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《安徽农业科学》 2010年18期
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枇杷核基因组DNA提取方法的改良及其SSR分析

仲艳  杜青珍  李海芬  孟祥勋  袁卫民  王化坤  郗红丽  
【摘要】:[目的]获得高质量基因组DNA,探讨并改进快速提取枇杷基因组DNA的方法。[方法]比较了3种传统的基因组DNA提取方法并对CTAB法进行改良,同时以27对适用苹果属扩增的SSR特异引物,对15种枇杷品种和2个组合的杂交后代进行PCR扩增,分析品种扩增片断多态性构建聚类关系树,统计了杂种后代等位性位点。[结果]改良CTAB法所提取的DNA具有良好的质量;27对引物15个品种中扩增出33个多态性片段,用NTYST软件进行分析聚为6类;一个杂种杂交后代扩增出32条片段,确定22个等位位点。[结论]改良CTAB适合于快速提取枇杷基因组DNA,SSR在枇杷基因组中具有多态性。

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【引证文献】
中国期刊全文数据库 前2条
1 战晴晴;周亚奎;杨云;甘炳春;卢丽兰;;槟榔SSR反应体系的建立[J];江西农业学报;2012年09期
2 任国慧;李晓刚;蔺经;王化坤;房经贵;;江苏省主要白沙枇杷资源的形态学研究与评价[J];江西农业学报;2012年12期
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 何桥;基于SSR标记的枇杷遗传多样性分析与品种鉴别[D];西南大学;2010年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前6条
1 潘新法,孟祥勋,曹广力,徐春明;RAPD在枇杷品种鉴定中的应用[J];果树学报;2002年02期
2 刘月学,杨向晖,林顺权,胡桂兵,刘成明;枇杷属植物基因组DNA提取方法的改进及其应用[J];果树学报;2005年02期
3 申丹;曾杰;周世良;徐大平;白嘉雨;;4种石山植物DNA提取方法筛选[J];广西科学;2005年04期
4 黄秦军,苏晓华,张香华;利用AFLP和SSR标记构建美洲黑杨×青杨遗传图谱[J];林业科学研究;2004年03期
5 孟祥勋,潘新法,曹广力,李蒙英;枇杷栽培种的随机扩增DNA多态性(RAPD)研究[J];生物技术通报;2003年04期
6 周涵韬,郑文竹,周以侹,夏涛;不同作物间共用SSR引物的初步研究[J];厦门大学学报(自然科学版);2002年01期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 郑红军;孙明远;宋福林;魏海蓉;李勃;;核果类果树分子标记研究进展[J];山东农业科学;2006年04期
2 周杰;于鹏;陈学森;姜远茂;刘安洲;陈晓流;李素真;;甜樱桃品种遗传多样性的SSR分析[J];山东农业科学;2008年03期
3 鞠玉栋,李金泉;水稻微卫星标记的发展与应用[J];安徽农业科学;2005年10期
4 郭大龙;;植物微卫星引物开发方法[J];安徽农业科学;2007年18期
5 杨妙贤;梁红;;SSR标记在猕猴桃遗传多样性研究中的应用[J];安徽农业科学;2008年32期
6 尹一伊;王玲;廖文彬;彭明;;几种橡胶基因组DNA提取方法的比较[J];安徽农业科学;2010年17期
7 李润枝;张娟;;SSR技术在遗传多样性研究中的应用[J];安徽农业科学;2010年20期
8 胡祎晨;孙正海;王锦;李世峰;辛培尧;范萱;;4种滑叶铁线莲基因组DNA提取方法比较[J];安徽农业科学;2011年36期
9 韩继成;刘国俭;常瑞峰;张新忠;;SSR方法标记桃果肉近核色素[J];安徽农业科学;2012年16期
10 吴晓梅;;猕猴桃遗传育种及其产业化进展[J];北方果树;2010年02期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 王永清;付燕;杨芩;罗楠;邓群仙;严娟;;41份枇杷属植物的ISSR分析[A];第五届全国枇杷学术研讨会论文(摘要)集[C];2011年
2 韩雪萍;王永清;;DNA分子标记在枇杷种质资源分析中的应用[A];第五届全国枇杷学术研讨会论文(摘要)集[C];2011年
3 罗楠;王永清;严娟;杨芩;付燕;陶炼;;基于RAPD和ISSR的栎叶枇杷、大渡河枇杷和普通枇杷遗传关系分析[A];第五届全国枇杷学术研讨会论文(摘要)集[C];2011年
4 张玲;杨向晖;林顺权;;枇杷果实总RNA的提取及八氢蕃茄红素合成酶基因(PSY)片段的克隆[A];第五届全国枇杷学术研讨会论文(摘要)集[C];2011年
5 姜正旺;黄宏文;张忠慧;王圣梅;;我国猕猴桃属植物资源的保存和利用研究进展[A];中国园艺学会第六届青年学术讨论会论文集[C];2004年
6 吴锦程;;我国枇杷生物技术研究进展[A];中国园艺学会第六届青年学术讨论会论文集[C];2004年
7 何天明;陈学森;许正;高疆生;林培钧;刘文;梁青;孟和巴图;;利用SSR标记对伊犁河谷野杏种群遗传结构的分析[A];中国园艺学会第十届会员代表大会暨学术讨论会论文集[C];2005年
8 马瑞娟;俞明亮;沈志军;;桃微卫星标记研究进展[A];中国园艺学会第七届青年学术讨论会论文集[C];2006年
9 黄武刚;程丽莉;王艳梅;;欧榛微卫星用于中国榛属植物遗传研究的初步评价[A];第五届全国干果生产、科研进展学术研讨会论文集[C];2007年
10 孙淑霞;李靖;陈栋;谢红江;江国良;;桃遗传多样性及亲缘关系的ISSR和SSR分析[A];第二届全国果树分子生物学学术研讨会论文集[C];2009年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 于海洋;牙鲆微卫星标记的筛选和美洲牡蛎抗病相关基因SNP的初步分析[D];中国海洋大学;2010年
2 文亚峰;人心果品种资源亲缘关系及其授粉亲和性的研究[D];中南林业科技大学;2006年
3 闫小玲;基于cpDNA单倍型和SSR分析的银杏群体遗传结构和谱系地理学研究[D];浙江大学;2010年
4 叶华;大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D];湖南农业大学;2010年
5 裴承国;水稻极晚熟抽穗期基因qHD8-1的精细定位[D];山东农业大学;2011年
6 王延玲;新疆红肉苹果红色发育机理的初步研究[D];山东农业大学;2011年
7 罗楠;枇杷属植物亲缘关系及遗传多样性研究[D];四川农业大学;2011年
8 樊红科;苹果杂交后代果实性状选择及抗斑点落叶病MdWRKY基因功能研究[D];西北农林科技大学;2011年
9 白团辉;苹果砧木根际低氧耐性差异机理及QTL定位研究[D];西北农林科技大学;2011年
10 张堃;两种叶菜镉、铅低积累品种筛选及其快速鉴别方法研究[D];中山大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 陆景标;高丹草SSR引物电子PCR及遗传多态性分析[D];安徽农业大学;2010年
2 蒋玮;不同类型啤酒大麦品种遗传多样性及遗传差异的SSR分析[D];甘肃农业大学;2010年
3 尤卫艳;光皮桦分子遗传连锁图谱的构建[D];浙江农林大学;2009年
4 刘奇;大泷六线鱼(Hexagrammos otakii)生物学特征与遗传多样性研究[D];中国海洋大学;2010年
5 陈秀萍;普通枇杷[Eriobotrya japonica (Thunb.)Lindl.]植物若干性状鉴定与分类研究[D];中国农业科学院;2010年
6 刘婷婷;长梗黄精11个微卫星位点的筛选及跨种扩增[D];安徽师范大学;2010年
7 周剑;杨梅栽培品种的SSR标记指纹数据库和多重荧光标记鉴别技术[D];浙江大学;2011年
8 禹玉婷;利用RAPD分子标记研究湘鄂西地区天然珙桐(Davidiainvolucrate)的遗传多样性[D];中南林业科技大学;2007年
9 田华;桉树4个种遗传多样性的ISSR分析及STS标记开发初探[D];中南林业科技大学;2009年
10 程千钉;百合杂交种的鉴定及其耐热性比较研究[D];河北农业大学;2011年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 艾呈祥;刘庆忠;李国田;张力思;;甜樱桃品种SSR指纹图谱的构建[J];山东农业科学;2010年04期
2 孙燕琳;阮成江;金华;;沙棘SSR分子标记的开发[J];安徽农业科学;2007年01期
3 王化坤;邱学林;徐春明;沈珉;李浩宇;张海如;张春晓;黄丽芳;;2008年低温暴雪对枇杷北缘地区生产造成的影响[J];安徽农业科学;2009年19期
4 张广和;唐美玲;张文娜;赵明;;甜樱桃先锋及其芽变品种的SSR分析[J];北方园艺;2009年07期
5 唐蓓;普通枇杷、大渡河枇杷、栎叶枇杷的亲缘关系探讨[J];重庆师范学院学报(自然科学版);1997年03期
6 海林,王克晶,杨凯;半野生大豆种质资源SSR位点遗传多样性分析[J];西北植物学报;2002年04期
7 宋健;韩明玉;赵彩平;高妍;;桃‘秦光2号’ב曙光’F_1代SSR遗传连锁图谱的构建[J];西北植物学报;2008年05期
8 陈桂枝,胡波;枇杷果实性状的系统聚类分析[J];福建果树;2000年02期
9 陈义挺,赖钟雄,陈菁瑛,郭玉琼,蔡英卿,郭志雄,吴金寿,黄金松;枇杷品种早钟6号与解放钟、森尾早生亲缘关系的RAPD分析[J];福建农业大学学报;2004年01期
10 娄晓鸣,张春晓,储春荣,郄红丽,王化坤;十个白沙枇杷品种品质比较[J];中国南方果树;2004年04期
中国博士学位论文全文数据库 前5条
1 蔡礼鸿;枇杷属的等位酶遗传多样性和种间关系及品种鉴定研究[D];华中农业大学;2000年
2 尹载皓;基于SSR技术和ITS序列进行桃(Prunus persica L.Batsch)品种间亲缘关系的研究[D];中国农业大学;2005年
3 孟海军;柑橘胚胎发生过程中DNA甲基化/去甲基化研究及SSR标记开发[D];华中农业大学;2006年
4 汪卫星;天然与人工合成三倍体枇杷基因组变异及其DNA甲基化分析[D];西南大学;2008年
5 张水明;基于AFLP和SSR分子标记的中国杨梅遗传多样性分析[D];浙江大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 冯晨静;李种质资源RAPD、SSR、ISSR亲缘关系鉴定及遗传多样性研究[D];河北农业大学;2005年
2 杨本芸;桃、李、杏、核桃不同品种的SSR指纹图谱构建[D];河北农业大学;2006年
3 李亚蒙;桃垂枝性状生理特性及SSR分子标记研究[D];山东农业大学;2006年
4 徐宝利;用SSR标记对甘肃地方油桃(Prunus Persica L)种质资源遗传多样性及亲缘演化关系分析[D];甘肃农业大学;2006年
5 张靖国;湖北海棠遗传多样性的SSR分析[D];华中农业大学;2007年
6 盛良明;白沙枇杷优良单株—苏白1号的选育及其分子鉴定[D];南京农业大学;2006年
7 韩蕾;利用AFLP和SSR鉴定苹果砧木及SH40自然实生后代父本[D];河北农业大学;2008年
8 蔡胜文;仁用杏与扁桃属间杂交种的获得及SSR分析[D];河北农业大学;2008年
9 姚利华;苹果属EST-SSR标记开发及其在梨属上的转移性[D];浙江大学;2008年
10 董燕妮;枇杷小种子植株遗传多样性的RAPD分析[D];四川农业大学;2008年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 孙淑霞;谢红江;李靖;涂美艳;陈栋;江国良;;枇杷果肉色泽深浅性状的分子标记鉴定[J];西南农业学报;2012年06期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 龙治坚;韩国辉;党江波;梁国鲁;向素琼;;枇杷种质资源遗传多样性的SSR分析[A];第五届全国枇杷学术研讨会论文(摘要)集[C];2011年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 陈桂枝,胡波;枇杷果实性状的系统聚类分析[J];福建果树;2000年02期
2 郑国华,郑育俊,何文庆;枇杷基因组DNA分离技术及浓度测定[J];福建农业科技;2000年06期
3 邓九生,赖炽昌,彭民璋;几个杧果品种的RAPD分析[J];果树科学;1999年02期
4 王三红,陈力耕,章镇,房经贵;RAPD在柑橘品系鉴别上的应用[J];果树科学;2000年01期
5 王军,贺普超;山葡萄基因组DNA提取及RAPD鉴定[J];果树科学;2000年02期
6 潘新法,孟祥勋,曹广力,徐春明;RAPD在枇杷品种鉴定中的应用[J];果树学报;2002年02期
7 周厚高,谢义林,黎桦,周琼,张西丽,王中仁,周世良;广西石灰岩地区蜈蚣蕨居群的遗传多样性研究[J];广西植物;2002年01期
8 程运江,伊华林,庞晓明,郭文武,邓秀新;几种木本果树DNA的有效提取[J];华中农业大学学报;2001年05期
9 陈义挺,赖钟雄,郭志雄,郭玉琼,蔡英卿,陈菁瑛,陆修闽,吴金寿;枇杷主要种类的RAPD分析[J];江西农业大学学报;2003年02期
10 梁国鲁;;中国苹果属(Malus)植物的核型比较研究[J];西南农业大学学报;1986年01期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 宋丰顺;倪大虎;陆徐忠;汪秀峰;张毅;赵伟;李莉;杨剑波;;水稻单粒种子DNA的快速制备及PCR分析[J];安徽农业科学;2007年21期
2 王艳梅;马天晓;翟明普;;中国特有种虎榛SSR反应体系的初步研究[J];北方园艺;2009年06期
3 王芳;王化俊;王汉宁;;玉米基因组DNA的提取及SSR分析[J];玉米科学;2006年02期
4 田海燕;杨相昆;田新惠;李艳军;孙杰;;陆地棉SSR分子标记优化体系的建立[J];湖北农业科学;2007年04期
5 李楠;张海英;陈年来;王永健;许勇;宫国义;郭绍贵;;三种瓜类作物SSR扩增的通用性与多态性分析[J];华北农学报;2008年04期
6 王绍鹏;邱彩玲;李勇;宿飞飞;刘尚武;吕典秋;;马铃薯DNA提取及SSR标记分析[J];东北农业大学学报;2009年05期
7 张玉平;金万梅;许奕华;崔秋华;潘青华;李少宁;;适于SSR分析的树莓基因组DNA的快速提取[J];北方园艺;2009年10期
8 王润辉;赵奋成;;湿地松、加勒比松及其杂交种DNA的提取与微卫星PCR反应体系的优化[J];广东林业科技;2006年01期
9 田海燕;田新惠;李艳军;孙杰;;棉花DNA的提取及其SSR分子标记体系的建立[J];石河子大学学报(自然科学版);2007年02期
10 聂琼;刘仁祥;徐如宏;高焕烨;;烟草基因组DNA的高效提取与SSR应用[J];种子;2009年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 黄武刚;程丽莉;王艳梅;;欧榛微卫星用于中国榛属植物遗传研究的初步评价[A];第五届全国干果生产、科研进展学术研讨会论文集[C];2007年
2 龙治坚;韩国辉;党江波;梁国鲁;向素琼;;枇杷种质资源遗传多样性的SSR分析[A];第五届全国枇杷学术研讨会论文(摘要)集[C];2011年
3 王书珍;丁毅;;苦瓜基因组SSR分子标记引物的开发与利用[A];基因开启未来:新时代的遗传学与科技进步——湖北省遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2009年
4 董丽娟;王旭;段继华;张曙光;;84个茶树品种遗传多样性及亲缘关系的SSR分析[A];第六届海峡两岸茶业学术研讨会论文集(摘要)[C];2010年
5 陈琛;庄木;程斐;刘玉梅;杨丽梅;张扬勇;方智远;;甘蓝EST-SSR标记的建立[A];庆祝中国园艺学会创建80周年暨第11次全国会员代表大会论文摘要集[C];2009年
6 王萌;张国珍;沈崇尧;段霞瑜;周益林;;小麦白粉菌SSR标记的开发及其在群体遗传多样性中的初步应用[A];2010年中国菌物学会学术年会论文摘要集[C];2010年
7 付小琼;杨付新;王秀玲;李亚丽;;利用SSR标记鉴定中棉所72杂交种的纯度和真实性[A];中国棉花学会2010年年会论文汇编[C];2010年
8 金伟栋;;基于SSR标记的太湖流域粳稻地方品种遗传多样性研究[A];苏州市自然科学优秀学术论文汇编(2008-2009)[C];2010年
9 叶翔;黄晨阳;王钰;张金霞;;利用SSR分子标记鉴别香菇栽培品种初探[A];中国菌物学会第五届会员代表大会暨2011年学术年会论文摘要集[C];2011年
10 韩国辉;魏旭;向素琼;何波;汪卫星;梁国鲁;何桥;郭启高;李晓林;;柑橘胚培养幼苗微量叶片基因组DNA快速提取及SSR分析(摘要)[A];第二届全国果树分子生物学学术研讨会论文集[C];2009年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 宝龙;优质枇杷品种[N];江苏农业科技报;2001年
2 柯宗;“枇杷品种选育及产业化开发关键技术研究与应用”项目通过省科技成果鉴定[N];四川科技报;2010年
3 张荔子;消毒和DNA提取正在进行[N];健康报;2005年
4 记者  王卫英;穆坞枇杷今年是个丰收年[N];金华日报;2006年
5 耕农;科技兴果又促销[N];福建科技报;2006年
6 曾浩 李洪 本报记者 赵一;正月间龙泉已是桃花红枇杷黄[N];成都日报;2007年
7 凌道文吴成洪 江伟民;枇杷丰收游客多[N];黄山日报;2007年
8 电脑商报记者 刘一冰;浪潮SSR“两条腿走路”[N];电脑商报;2009年
9 本报记者 刘丽丽;浪潮SSR是主机的安全后盾[N];计算机世界;2009年
10 本报记者 王燕波;枇杷:合理管理,促进高产[N];江苏农业科技报;2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 郭宝英;黑斑原鮡遗传多样性分析及微卫星标记的开发[D];华中农业大学;2009年
2 何桥;基于SSR标记的枇杷遗传多样性分析与品种鉴别[D];西南大学;2010年
3 何珂;红腹锦鸡SSR和Ⅱ类MHC位点的分离及种群遗传结构分析[D];浙江大学;2012年
4 穆国俊;棉花有益突变体的创制及突变性状的分子遗传学鉴定[D];河北农业大学;2008年
5 马洪雨;三种重要海水养殖鱼类性别特异标记和微卫星标记开发及遗传连锁图谱构建[D];中国海洋大学;2009年
6 王晓清;大黄鱼DNA分子标记技术及其在遗传育种中应用研究[D];湖南农业大学;2007年
7 张凤兰;沙芥属植物遗传多样性及其亲缘关系研究[D];内蒙古农业大学;2009年
8 张利达;植物基因相关SSR序列调控及位点多态性研究[D];上海交通大学;2010年
9 Manosh Kumar Biswas;[D];华中农业大学;2010年
10 马鸿艳;甜瓜白粉病抗性遗传分析及相关基因SSR标记[D];东北林业大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 逄巧巧;采用SSR和AFLP标记技术对龙须菜的遗传多样性分析[D];中国海洋大学;2009年
2 仲艳;枇杷(Eriobotrya Lindl)核基因组DNA提取方法的改良及其SSR初步分析[D];苏州大学;2010年
3 夏秀忠;木薯品种的AFLP和SSR遗传多态性研究[D];广西大学;2005年
4 张娜;小麦抗叶锈病基因Lr45的AFLP和SSR分子标记[D];河北农业大学;2005年
5 燕妮;几个油菜不育胞质的mtDNA的SSR分析[D];甘肃农业大学;2007年
6 裴静宇;小麦条锈菌异核现象研究及SSR分子标记建立[D];吉林农业大学;2006年
7 严玉坤;高番茄红素性状的遗传分析及分子标记[D];东北农业大学;2009年
8 李小龙;北沙柳种质资源库遗传多样性的SSR分子标记分析[D];内蒙古农业大学;2011年
9 罗丹;芜菁SSR分子标记的多态性分析及筛选[D];东北林业大学;2012年
10 贾瑞祥;中国小麦条锈菌主要流行小种DNA多态性分析[D];中国农业大学;2005年
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