小鼠基因组中的微卫星重复序列的数量、分布和密度(英文)

童晓玲代方银李斌余泉友夏庆友鲁成

【摘要】：作者分析了老鼠基因组中各染色体及其内含子、外显子和基因间区上各种类型的微卫星(1-6个碱基的重复序列)的数量及其密度。SSR约占老鼠基因组的2.85%,其中46.2%存在于基因间区,4.75%存在于外显子,49.05%在内含子区域,即非编码区富含微卫星。微卫星的数量与染色体或基因区域的大小有关,但密度与染色体或基因区域的大小的关系并不十分密切。第4染色体的外显子区域中6种类型的SSR含量都比其它区域少。A,T,AC,AG,AT,AAC,AAG,AGG,AAAC,AAAG,AAAT,AACC,AAAAC,AAAAG,AAAAT,AAACC,AAAGG,AAGAG,AAAAAC,AAAAAG,AAAAAT,AAAGAG,ACACAT,ACAGAG,ACAGGC,ACATAT是老鼠基因组中主要的SSR类型,而一些5碱基重复单元的SSR在老鼠基因组的某一条甚至某几条染色体都不存在

【作者单位】：西南农业大学蚕桑生物技术学院西南农业大学蚕桑生物技术学院西南农业大学蚕桑生物技术学院西南农业大学蚕桑生物技术学院西南农业大学蚕桑生物技术学院西南农业大学蚕桑生物技术学院
【关键词】：老鼠 微卫星 数量分布密度 基因组
【基金】：ThisworkwassupportedagrantfromtheChineseNational973program(No.2005CB121000)andtheNationalNaturalScienceFoundationofChina(No.30300262)
【分类号】：Q953
【正文快照】：

Microsatellites,orsimplesequencerepeats(SSR),aredefinedastandemlyrepeatedsequencesof sixbasepairsorless.Theyareubiquitousinprokary otesandeukaryotes,andpresenteveninthesmallestbacterialgenomes(FieldandWills,1996;Hancock,1996).Recently,researcherspresumet

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1	曹丽君;现代所有纯种赛马祖先一共也就28匹[N];新华每日电讯;2005年
2	记者陈卫东;人类基因组南方研究中心 10年成就显著[N];科技日报;2008年
3	王艳红;企鹅进化之快惊人，只因冰山崩解无常[N];新华每日电讯;2005年

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1	郭文久;微卫星在基因组上的分布与功能及其计算方法初步研究[D];四川农业大学;2004年
2	李丽;系统性红斑狼疮抗核抗体易感基因染色体定位研究[D];中国医科大学;2004年
3	严学兵;披碱草属植物遗传多样性研究[D];中国农业大学;2005年
4	王芋华;粗枝云杉（Picea asperata Mast.）天然群体的遗传变异[D];中国科学院研究生院（成都生物研究所）;2006年
5	吴宝金;ENU诱导小鼠突变及对部分突变基因的定位克隆[D];扬州大学;2004年
6	蒋萍萍;白颈长尾雉保护遗传学研究[D];浙江大学;2005年
7	孙海芹;独花兰和扇脉杓兰的传粉生态学[D];中国科学院研究生院（植物研究所）;2005年
8	刘美华;长柄水青冈种群遗传结构和系统地理学研究[D];华东师范大学;2008年
9	商海涛;实验用小型猪细胞色素P450家族新基因克隆及其CYP3A29基因多态研究[D];第三军医大学;2007年
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1	闫志峰;Beagle 犬微卫星DNA多态性研究[D];扬州大学;2004年
2	张菲菲;黑线仓鼠（Cricetulus barabensis）FSHβ基因研究与SSR座位筛选[D];曲阜师范大学;2009年
3	胡国富;用微卫星及ISSR法对羊草（Aneurolepidium Chinense （Trin） Kitag）遗传多样性的研究[D];东北农业大学;2002年
4	易湘蓉;普氏原羚食性分析及分子生态学研究[D];湖南农业大学;2005年
5	朱立峰;现生鸟类的早期演化和三趾鹑类的分子系统发生与鹭科鸟类微卫星等位基因进化研究[D];南京师范大学;2004年
6	陈兵;瞳孔异位与白斑两种突变小鼠的基因定位和白斑候选基因的序列分析[D];扬州大学;2005年
7	牛银波;IL1RAPL1基因上两个微卫星的多态性分布及与秦巴山区儿童智力的相关性分析[D];西北大学;2006年
8	徐鹏;中国对虾微卫星标记的筛选[D];中国科学院研究生院（海洋研究所）;2002年
9	洪艳云;SSR在普氏原羚个体识别和分子保护遗传学中的应用[D];湖南农业大学;2004年
10	王韶辉;利用微卫星标记对蚜虫种群遗传多样性的初步研究[D];陕西师范大学;2003年

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