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黄河裸裂尻鱼细胞色素C氧化酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ亚基基因的克隆及序列特征分析

晁燕  祁得林  申志新  王国杰  杨成  
【摘要】:采用RT-PCR技术克隆获得了黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi)COⅠ、Ⅱ、Ⅲ基因的编码序列,并对此进行了初步分析。结果表明,黄河裸裂尻鱼COⅠ基因全长为1 551 bp,开放阅读框(ORF)由基因全长组成,编码516个氨基酸;COⅡ基因全长为691 bp,开放阅读框为690 bp,编码230个氨基酸;COⅢ基因全长为786 bp,其开放阅读框也是由基因全长组成,编码261个氨基酸。序列同源性分析显示,黄河裸裂尻鱼与其他9种鲤科鱼类3个亚基在基因和氨基酸序列上均有较高的同源性,虽然不同物种亚基基因间存在序列差异,但是所编码的氨基酸序列却趋于一致,揭示了鲤科鱼类细胞色素C氧化酶在线粒体呼吸链电子传递中的功能稳定性。黄河裸裂尻鱼与滇池金线鲃(Sinocyclocheilus grahami)在COⅠ和COⅡ亚基上均存在相同位置、相同种类和相同数量的功能位点,而且在基于COⅠ亚基基因和氨基酸序列、COⅡ及COⅢ亚基基因序列的系统发育树中聚在同一支上,表明两者具有较近的亲缘关系,该结论与裂腹鱼亚科鱼类起源于晚第三纪广泛分布于青藏地区的喜温性原始鲃类的观点相一致。

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