是首次发现在MDPV VP1基因间存在重组现象。
【作者单位】齐齐哈尔大学计算机与控制工程学院;齐齐哈尔大学生命科学与农林学院;
【关键词】番鸭 细小病毒YL株 起源与进化 VP基因 重组分析 系统进化树
【基金】:黑龙江省自然科学基金项目(QC2014C034) 黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划项目(UNPYSC T-2015093) 齐齐哈尔大学青年教师科研启动项目(2014k-M06;2014k-Z02)
【分类号】:S852.65
【正文快照】:
番鸭细小病毒(Muscovy duck parvovirus,MDPV)为细小病毒科(Parvoviridae)细小病毒亚科(Parvoviri-nae)依赖病毒属成员(Dependovirus)[1],为雏番鸭“三周病”的病原。雏番鸭“三周病”以麻痹瘫痪和腹泻为主要临床症状[2-3]。MDPV为单链、线状DNA病毒,大小为5 132 nt,含有两个

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