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《安徽农业科学》 2012年16期
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PmC47-8株OmpH蛋白结构的初步预测

繁萍  张瑞强  张卫  丰琳琅  陈忍霞  赵静  
【摘要】:[目的]初步预测牦牛源多杀性巴氏杆菌C47-8株(PmC47-8)OmpH蛋白结构特点。[方法]对PmC47-8型菌株OmpH基因的测序结果进行在线BLAST比对、信号肽预测、二级结构预测及蛋白特性等方面的分析。[结果]PmC47-8株OmpH基因与已公布的81条OmpH基因相似性在84%~99%间;OmpH蛋白序列中存在信号肽,切割位点在第20号和21号氨基酸残基之间;OmpH蛋白二级结构预测中,折叠结构占49.8%,环状结构占50.2%;推测OmpH蛋白有7个O型糖基化位点,分别是位于第2、45、48、330、716、721、723号位的氨基酸残基,2个N型糖基化位点,即第15和35号位的氨基酸残基。[结论]该蛋白可能存在于细胞菌膜的外侧,而非跨膜蛋白。
【作者单位】青海大学农牧学院;
【基金】:青海大学高层次人才项目(2008-QGC-7)
【分类号】:S852.612

【参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 徐建华,朱家勇;生物信息学在蛋白质结构与功能预测中的应用[J];医学分子生物学杂志;2005年03期
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 张广宇;口蹄疫病毒3A蛋白结构预测及功能分析[D];中国农业科学院;2007年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前5条
1 郑蓉;郑维鹏;方伟;;DNA分子标记在竹子分类研究中的应用[J];福建林业科技;2006年03期
2 徐建华;朱家勇;庄俊华;张秀明;;基于Internet的生物信息资源快速查找与利用[J];广东药学院学报;2006年02期
3 徐建华;朱家勇;金小宝;许琴英;;家蝇幼虫抗菌肽Attacin基因的克隆表达及抑菌生物学活性(英文)[J];医学分子生物学杂志;2007年01期
4 朱海燕;;现代信息技术在生物信息学研究中的应用[J];情报探索;2006年08期
5 强毅;;植物蔗糖磷酸合成酶的生物信息学分析[J];现代生物医学进展;2007年04期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 杨长平;;生物信息学在畜禽基因组研究中的应用[A];中国农业信息科技创新与学科发展大会论文汇编[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 张永红;小麦条锈菌cDNA文库构建和表达序列标签(ESTs)分析[D];西北农林科技大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前8条
1 郭强;窄范围pH梯度干胶条可提高胃癌细胞蛋白质组表达谱分辩率[D];山东大学;2006年
2 谭显胜;基于支持向量机的蛋白质分类及含氟农药活性预测[D];湖南农业大学;2007年
3 罗军;幽门螺杆菌napA基因的克隆、表达及NAP蛋白抗原表位研究[D];第一军医大学;2007年
4 袁晓萌;甘蓝型油菜小核糖核蛋白BnSmD1全长cDNA的克隆与表达分析[D];四川大学;2007年
5 张珍勇;油菜突变体Cr3529中一个与黄化相关的未知基因的克隆及表达载体的构建[D];四川大学;2007年
6 张倩;有机氯化物的生物降解技术研究[D];武汉理工大学;2007年
7 张民;基于重写逻辑的SN P系统模型检测[D];上海交通大学;2007年
8 林国友;幽门螺杆菌克拉霉素耐药菌株鉴定及23S rRNA全基因生物信息学研究[D];浙江大学;2007年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王长康;李昂;仲妍妍;王寿昆;王宏;王光瑛;;番鸭催乳素基因的克隆与序列分析[J];福建农林大学学报(自然科学版);2007年03期
2 颜宏利,宋云龙,刘凡,贺艳,孙树汉;膜联蛋白AnxB1的同源模建及降低免疫原性研究[J];中国科学C辑;2004年01期
3 殷志祥;蛋白质结构预测方法的研究进展[J];计算机工程与应用;2004年20期
4 张海霞,唐焕文,张立震,靳利霞,唐一源;蛋白质二级结构预测方法的评价[J];计算机与应用化学;2003年06期
5 张颖,吕军,李炜疆;高质量蛋白质空间结构数据库的构建方法[J];内蒙古大学学报(自然科学版);2000年04期
6 吕志清,李前忠;一种预测蛋白质结构型的新方法[J];内蒙古大学学报(自然科学版);2002年01期
7 殷雪,龙章富,巫雪艳,刘燕飞,李凤,刘世贵;草鱼生长激素基因的克隆及原核表达研究[J];四川大学学报(自然科学版);2004年02期
8 朱瑞良,张绍学,唐珂心;鸡波氏杆菌病研究初报[J];山东农业大学学报(自然科学版);1991年01期
9 孙强,韩骅;分泌蛋白特异性基因陷阱的设计与验证[J];生物化学与生物物理进展;2004年04期
10 刘伟;丁祖泉;王海芸;;蛋白质结构与功能研究中的分子模拟技术[J];上海生物医学工程;2006年01期
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 陈兴勇;皖西白鹅催乳素基因(PRL)编码区序列克隆及多态性分析的研究[D];安徽农业大学;2005年
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