收藏本站
《安徽农业科学》 2018年16期
收藏 | 投稿 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

沙田柚类蛋白激酶基因的鉴定及生物信息学分析

陈锦玲  徐媛  陈玉梅  李璐璐  李惠敏  秦新民  
【摘要】:[目的]研究沙田柚类蛋白激酶基因编码的蛋白质序列所包含的生物信息学。[方法]利用高通量测序对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到沙田柚类蛋白激酶基因序列。采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构以及功能域等方面进行预测和分析。[结果]该基因全长为2 323 bp,开放阅读框(ORF)全长为1 560 bp(Genbank登录号:MG925820),共编码519个氨基酸,分子质量为57.39 kD,等电点PI为8.55。该蛋白质含有1个植物STKc IRAK蛋白家族的保守结构域,为亲水性稳定蛋白。氨基酸序列分析表明,其编码的氨基酸与克莱门柚和甜橙的同源性分别为100%、99%。系统进化树表明沙田柚类蛋白激酶基因与克莱门柚和甜橙亲缘关系很近,属于同一进化分支。[结论]该研究结果可为今后深入研究沙田柚自交不亲和机理提供参考。

【相似文献】
中国期刊全文数据库 前7条
1 李凤梅;;植物丝裂原活化蛋白激酶激酶的生物信息学分析[J];北方园艺;2010年03期
2 董凤英;王家保;徐碧玉;金志强;;荔枝LcAsr基因的生物信息学分析与载体构建[J];热带作物学报;2009年05期
3 曹颖;唐晓凤;刘永胜;;番茄COBRA基因克隆、表达模式及生物信息学分析[J];植物研究;2012年03期
4 冯媛媛;侯佩;李颖楠;刘永胜;;番茄ARF2蛋白的生物信息学分析与亚细胞定位[J];生物化学与生物物理进展;2012年01期
5 刘炜婳;赖钟雄;;福州宦溪野生蕉(Musa spp.,AB group)2个PSAG成员的克隆及生物信息学分析[J];热带作物学报;2013年01期
6 张弢;向珣;叶纨芝;余小林;曹家树;;芜菁花粉发育相关基因Bc MF2r的分子克隆及其生物信息学分析[J];浙江大学学报(农业与生命科学版);2006年06期
7 王昶童;曹刚强;梁丛敏;谢冰心;闫飞翔;;黄瓜NBS类抗病基因类似物的生物信息学分析[J];北方园艺;2014年14期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 苑赞;赵锦;刘孟军;;枣花粉过敏原Zizj1基因的克隆与生物信息学分析[A];第八届全国干果生产、科研进展学术研讨会论文集[C];2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 杨星;沙田柚宜昌橙杂种育性与有性后代的培育[D];西南大学;2017年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026