收藏本站
《西北植物学报》 2009年12期
收藏 | 投稿 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

农作物钾离子通道基因的生物信息学分析

鲁黎明  
【摘要】:以AtAKT1所编码的氨基酸序列为检索序列,通过对GenBank NR数据库以及EMBL、DDBJ、PDB数据库进行检索,发现水稻、小麦、大麦、玉米、烟草等作物中具有cds全长的34个疑似K+通道基因。其中:水稻7个,玉米6个,烟草4个,马铃薯、胡萝卜、大麦各3个,葡萄、番茄各2个,蚕豆、小麦、油菜、甜瓜等各1个;有25个基因经过功能验证确定为K+通道基因。利用比较基因组学,将剩余的9个基因确定为K+通道基因。对34个K+基因进化关系的分析表明,与AtAKT1的同源性较高的K+通道基因为马铃薯的SKT1(相似性71%)、番茄的LKT1(相似性71%)、胡萝卜的DKT1(相似性69%)、烟草的NKT1(相似性62%)。

手机知网App
【引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 陈观水;余文杰;阮孝麟;施桂姣;潘大仁;;甘薯等7种植物NPR1基因的生物信息学分析[J];热带作物学报;2011年05期
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前5条
1 鲁黎明;杨铁钊;;高等植物K~+吸收转运蛋白及其分子调节[J];西北植物学报;2006年11期
2 张定一;张永清;;施钾对强筋小麦生理特性及产量的效应[J];西北植物学报;2007年01期
3 方荣;陈学军;缪南生;涂伟凤;;茄科植物比较基因组学研究进展[J];江西农业学报;2007年02期
4 杨铁钊;鲁黎明;夏巍;范进华;;烤烟富钾基因型钾吸收积累与内向钾电流特性[J];中国农业科学;2008年08期
5 李媛媛;傅廷栋;马朝芝;;芸薹属植物比较基因组学研究进展[J];植物学通报;2007年02期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 段晓宇;李贤伟;;肥料配施对一品红低温胁迫下生理生化指标的影响[J];安徽农业科学;2008年30期
2 赵琴;;植物钾吸收分子机制进展[J];安徽农业科学;2010年24期
3 杨琼;罗建新;夏凯;戴林建;郭维;;不同钾基因型烤烟品种表型差异及营养特性研究进展[J];长江大学学报(自然科学版)农学卷;2010年02期
4 鲁黎明;杨铁钊;;高等植物K~+吸收转运蛋白及其分子调节[J];西北植物学报;2006年11期
5 李俊林;高南;刘春生;苏彦华;;水稻钾离子通道基因OsKAT1.1的克隆、表达载体的构建及其电生理功能[J];基因组学与应用生物学;2011年04期
6 常丽丽;韩冰;王海燕;郭安平;王旭初;;盐芥响应盐胁迫的分子机制研究进展[J];西北植物学报;2011年12期
7 陈文超;;博辣红帅在河南省的栽培技术总结[J];湖南农业科学;2010年Z1期
8 聂红资;杨铁钊;杨志晓;周继华;豆显武;;不同供钾水平下转AtCIPK23基因烟草钾吸收特征的研究[J];河南农业科学;2009年06期
9 邵珏;邵玉锁;曹明富;;甘蓝型黄籽油菜育种研究进展[J];杭州师范大学学报(自然科学版);2008年05期
10 祝小捷;朱云集;刘小平;郭天财;谢迎新;田文仲;王凡;;施硫对小麦旗叶糖含量和籽粒淀粉积累的影响[J];麦类作物学报;2008年03期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 刘贯山;王元英;孙玉合;;高等植物钾转运蛋白[A];中国烟草学会第五届理事会第二次会议暨2005年学术年会论文集[C];2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 化党领;不同基因型小麦钾效率差异及生理机制[D];河南农业大学;2003年
2 鲁黎明;AtCIPK23在烟草中过表达的钾效率响应及NtHAK1的克隆与表达模式研究[D];河南农业大学;2007年
3 贾彦博;水稻(Oryza sativa L.)钾高效营养的生理机制研究[D];浙江大学;2008年
4 张金林;盐生植物海滨碱蓬Na~+吸收和积累的研究[D];兰州大学;2008年
5 王世华;叶面喷施纳米硅增强水稻抗重金属毒害机理研究[D];南京农业大学;2007年
6 吕俊;甘蓝型油菜及其亲本物种TTG1和TT18基因家族的克隆与比较基因组学研究[D];西南大学;2009年
7 王玉倩;小麦根系非选择性阳离子通道(NSCCs)在钾离子跨膜转移的地位和作用[D];扬州大学;2010年
8 邹珺;新型甘蓝型油菜的遗传改良及其基因组结构分析[D];华中农业大学;2009年
9 许瑞瑞;拟南芥RNA解旋酶AtHELPS和AtRDEM在胁迫响应与生长发育中的功能及机理分析[D];山东农业大学;2011年
10 李怀志;茄子遗传连锁图谱构建及果实相关性状QTL定位[D];上海交通大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李霞;人工合成甘蓝型黄籽油菜粒色基因的精细定位[D];华中农业大学;2009年
2 王黎敏;甜瓜钾离子通道MIRK与植物耐盐性初步研究[D];上海交通大学;2011年
3 吴利民;拟南芥和水稻锚蛋白(ANKP)基因家族初步研究[D];湖南师范大学;2006年
4 李妍;中华补血草(Limonium sinense Kuntze)盐诱导膜蛋白基因的克隆与表达[D];山东师范大学;2007年
5 华佳敏;盐胁迫对作物的影响及外源钙的缓解作用[D];扬州大学;2007年
6 王秋锦;茄子种质资源遗传多样性的RAPD和SSR分析[D];新疆农业大学;2008年
7 王小军;不同土壤肥力配方施肥对淮南小麦产量、品质及肥料吸收利用的影响[D];扬州大学;2008年
8 许花;拟南芥和水稻中mrs2和Shaker基因家族的系统发生比较分析[D];扬州大学;2008年
9 杜娟;甘蓝型油菜及其亲本物种PAP基因家族的克隆与比较基因组学研究[D];西南大学;2008年
10 王加加;马铃薯抗晚疫病基因R10的高分辨率遗传图谱构建[D];东北农业大学;2008年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前7条
1 董娇;周军;辛培尧;许玉兰;刘岩;韦援教;付海辉;;不同植物LDOX/ANS基因的生物信息学分析[J];基因组学与应用生物学;2010年05期
2 陈观水;张铮;周以飞;林生;郭友国;潘大仁;;甘薯IbNPR1基因表达载体的构建及转化烟草[J];热带作物学报;2009年10期
3 张红志,蔡新忠;病程相关基因非表达子1(NPR1):植物抗病信号网络中的关键节点[J];生物工程学报;2005年04期
4 陈观水;周以飞;林生;张铮;潘大仁;;甘薯IbNPR1全长cDNA序列的分离与表达特性分析(英文)[J];作物学报;2009年12期
5 薛永常;聂会忠;刘长斌;;木质素合成酶C3H基因的生物信息学分析[J];生物信息学;2009年01期
6 王旭静;窦道龙;王志兴;贾士荣;;海岛棉GbNPR1基因全长cDNA的克隆及其在烟草中的表达[J];中国农业科学;2006年05期
7 王汉屏;;不同植物防御素的生物信息学分析[J];植物生理学通讯;2008年01期
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 徐胜利;陈小青;林敏娟;王江波;包建平;梁郸娜;王晶晶;田贝贝;;新疆梨PsSFBB基因克隆及其生物信息学分析[J];安徽农业科学;2012年03期
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 赵淑清,郭剑波;植物钾营养性状的遗传潜力[J];西北植物学报;2001年02期
2 张睿;半湿润农田生态系统不同施肥处理对小麦籽粒中氮、磷、钾含量和累积量的效应[J];西北植物学报;2005年01期
3 董合忠,唐薇,李振怀,张冬梅,李维江;棉花缺钾引起的形态和生理异常(英文)[J];西北植物学报;2005年03期
4 赵俊晔;于振文;李延奇;王雪;;施氮量对小麦氮磷钾养分吸收利用和产量的影响[J];西北植物学报;2006年01期
5 张永清;毕润成;庞春花;苗果园;;不同品种春小麦根系对低钾胁迫的生物学响应[J];西北植物学报;2006年06期
6 张定一,王姣爱,贾文兰,阎翠萍;晋南石灰性土壤钾素变化及小麦施钾效果[J];华北农学报;1996年04期
7 于川江,武维华;拟南芥根皮层细胞质膜内向K~+通道电生理特性分析[J];中国科学C辑:生命科学;1999年03期
8 刘仁虎,赵建伟,肖勇,孟金陵;拟南芥cDNA芯片和油菜-拟南芥比较作图相结合筛选甘蓝型油菜抗菌核病先验基因[J];中国科学C辑:生命科学;2005年01期
9 张会民,刘红霞,王林生,王浩,周文利,郭永新,王留好;钾对旱地冬小麦后期生长及籽粒品质的影响[J];麦类作物学报;2004年03期
10 赵会杰,薛延丰;水杨酸和脱落酸对强光所致小麦叶片氧化损伤的防护效应[J];麦类作物学报;2005年04期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 ;国务院关于加快推进现代农作物种业发展的意见[J];种业导刊;2011年05期
2 ;发展中的黑龙江大学农作物研究院——记建校70周年专题报道[J];中国糖料;2011年03期
3 杨晓军;;农作物需水量分析方法探讨[J];现代农业科技;2011年11期
4 韩新生;孙旭亮;孙美芹;张保望;陈炳强;;关于做好农作物新品种评价示范工作的探讨[J];农业科技通讯;2011年07期
5 ;做大做强现代农作物种业[J];甘肃农业;2011年07期
6 武苏明;;农作物病虫害防治探讨[J];现代园艺;2011年13期
7 许小波;;全国现代农作物种业工作会议在长召开[J];湖南农业;2011年07期
8 顾阳;;旱区3种农作物的栽培方案探讨[J];北京农业;2011年12期
9 胡艳霞;叶兰双;于莉波;张慧涛;王丽先;吴艳杰;王亚娟;;农作物遭受冰雹后补救措施[J];吉林农业;2011年07期
10 吴丽;;农作物灌溉制度分类与制定[J];现代农业科技;2011年11期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 王韶屏;王建安;;钾离子通道阻断剂抑制体外培养的骨髓间充质干细胞的增殖[A];2007年浙江省心电生理与起搏学术年会论文汇编[C];2007年
2 吕守芹;龙勉;;钾离子通道Kir2.1/C-末端功能区的分子动力学模拟[A];第八届全国生物力学学术会议论文集[C];2006年
3 钟文宇;;钾离子通道中的力学问题及其计算模拟研究[A];中国计算力学大会'2010(CCCM2010)暨第八届南方计算力学学术会议(SCCM8)论文集[C];2010年
4 吕守芹;龙勉;;钾离子通道KIR2.1C-末端门控开启机制预测[A];庆祝中国力学学会成立50周年暨中国力学学会学术大会’2007论文摘要集(上)[C];2007年
5 张海林;;磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸(PIP_2)对钾离子通道的调节作用[A];中国药理学会第八次全国代表大会暨全国药理学术会议论文摘要汇编[C];2002年
6 张海林;;磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸(PIP_2)对钾离子通道的调节作用[A];中国药理学会第八次全国代表大会论文摘要集(第一部分)[C];2002年
7 瓮占平;潘晓玉;王波;崔娜;王胜蓝;;电压门控式钾离子通道对卵巢癌细胞增殖及细胞周期的影响[A];中华医学会第九次全国妇科肿瘤学术会议论文汇编[C];2006年
8 邹飞;蔡春青;;钾离子通道参与SD大鼠下丘脑神经元热敏感性发育分化的研究[A];中国生理学会第六届应用生理学委员会全国学术会议论文摘要汇编[C];2003年
9 徐江;彭双清;翁谢川;;hERG钾离子通道表达系统的建立及其对药物致QT间期的影响[A];2007年全国药物毒理学会议论文集[C];2007年
10 李卉;姚镜;童晓田;孙亮;潘娜;吴颖;吴厚铭;徐涛;丁久平;;I323残基在钙激活的大电导钾通道中的双重作用[A];第十次中国生物物理学术大会论文摘要集[C];2006年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 王正忠;向农作物要能源[N];中国化工报;2005年
2 余宏章;努力提高农作物防旱抗旱能力[N];孝感日报;2005年
3 郭入源;四川又一批农作物缺陷品种“下课”[N];农民日报;2008年
4 谢汉杰;东山农作物御寒措施到位[N];闽南日报;2008年
5 张亚平;黎川科学指导保障农作物安全过冬[N];抚州日报;2009年
6 记者 张革文;特强沙尘暴造成敦煌十四万亩农作物受灾[N];甘肃日报;2009年
7 本报记者 赖有生;暴雨漫浸坦洲万亩农作物[N];中山日报;2009年
8 刘克愚;双柏县抓实农作物中耕管理[N];楚雄日报(汉);2009年
9 记者 庄俊康;去年我省农作物发生灾害1.24万亩次[N];甘肃经济日报;2010年
10 记者 彭仲 通讯员 胡沛 黄农轩;2.5万亩农作物受灾 黄陂千余干群全力抗灾[N];长江日报;2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 王平;农作物重金属污染胁迫遥感弱信息增强与计算[D];东北师范大学;2010年
2 周冬生;鼠疫耶尔森氏菌比较和进化基因组学研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2004年
3 左波;猪3、4和7号染色体QTL定位及六个候选基因的分离、鉴定[D];华中农业大学;2004年
4 孙涛;多西紫杉醇对人乳腺(癌)细胞增殖、侵袭力及钾离子通道特性的影响[D];中国医科大学;2005年
5 戴二黑;鼠疫耶尔森氏菌基因分型与适应性微进化研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2005年
6 林莉;牙龈卟啉单胞菌高毒力株W83致病基因筛选[D];中国医科大学;2006年
7 王效义;鼠疫耶尔森氏菌与假结核耶尔森氏菌比较基因组学研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2005年
8 樊东;几种鳞翅目昆虫几丁质酶基因的克隆与表达研究[D];东北农业大学;2004年
9 徐卓菲;胸膜肺炎放线杆菌和猪瘟病毒的基因组测序与比较基因组学研究[D];华中农业大学;2008年
10 王菁;TASK-1在SD大鼠呼吸中枢的表达及其与睡眠呼吸暂停现象之间的关系[D];河北医科大学;2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 邵爱云;红海束毛藻Ⅱ组内含子的鉴定及其剪接机理的研究[D];东华大学;2008年
2 冯秀芳;六六六在关中盆地典型土壤中的迁移转化规律研究[D];长安大学;2006年
3 卢雅薇;番木瓜环斑病毒海南分离物(PRSV-HN)全基因组克隆与序列分析[D];华南热带农业大学;2007年
4 李艳;重组苏云金芽孢杆菌丙酮酸脱氢酶表达条件的优化及结构预测[D];华中师范大学;2008年
5 耿艳辉;泾河流域植被生态需水量研究[D];山东师范大学;2005年
6 杨毅超;基于Web数据挖掘的作物商务平台分析与研究[D];湖南农业大学;2008年
7 王东兰;紫茎泽兰细胞色素P450 CYP75基因的克隆与鉴定[D];广西大学;2005年
8 李和平;河南省猪繁殖与呼吸综合征流行病学调查[D];西北农林科技大学;2006年
9 王林;一株高致病性鸡传染性贫血病毒的生物学及基因组特性[D];山东农业大学;2009年
10 刘娜;比较基因组学平台的设计与构建[D];南方医科大学;2010年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026