收藏本站
《蚕业科学》 2018年02期
收藏 | 投稿 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

杆状病毒与昆虫和沙雷氏菌间的几丁质酶基因密码子使用模式分析

石生林  张莹  周敬林  刘彦群  秦利  
【摘要】:为阐明杆状病毒几丁质酶基因(v-Chi A)密码子使用在病毒基因组进化的基因水平转移中发生的适应性变化,比较分析了杆状病毒v-Chi A与昆虫几丁质酶基因(Chi-h)、沙雷氏菌几丁质酶基因(Chi A)以及杆状病毒以lef-8、lef-9和polh/gran基因为代表的基因组(表示为lef8-lef9-pg)的密码子使用模式。结果表明,杆状病毒v-Chi A与昆虫Chi-h的GC含量、GC3s含量、有效密码子数(ENc)及与沙雷氏菌Chi A的GC含量均无统计学差异(P0.05);与杆状病毒lef8-lef9-pg的GC含量、GC3s含量、ENc值以及沙雷氏菌Chi A的GC3s含量、ENc值均有统计学差异(P0.05)。杆状病毒v-Chi A与lef8-lef9-pg、昆虫Chi-h和沙雷氏菌Chi A的同义密码子使用均高度相似(相似性系数分别为0.992、0.870、0.862)。选择与突变共同影响杆状病毒v-Chi A和lef8-lef9-pg的密码子使用,而昆虫Chi-h和沙雷氏菌Chi A的密码子使用完全由选择所影响。综上所述,杆状病毒v-Chi A的碱基组成及密码子偏好性与昆虫Chi-h相似,与lef8-lef9-pg不同;密码子使用的影响因素与lef8-lef9-pg相似,与昆虫Chi-h和沙雷氏菌Chi A不同。上述结果从密码子使用角度证实了杆状病毒v-Chi A来源于昆虫Chi-h的水平转移。

【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 辛华;;利用杆状病毒以虫治虫[J];国际科技交流;1987年09期
2 王文兵,张志芳,何家禄,吕鸿声,public.zj.js.cn;杆状病毒基因组DNA复制相关基因的研究进展[J];生物化学与生物物理进展;2000年03期
3 刘强,丁翠;杆状病毒部分功能基因的研究进展[J];病毒学报;2001年02期
4 乌慧玲;曾黎平;吴岩;;杆状病毒基因分子进化研究的新方法[J];蚕业科学;2005年04期
5 刘高强;余晓丹;;昆虫杆状病毒分子生物学及其应用研究的新进展[J];安徽农业科学;2006年09期
6 马景霞;;昆虫杆状病毒作为外源基因表达载体的应用[J];中国家禽;2008年11期
7 单晓红;唐平;张雨;徐攀;;基于全基因组数据的杆状病毒进化研究进展[J];科技创新导报;2009年28期
8 雷求刚;徐增辉;钱其军;;腺相关病毒载体的杆状病毒生产系统的构建[J];浙江理工大学学报;2010年05期
9 胡裕文,智刚;杆状病毒的分子生物学研究进展[J];病毒学报;1988年02期
10 代小江,庞义;杆状病毒的寄生范围决定因子[J];中山大学学报(自然科学版);1996年S2期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 贾园;沈阳;邱亚峰;史子学;邵东华;赵福广;马志永;;杆状病毒的应用[A];中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第二次学术研讨会论文集[C];2010年
2 段宇;周红文;李倩;汪承亚;赵红;覃又文;刘超;陈家伟;;利用杆状病毒载体在家蚕幼虫中高效表达人胰岛素样生长因子-1(hIGF-1)的研究[A];中华医学会第六次全国内分泌学术会议论文汇编[C];2001年
3 郑水莲;钱鸣蓉;李新;陈枢青;曾苏;;利用细菌/杆状病毒在系统昆虫细胞中表达人类UGT1A6[A];首届长三角科技论坛——长三角生物医药发展论坛论文集[C];2004年
4 谈莹;姜凌;王曼丽;尹飞飞;邓菲;刘买利;胡志红;王华林;;杆状病毒囊膜蛋白融合肽的NMR结构和功能研究[A];第十五届全国波谱学学术会议论文摘要集[C];2008年
5 陈桂华;吴碧华;;杆状病毒螺旋参数的测定[A];第六次全国电子显微学会议论文摘要集[C];1990年
6 姚伦广;周文科;徐华;阎锋;齐义鹏;;杆状病毒囊膜蛋白P74在初级侵染过程中作用机制的研究[A];湖北省生物工程学会2004年年会学术报告及论文摘要汇编[C];2004年
7 刘长明;陆月华;张超范;刘焕章;;猪圆环病毒2型重组Cap蛋白在昆虫杆状病毒中的表达[A];中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第六次研讨会论文集[C];2005年
8 许信刚;童德文;;猪瘟病毒NS3非结构蛋白在杆状病毒表面的展示(英文)[A];中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第十六次学术研讨会、中国病理生理学会动物病理生理专业委员会第十五次学术研讨会论文集[C];2009年
9 叶志毅;刘红;SUKVNYA;付春青;王伟刚;;人体血液凝固阻害因子(TFPI)在家蚕中的表达[A];中国蚕学会第三届青年学术研讨会暨浙江省第二届青年学术论坛——蚕桑分论坛论文集(上册)[C];2001年
10 张光亚;刘桂兰;方柏山;;敏捷气热菌(Aeropyrum pernix)基因组密码子使用偏好分析[A];华东六省一市生物化学与分子生物学会2003年学术交流会论文摘要集[C];2003年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 文莉;杆状病毒定点标记及侵染行为动态示踪[D];武汉大学;2015年
2 姚相杰;杆状病毒介导的丙肝病毒可感染体外细胞培养体系的建立[D];中国科学院研究生院(武汉病毒研究所);2007年
3 梁昌镛;杆状病毒与哺乳动物细胞相互作用的研究[D];中国科学院研究生院(武汉病毒研究所);2005年
4 王鑫;杆状病毒复制和基因表达的表观遗传学调控研究[D];复旦大学;2010年
5 陈寅;杆状病毒基因组扫描技术筛选病毒因子和顺式元件及其表达系统的应用[D];中国农业科学院;2006年
6 宋建华;杆状病毒介导的基因表达及p35抗生物和非生物胁迫的研究[D];中国科学院研究生院(武汉病毒研究所);2006年
7 董春升;杆状病毒p10基因的结构和功能研究[D];中国科学院研究生院(武汉病毒研究所);2006年
8 程通;利用优化后的杆状病毒转导方法构建人乳头瘤病毒假病毒体外感染模型[D];厦门大学;2006年
9 林旭瑷;杆状病毒泛素、多角体基因启动子分析及表达系统的应用[D];中国农业科学院;2006年
10 葛晶;昆虫杆状病毒AcMNPV ORF38的功能研究及特异性转导B淋巴细胞的重组杆状病毒的构建[D];复旦大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 欧艳梅;抗宿主细胞凋亡策略以优化杆状病毒表达载体[D];西北农林科技大学;2015年
2 易命;火地塘林区昆虫和杆状病毒多样性调查[D];西北农林科技大学;2015年
3 陈小红;2型猪圆环病毒衣壳蛋白的表达生产[D];华东理工大学;2016年
4 聂艳如;PPRV H蛋白的单克隆抗体制备与在杆状病毒中的表达[D];华中农业大学;2016年
5 薛亚男;杆状病毒VLF-1蛋白磷酸化位点功能研究[D];扬州大学;2016年
6 周锋;在早期感染阶段Sf9细胞吸附杆状病毒动力学研究[D];武汉工程大学;2016年
7 黎润彩;杆状病毒AcMNPV microRNA MR40 的鉴定及其靶基因初探[D];中山大学;2015年
8 李俪;提高杆状病毒介导的外源基因表达水平的研究[D];复旦大学;2007年
9 夏爱华;柞蚕杆状病毒基因组的初步研究及家蚕Yellow基因家族的克隆和序列分析[D];山东农业大学;2006年
10 黄春旭;鸡传染性法氏囊病病毒VP2蛋白在杆状病毒表面的展示及其免疫原性研究[D];西北农林科技大学;2010年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026