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《西北植物学报》 2017年07期
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植物miR159家族成员分子特性及其进化规律研究

陈旭  王嘉毅  张梓浩  王天池  赖钟雄  林玉玲  
【摘要】:为了解植物miR159家族成员的分子特性及其进化规律,该研究对miRBase数据库中登录的miR159家族成员进行分类统计、进化树构建、科间比较、二级结构预测及靶基因分析。结果表明:miR159家族在植物界分布非常广泛,蕨类植物可能是miR159家族的进化祖先;系统发育进化树分析显示,植物miR159家族成员间存在多个进化分支,且进化关系与植物属性有关,即植物亲缘关系越近的成员更易成枝,且具有相同进化方向的成员序列高度同源;Mfold预测显示,pre-miR159均会自发形成典型、稳定的茎环二级结构,并包含19~21个碱基为单位的功能片段,每个单位均有可能形成miR159成熟体;靶基因分析发现,miR159家族成员主要作用于MYB转录因子、转座因子和假定蛋白等,但在不同物种间及相同物种的不同成员间作用的靶标种类与靶基因ID数量均存在差异,尤其是miR159-3p与miR159-5p间的差异最为显著。
【作者单位】福建农林大学园艺植物生物工程研究所;
【基金】:福建省自然科学基金杰出青年项目(2015J06004) 国家自然科学基金(31672127,31572088) 福建省重大专项(2015NZ0002-1) 福建省新世纪人才项目(20151104) 福建农林大学“杰出青年科研人才”培养专项基金(xjq201405)
【分类号】:Q943.2
【正文快照】:
microRNA(miRNA)是一类真核生物中不可或缺的内源单链小分子RNA,在植物中主要参与生长发育、激素应答和逆境胁迫等反应调控[1-4]。miR-NA的生成从细胞核中开始,随后历经一系列酶切、运转和加工等生化反应,最终生成长度约19~23nt的成熟体,与AGO蛋白结合形成RISC复合体并对靶标

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