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《高技术通讯》 2001年03期
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水稻小GTP蛋白基因Osrab5B基因的克隆和鉴定

林慧贤  刘筱斌  李发强  罗文永  刘良式  
【摘要】:用已知遗传图位的BAC克隆片段 ,对水稻 (Oryzasativa)小穗cDNA文库进行筛选 ,获得一个水稻小GTP结合蛋白 (smallGTP bindingprotein ,SGP)的相关序列 ,序列测定后以该cDNA序列为基础将 4个表达序列标记 (EST)进行了电子克隆 (electroniccloning) ,根据电子克隆结果设计引物 ,利用RT PCR方法获得了一个水稻 (Oryzasati va)中尚未鉴定的cDNA克隆Osrab5B ,长 10 16bp。它与龙船海棠属 (Mesembryan themumcrystallinum)和百脉根属 (Lotusjaponicus)命名为rab5B基因 (序列登录号分别是AJ0 0 62 2 5和Z73939)有着高度同源性 (cDNA核苷酸序列ID值分别大于 74 %和76% ) ,同属rab家族的一个新的亚族。进而根据Osrab5B的cDNA序列设计引物 ,扩增得到Osrab5B的基因组克隆 ,序列分析表明它至少有 7个内含子和 8个外显子