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《北京农学院学报》 2007年04期
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一种高效提取高海拔地区土壤微生物总DNA的方法

刘振静  杨凯  李潞滨  周金星  
【摘要】:为优质、高效地提取高海拔地区土壤微生物基因组DNA,在综合了多种土壤微生物DNA提取方法的基础上,采用双酶—改良酚氯仿DNA提取法提取了3份高海拔地区土壤样品的DNA,同时比较了其他3种常用方法的提取产率和纯度,该方法优于其他3种方法。采用PVP缓冲液预洗,去除腐殖酸;DNA提取液、溶菌酶和蛋白质酶K共同裂解土壤微生物细胞,保证获得大片段的DNA,提高DNA产率;酚氯仿法抽提,简便易操作,能有效地去除蛋白质和其他杂质。该方法是一种简便高效、适用于高海拔、生境类型复杂的土壤样品DNA提取的方法,DNA质量可满足PCR扩增的要求。

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【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
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2 范运梁;盐生植物对黄河三角洲微生物多样性的影响[D];山东师范大学;2010年
3 种斌;烟田土壤青枯菌的分子检测技术及应用[D];河南农业大学;2010年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前6条
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3 李慧,陈冠雄,张颖,张成刚;分子生物学方法在污染土壤微生物多样性研究中的应用[J];土壤学报;2004年04期
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【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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2 李建辉;路盼盼;张亚平;;新疆泥火山土壤宏基因组DNA的提取方法研究[J];安徽农业科学;2010年23期
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4 樊永军;闫伟;王黎元;;油松外生菌根真菌对其幼苗根际其它真菌的影响[J];北方园艺;2009年02期
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6 张宗舟;张扬;陈志梅;;小陇山不同林地土壤微生物多样性研究[J];草业科学;2010年11期
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9 尹伟;胡玉昆;柳妍妍;公延明;张伟;刘伟;阿德列提·艾列吾塔力甫;;巴音布鲁克不同建植期人工草地土壤生物学特性研究[J];草业学报;2010年05期
10 邹雨坤;张静妮;杨殿林;陈秀蓉;张天瑞;赵建宁;赵帅;;不同利用方式下羊草草原土壤生态系统微生物群落结构的PLFA分析[J];草业学报;2011年04期
中国重要会议论文全文数据库 前4条
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2 毕明丽;宇万太;;农田生态系统微生物多样性研究方法及应用[A];中国土壤学会第十一届全国会员代表大会暨第七届海峡两岸土壤肥料学术交流研讨会论文集(下)[C];2008年
3 吴银宝;史金才;蓝小花;陈文燕;;猪粪和土壤样品中微生物DNA提取方法的比较[A];良好农业规范与畜牧业健康发展——中国畜牧兽医学会家畜生态学分会第六届理事会暨学术研讨会论文集[C];2006年
4 李娜娜;李天昕;;贵州省典型酸雨区酸化土壤修复方案试验研究[A];2012中国环境科学学会学术年会论文集(第三卷)[C];2012年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 文都日乐;呼伦贝尔主要草地类型植被特征、土壤特性与微生物多样性研究[D];内蒙古农业大学;2011年
2 闫晗;露天煤矿排土场土壤微生物生态特征及土壤质量评价[D];辽宁工程技术大学;2011年
3 周际海;线虫与微生物相互作用及其对污染土壤扑草净降解影响的研究[D];南京农业大学;2011年
4 李俊华;施用微生物有机肥调控棉花黄萎病土壤微生物区系及效应研究[D];南京农业大学;2011年
5 高赞东;东营市油气区水土污染修复治理试验研究[D];中国地质大学(北京);2012年
6 段学军;淹水稻田土壤微生物对镉污染毒性的生理生态反应及其抗性czcC基因的克隆与表达[D];浙江大学;2004年
7 陈宏宇;不同品种和不同茬口大豆根面及根际的微生物群落结构分析[D];中国农业大学;2005年
8 张于光;三江源国家自然保护区土壤微生物的分子多样性研究[D];湖南农业大学;2005年
9 耿玉清;北京八达岭地区森林土壤理化特征及健康指数的研究[D];北京林业大学;2006年
10 宗美娟;房干生态恢复区地上植被和地下微生物研究[D];山东大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 金鑫;稻瘟病生防菌Af1、Af4的初步研究[D];华中农业大学;2010年
2 胡英畅;黄瓜根际土壤细菌种群及酮基合酶基因多样性与黄瓜枯萎病发病关系研究[D];沈阳农业大学;2010年
3 李芳;基于磁性微粒的法医样本DNA纯化[D];西北大学;2011年
4 李小永;细菌型豆豉后发酵期间菌相分析及产蛋白酶菌种的筛选[D];山东农业大学;2011年
5 倪娜;降解柴油酵母菌的分离纯化及性质研究[D];曲阜师范大学;2011年
6 田慧;应用双荧光T-RFLP对大连溢油污染区的生物评价[D];大连海事大学;2011年
7 张飞鹏;枯草芽孢杆菌X2菌株的筛选与应用[D];黑龙江八一农垦大学;2011年
8 高志武;PCR技术应用于啤酒腐败菌的快速检测[D];兰州理工大学;2010年
9 赵官成;不同栽培方式下玉米根际微生物组成、生物量及其酶活性研究[D];陕西师范大学;2011年
10 唐庆明;凉水原始红松林植被及土壤微生物功能多样性的研究[D];东北林业大学;2011年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 董晓霞,郭洪海,孔令安;滨海盐渍地种植紫花苜蓿对土壤盐分特性和肥力的影响[J];山东农业科学;2001年01期
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3 朱圣杰,丁克坚,檀根甲;植物细菌性青枯病的生物防治研究进展[J];安徽农业科学;2003年04期
4 常凯军;谭德冠;李定琴;孙雪飘;张家明;;海南橡胶藻18S rDNA与16S rDNA二级结构构建及分析[J];安徽农业科学;2009年27期
5 陈倩颖;胡子全;刘连生;许娜娜;赵海泉;;6株解有机磷细菌的分离鉴定[J];安徽农业大学学报;2009年03期
6 李鹏;毕学军;汝少国;;DNA提取方法对活性污泥微生物多样性PCR-DGGE检测的影响[J];安全与环境学报;2007年02期
7 涂传青;马鲁铭;;金属铁还原降解2,4-二硝基甲苯的实验研究[J];环境科学与管理;2005年05期
8 赵保国;刘玉存;常双君;;超临界水氧化处理二硝基甲苯废水研究[J];火炸药学报;2007年02期
9 赵朝成,赵东风;超临界水氧化技术处理硝基苯废水研究[J];重庆环境科学;2001年03期
10 付洪冰;赵曦;崔崇士;;黑龙江省南瓜疫病菌遗传多样性分析[J];东北农业大学学报;2009年10期
中国博士学位论文全文数据库 前4条
1 张于光;三江源国家自然保护区土壤微生物的分子多样性研究[D];湖南农业大学;2005年
2 雷娟利;蔬菜土壤生态系统微生物分子生态学研究[D];浙江大学;2006年
3 赵勇;应用分子生物学技术解析不同处理状况下土壤微生物群落结构的变化[D];南京农业大学;2005年
4 蒋云霞;基于红树林土壤微生物资源研发的宏基因组学平台技术的建立与应用初探[D];厦门大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前5条
1 焦晓丹;利用RAPD技术研究设施不同种植年限土壤微生物多样性[D];东北农业大学;2004年
2 杨建;红树林土壤总DNA不同提取方法比较研究以及Ⅰ型聚酮合成酶基因检测[D];华南热带农业大学;2006年
3 王国荣;东祁连山高寒灌丛草地土壤微生物的季节动态和生态分布[D];甘肃农业大学;2006年
4 肖勇;16S rRNA/rDNA序列分析技术应用于环境微生物群落的初步研究[D];湖南大学;2007年
5 王晓坤;耐盐植物根际微域对含盐环境中偶氮染料的脱色研究[D];大连理工大学;2008年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 赫福霞;谢桐音;谢桂林;付荣恕;;东营盐生植物园土壤动物群落多样性研究[J];生物安全学报;2012年02期
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 吴向华;苏北海滨盐土对3种耐盐植物种植的响应研究及其微生物资源化利用探索[D];南京大学;2012年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 徐德昌,赵亚华,杜天奎;植物总DNA和核DNA提取及其纯度的研究[J];宁夏农学院学报;1997年03期
2 白清云;土壤微生物群落结构的化学估价方法[J];农业环境保护;1997年06期
3 王勐骋,杨永华,姚健;利用RAPD分子标记研究农用化学品污染土壤微生物群落的分子多样性(英文)[J];南京大学学报(自然科学版);2000年04期
4 梁威,邱东茹,熊丽,吴振斌;荧光原位杂交技术(FISH)及其在环境微生物学中的应用[J];生命科学;2002年03期
5 姚健,杨永华,沈晓蓉,陆维忠;农用化学品污染对土壤微生物群落DNA序列多样性影响研究[J];生态学报;2000年06期
6 陆利华,张家洵,朱一川;变性梯度凝胶电泳装置及其在DNA突变检测中的初步应用[J];生物技术通讯;2001年03期
7 陆利华,张家洵,朱一川;用变性梯度凝胶电泳分析PCR克隆的突变率[J];生物技术通讯;2001年04期
8 马万里,Josquin Tibbits,Mark Adams;土壤微生物多样性研究的新方法[J];土壤学报;2004年01期
9 滕应 ,骆永明 ,赵祥伟 ,李振高 ,宋静 ,吴龙华;重金属复合污染农田土壤DNA的快速提取及其PCR-DGGE分析[J];土壤学报;2004年03期
10 张华勇,李振高,王俊华,潘映华;红壤生态系统下芽孢杆菌的物种多样性[J];土壤;2003年01期
【相似文献】
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1 何燕,卓嘎,旦巴;SDS法提取青稞叶片总DNA的改进方法[J];西藏科技;2005年07期
2 朱灵峰;张乐;王海燕;周岳溪;张召耀;王业耀;雷书凤;;河流沉积物中微生物DNA的提取方法比较研究[J];环境工程学报;2011年04期
3 陈燕;;不同pH值对DNA提取率的影响[J];安徽农业科学;2008年05期
4 田再民;龚学臣;季伟;;小麦DNA提取方法的比较[J];河北北方学院学报(自然科学版);2009年04期
5 杜晓光;;三种土壤微生物DNA提取方法的比较[J];科技信息(学术研究);2007年15期
6 贾学渊;白素英;徐艳春;张伟;;鞣制皮张DNA的提取[J];东北林业大学学报;2007年11期
7 张锐;孙美榕;林洽辉;杨燕贞;曾苑玲;;鱼类基因组DNA提取方法的优化及PCR扩增[J];水利渔业;2006年04期
8 孟霞;常天军;;提取西藏油菜总DNA的一种方法[J];西藏科技;2010年08期
9 刘胜洪;刘文;刘明峰;杨凤婷;刘庆生;梁红;;一种高效提取猕猴桃DNA和RNA的方法[J];生物技术通报;2011年09期
10 赵吉强;郭善利;陈世华;刘翠鲆;;几种微量提取盐芥DNA方法的比较[J];安徽农业科学;2008年05期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
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2 陈惠云;孙志栋;王晓武;葛红;;春兰DNA提取影响因子分析[A];长三角现代植物生物学与农业专题论坛论文集[C];2005年
3 陆佳飞;周克隆;王缦;;磁珠法快速提取乙型肝炎病毒DNA的研究及其在诊断试剂中的应用[A];第五次全国免疫诊断暨疫苗学术研讨会论文汇编[C];2011年
4 许峰;刘宇;王守现;赵爽;魏民;耿小丽;孟莉莉;;一种简便易行的食用菌基因组DNA提取方法[A];第九届全国食用菌学术研讨会摘要集[C];2010年
5 郭娴;张寒霜;赵俊丽;王永强;;高盐低pH值法提取棉花基因组DNA研究[A];中国棉花学会2011年年会论文汇编[C];2011年
6 王桂云;朱志祥;;海产贝类DNA提取及PCR扩增[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学分会第五次代表大会暨第七次学术讨论会论文集[C];1995年
7 林丽美;刘塔斯;周小江;;分子标记中植物DNA提取方法的研究进展[A];全国第六届天然药物资源学术研讨会论文集[C];2004年
8 何夙旭;周志刚;姚斌;白东清;;3种DNA提取方法对养殖池塘不同生境菌群PCR-DGGE分析的影响[A];饲用酶制剂开发与应用技术交流研讨会论文集[C];2010年
9 刘海英;陈刚;步宇翔;;碱基对的多铜修饰对DNA导电性的增强作用[A];中国化学会第28届学术年会第13分会场摘要集[C];2012年
10 赵宏远;李俊杰;桑润滋;;单细胞凝胶电泳技术检测不同处理山羊精子DNA损伤[A];中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会第十五届学术研讨会论文集(下册)[C];2010年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 陈杰;信息技术将重组汽车DNA[N];科技日报;2010年
2 刘霞;科学家研发出新型人工合成DNA载体[N];科技日报;2010年
3 南方;化危为机 企业需韧性生长的DNA[N];中国企业报;2009年
4 吴强;港大引新技术DNA辨食材[N];中国食品质量报;2010年
5 本报记者 施晓焰 通讯员 马丽娟;云南:DNA数据库成“打拐”得力帮手[N];人民公安报;2009年
6 张巍巍;垃圾DNA可促进癌症发展首获证实[N];科技日报;2010年
7 常丽君;虱子DNA表明人类17万年前首次穿衣[N];科技日报;2011年
8 记者 冯卫东;DNA碱基序列决定其光敏性假设获证实[N];科技日报;2008年
9 许文强;拆、装更便捷的DNA双螺栓结构模型[N];大众科技报;2008年
10 记者 常丽君;研究人员发现自组装DNA链的最佳长度[N];科技日报;2010年
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1 郭晓兰;端粒功能异常诱导的DNA损伤反应及其在肿瘤发生中的作用与分子机制[D];重庆医科大学;2010年
2 陈志健;1.8 GHz微波对X射线和阿霉素致淋巴细胞DNA损伤修复及对蛋白表达的影响[D];浙江大学;2010年
3 朱慧芳;Y家族DNA聚合酶对化学致癌物MNNG应答的转录调控研究[D];浙江大学;2009年
4 万超;抗猪瘟嵌合DNA疫苗及TRIF的DNA疫苗佐剂效应研究[D];武汉大学;2009年
5 赵丽霞;克隆绵羊印记相关基因的DNA甲基化研究[D];内蒙古农业大学;2010年
6 沈美龙;基于DNA免疫的乙型肝炎病毒表面抗原大中小蛋白的免疫原性研究[D];南京医科大学;2010年
7 徐铁刚;细菌DNA磷硫酰化修饰与限制[D];上海交通大学;2008年
8 高鹏;特异性介导DNA转导的多结构域嵌合蛋白的构建、表达及鉴定[D];吉林大学;2011年
9 康大伟;DNA分子器件场效应理论研究[D];山东大学;2010年
10 高天;基于寡核苷酸芯片的地中海贫血特异性DNA甲基化的研究[D];第三军医大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李秦豫;野生塔里木马鹿粪便DNA提取方法和性别鉴定研究[D];新疆大学;2010年
2 刘刚;普氏野马粪便DNA方法优化及应用的可行性研究[D];北京林业大学;2011年
3 李靖宇;草原湿地土壤总DNA提取方法及其在氨氧化微生物研究中的应用[D];内蒙古大学;2011年
4 李芳;基于磁性微粒的法医样本DNA纯化[D];西北大学;2011年
5 芦丽淦;柚皮素及聚乙二醇增强乙肝DNA疫苗免疫效果的研究[D];河南大学;2010年
6 杨锦艳;六种香豆素有效成分与DNA相互作用的研究[D];山西医科大学;2010年
7 林启凰;用于乳腺蛋白标志基因检测的DNA电化学生物传感器的研究[D];福建医科大学;2010年
8 于文静;亚麻韧皮部特异启动子克隆与26份种质DNA指纹图谱构建[D];中国农业科学院;2010年
9 Rebecca Simisola Agboola;硼(B)和氯化钠胁迫处理诱导高粱(Sorghum bicolor)自交系发生形态和DNA甲基化的变异[D];东北师范大学;2010年
10 石微;溴氰菊酯致大鼠DNA损伤及损伤后修复功能的影响[D];青岛大学;2010年
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