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《华南预防医学》 2011年03期
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广东人群PP2A-B亚基基因5′-侧翼区多态性连锁不平衡和单体型分析

张树江  林育纯  陈慧峰  万建新  林丽娜  罗洁  李文  陈雯  林忠宁  
【摘要】:目的探讨蛋白磷酸酶2A(PP2A)的调节B/PR55δ亚基基因5′-侧翼区多态性的连锁不平衡和人群单体型分布特征。方法选取经体检排除急慢性疾病的50例广东汉族健康人群为调查对象,以人PPP2R2D基因5′-侧翼区中-1684 AG(rs11146169)、-1196 CT(rs9419202)、-462 GA(rs7074421)和-1610 AT为4个纳入的多态性位点,采用Hap loV iew软件分析遗传特征、连锁不平衡(LD)和单体型分布,进行人群分布的2检验。结果 50例广东汉族人群中各多态性位点基因型频率均符合Hardy-W e inberg平衡(P0.05);杂合度(π)分别为-1684 AG(0.020)、-1610 AT(0.132)、-1196CT(0.059)和-462 GA(0.059),且均不存在变异纯合型,其中在-1196 CT和-462 GA位点明显低于HapM ap人群(P0.05);-1196 CT和-462 GA位点之间呈完全LD,但其他位点间未见LD关系;构建了该人群的3种单体型(H1~H3),频率分布主要是野生单体型(H1,89.0%),其余2种变异单体型分别为H2(7.0%)和H3(3.0%);筛选出的3个标签SNP为-1684 AG、-1610 AT和-462 GA。结论确定并报道中国南方广东汉族人群PPP2R2D基因5′-侧翼区中相对保守的标签SNP和单体型分布,为进行该基因启动子区的功能分析提供依据。
【作者单位】广东省营养膳食与健康重点实验室中山大学公共卫生学院;中山大学附属第一医院;
【关键词】蛋白磷酸酶A Bδ亚基 PPPRD基因 ′-侧翼区 单体型
【基金】:国家自然科学基金项目(81072334,30771832) 教育部科学技术研究重点项目(No.109126),教育部博士点基金项目(No.20090171110052) 中山大学211三期资助项目
【分类号】:Q987
【正文快照】:
细胞功能学作用中关键底物磷酸化过程中蛋白激酶和磷酸酶活性之间的动态平衡对细胞稳态十分重要。蛋白磷酸酶2A(protein phosphatase 2A,PP2A)是生物体内广泛表达的具有多种细胞功能的丝氨酸-苏氨酸(Ser/Thr)磷酸酶家族(PPs)成员之一[1];与蛋白磷酸酶1(PP1)等4类PPs一起,通过

【引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 胡耀明;陈慧峰;罗洁;李晓杰;陈宇曦;林丽娜;麦剑荣;陈雯;林忠宁;林育纯;;镉对蛋白磷酸酶2A-B55δ高表达L02细胞周期和核因子-κB活化影响[J];中国职业医学;2012年03期
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 杨淋清;杨杏芬;林忠宁;魏青;潘尚霞;周建强;林育纯;赵敏;马文军;黄俊明;;中国南方粤语方言地区汉族人群GSTM1、GSTT1基因多态性[J];癌变.畸变.突变;2006年03期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前4条
1 陈慧峰;罗洁;林丽娜;李文;张树江;万建新;陈雯;林忠宁;林育纯;;蛋白磷酸酶2A-Aα亚基基因5'侧翼区多态性在广东汉族人群中的分布[J];癌变·畸变·突变;2011年02期
2 梁克诚;郑楚;甘浪舸;;GSTM1、GSTT1基因多态性与肺癌易感性[J];华夏医学;2009年03期
3 王国彬;陈海珍;杨杏芬;陈瑞梅;禤汝流;杨颍;黄俊明;李文立;;健康人群谷胱甘肽硫转移酶M1基因型分布[J];中国公共卫生;2008年03期
4 陈慧峰;林丽娜;李文;罗洁;张树江;万建新;林忠宁;陈雯;林育纯;;广东人群PP2A-Aα亚基基因5′-侧翼区单体型分析[J];中国预防医学杂志;2011年03期
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 樊娟;广西壮族人群GSTM1和GSTT1基因多态性与肺癌易感性关系的研究[D];广西医科大学;2011年
2 白图雅;GSTM1、GSTM3、GSTT1、GSTP1基因多态性与蒙古族人群肺癌易感性关系[D];内蒙古医学院;2011年
3 陈春梅;代谢酶多态性和BPDE-DNA加合物与肺癌发病的关系[D];浙江大学;2012年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 李文;林育纯;陈慧峰;罗洁;李晓杰;林丽娜;胡耀明;张树江;陈雯;林忠宁;;锌影响镉对人未成熟树突状细胞毒性作用[J];中国职业医学;2011年03期
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前3条
1 林国芳,马晴雯,查永林,娄克俭,陈纪刚,沈建华;上海“本地人”正常人群GSTT1和GSTM1基因型多态性研究[J];癌变.畸变.突变;2001年01期
2 郑天荣,郑秋红,龚福生,谢云青,汪相如;GSTT1和GSTM1基因缺失多态与胃癌易感性[J];实用肿瘤杂志;2002年03期
3 高杨,张桥;GSTM1和CYP2D6基因多态性与肺癌敏感性的关系[J];中国公共卫生;1999年06期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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3 张勇;Y-DNA多态性分析与人类进化[J];国外医学.遗传学分册;1997年04期
4 ;发现之旅[J];国外社会科学文摘;2003年07期
5 曾长青;国际人类基因组单体型图计划[J];生物学通报;2004年02期
6 王起山;潘玉春;胡艳玲;;单体型关联分析方法研究进展[J];上海交通大学学报(农业科学版);2008年03期
7 胡劲松,党娜娜,黄辰,宋土生;国际人类基因组单体型图计划[J];国外医学.遗传学分册;2005年03期
8 吴雄文,张文杰,RL Dawkins,赵修竹;HLA-B与TNF基因间区的单体型特异性的多态现象[J];免疫学杂志;1993年02期
9 刘越;吕社民;;单核苷酸多态性影响基因功能的机制[J];生命的化学;2008年02期
10 王珏;罗玫;邹海;甘静;李星洁;陈强;郑忠伟;;最大似然法和方根法计算HLA三座位单体型频率的比较[J];中国输血杂志;2009年07期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 陈慧峰;林育纯;林丽娜;李文;罗洁;张树江;万建新;陈雯;林忠宁;;广东汉族人群PP2A-Aα亚基基因5'-侧翼区多态性的单体型分析[A];广东省环境诱变剂学会、广东省预防医学会卫生毒理专业委员会2010年学术会议资料汇编[C];2010年
2 林忠宁;;环境-致癌过程相关基因启动子区多态性及其单体型的功能分析[A];广东省环境诱变剂学会、广东省预防医学会卫生毒理专业委员会2010年学术会议资料汇编[C];2010年
3 徐新娟;梁晓慧;陈玉岚;珠勒皮亚;李素华;;VEGF基因单核苷酸多态性及其单体型与新疆维吾尔族长寿的关联研究[A];第十三次全国心血管病学术会议论文集[C];2011年
4 林育纯;陈慧峰;林丽娜;罗洁;李文;张树江;林忠宁;陈雯;;核因子-κB信号干预对PP2A-Aα基因启动子区多态性单体型转录活性的影响[A];全国生化/工业与卫生毒理学学术会议论文集[C];2010年
5 田正芹;朱平;陈艳;刘红星;龚艺文;傅玉;王明英;夏君燕;白德成;;骨髓增殖性疾病46/1基因单体型和Jak2V617F的关系以及民族基因多态性差异[A];第13届全国实验血液学会议论文摘要[C];2011年
6 尹东;王海江;王琦三;孟涛;帕尔哈提;葛磊;王飞;;TNF-A基因多态及单体型与维、汉民族胃癌关系的研究[A];中华医学会肿瘤学分会第七届全国中青年肿瘤学术会议——中华医学会肿瘤学分会“中华肿瘤 明日之星”大型评选活动暨中青年委员全国遴选论文汇编[C];2011年
7 张继红;吴凌云;王勇;李珍萍;章祥荪;;由基因型SNP数据推断相应单体型的Markov链统计方法(英文)[A];中国运筹学会第七届学术交流会论文集(下卷)[C];2004年
8 王瑞省;吴凌云;李珍萍;章祥荪;;单体型装配问题及其遗传算法(英文)[A];中国运筹学会第七届学术交流会论文集(中卷)[C];2004年
9 付真彦;;CYP4F2基因单体型与心肌梗死的相关性研究[A];中华医学会心血管病学分会第十次全国心血管病学术会议汇编[C];2008年
10 徐新娟;梁晓慧;陈玉岚;珠勒皮亚;李素华;;TERT基因单核苷酸多态性及其单体型与新疆维吾尔族人长寿的关联研究[A];第十三次全国心血管病学术会议论文集[C];2011年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 本报记者 李雪墨 李斌;单体型图破解人类基因组奥秘[N];医药经济报;2003年
2 张荔子;血样有助于破解遗传之谜[N];大众卫生报;2003年
3 张荔子 张清润;注释“天书”[N];健康报;2006年
4 本报记者 薛冬;中国承担国际人类基因组单体型图计划10%任务[N];光明日报;2003年
5 通讯员 刘宁春 陈志军 记者 杨丽佳;又一脊柱侧弯致病易感基因被发现[N];健康报;2008年
6 王雪飞;儿童多动症有了疗效预测模型[N];健康报;2006年
7 辛纹 李雪梅 李宓 毛磊 喻菲 欣华;成就与尴尬并存[N];医药经济报;2003年
8 李天舒;重启基因计划 拓展研究空间[N];健康报;2008年
9 李 斌;同一种药物药效为何因人而异[N];中国中医药报;2003年
10 叶书宏;科学家分析DNA查明海龟迁徙路线[N];中国海洋报;2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 汪颖;单体型和基因型问题的优化模型和算法[D];大连理工大学;2007年
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3 武其文;基于家系和单体型的TIM-1及TIM-3基因多态性与变应性哮喘的关联研究[D];华中科技大学;2009年
4 孙蓓;藏族原发性高血压的分子遗传学研究[D];中国协和医科大学;2004年
5 牛彦锋;内皮素受体B多态性与SOX10表达在先天性巨结肠症发病机制中作用研究[D];华中科技大学;2006年
6 杨晓亚;Survivin在食管癌肿瘤组织中高表达机制的研究[D];第三军医大学;2008年
7 张国玺;醛固酮合酶和11-β羟化酶基因多态性与原发性醛固酮增多症发病风险的相关性研究[D];华中科技大学;2009年
8 姜文锡;APOB、GR基因多态性与中国维吾尔族自然长寿的关联研究[D];新疆医科大学;2006年
9 王保军;CYP11B2/B1基因多态性与醛固酮瘤临床表型及预后的相关研究[D];华中科技大学;2009年
10 李宏召;Ⅰ CDH1基因启动子区及内含子一单核苷酸多态性与膀胱移行细胞癌的相关研究 Ⅱ 腹腔镜技术在肾脏功能保留和重建手术中的应用研究[D];华中科技大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 戚玲;云南汉族FZD3基因rs2241802、rs2323019、rs352203多态性及其单体型与精神分裂症关联研究[D];昆明医学院;2008年
2 赵正中;AKT1基因多态性与重性抑郁症的关联性研究[D];重庆医科大学;2009年
3 李自保;GSK-3β的rs334558和rs6438552位点基因多态性及其单体型与AD的相关性研究[D];中南大学;2010年
4 陈治中;湖北汉族人群TIM-3基因单体型与变应性哮喘相关性研究[D];华中科技大学;2008年
5 尤加永;脑源性神经营养因子单体型及载脂蛋白E基因多态性与晚发性抑郁症关系研究[D];南京医科大学;2009年
6 周伟;单体型组装加权最小字符翻转问题参数化算法研究[D];中南大学;2008年
7 宋波;白细胞介素-8基因多态性与胃癌恶病质的关系[D];青岛大学;2009年
8 吴岩峰;5-HT系统候选基因多态性、家庭环境因素及其交互作用与反社会人格障碍关联研究[D];南京医科大学;2011年
9 方哲翔;基于连锁不平衡的标签SNP预测[D];华中科技大学;2007年
10 王颖;基于分块的单体型推导算法及缺失问题研究[D];中国科学技术大学;2011年
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