《计算机与应用化学》2001年04期 加入收藏    获取最新 
 基于XML的海洋天然产物数据库
 裴剑锋;雷静;彭涛;周家驹
   海洋天然产物数据库 (MNPD)中含有约 80 0 0种海洋天然产物的分子结构及其生物来源、生物活性、药效、物理化学参数和参考文献等信息 ,部分分子结构信息用CML表示。MNPD基于XML构建 ,MNPD和XML的集成更有利于MNPD数据库的管理、查询、Web发布和数据交换 ,以及适应MNPD未来的扩展
【作者单位】:中国科学院化工冶金研究所计算机化学开放实验室!北京100080
【关键词】:海洋;天然产物;XML;CML;数据库
【分类号】:TP399
【DOI】:cnki:ISSN:1001-4160.0.2001-04-012
【正文快照】:
  1 引言海洋中的各种生物约 2 0余万种 ,是一个名符其实的资源宝库。由于海洋生物的生态环境与陆地生物迥然不同 ,导致生物代谢过程的不同 ,因此海洋中的天然产物与陆地的天然产物具有很大差异 ,其中有大量结构独特的化合物。近二、三十年来 ,国际上海洋天然产物研究有很大发展
 
 推荐 下载CAJ全文           下载PDF全文
 CAJViewer7.0阅读器支持所有CNKI文件格式,AdobeReader仅支持PDF格式
 Using XML in the Marine Natural Products Database
 PEI Jian\|feng LEI Jing PENG Tao ZHOU Jia\|ju (Laboratory of Computer Chemistry;Institute of Chemical Metallurgy;Chinese Acaderny of Sciences;Beijing 100080)
  The Marine Natural Products Database(MNPD) consists of about 8 000 natural productes with the information of there molecular structures,biological resources, bioactivities, physical and chemical parameters and references. MNPD was constructed based on XML and some chemical information was encoded with CML. The integration of XML into MNPD enhances the performance of the database with XML features and makes it easier to upgrade and extend.
【Keyword】:marine, natural products, XML, CML, database
 【参考文献】 共(1)篇 
 中国期刊全文数据库找到 1 条
 
1管华诗,耿美玉,王长云; 21世纪,中国的海洋药物 [J];中国海洋药物; 2000年04期
 【引证文献】 共(12)篇 
 中国期刊全文数据库找到 7 条
 
1傅正生,王长青,刘茂栋,陈洁; Molecular Properties在海藻糖分子构象分析中的应用 [J];宝鸡文理学院学报(自然科学版); 2005年02期
2肖信,袁中直; 三维分子结构的制作、显示和格式转换 [J];计算机与应用化学; 2005年08期
3彭涛,裴剑锋,周家驹; 化学标记语言及其应用 [J];计算机与应用化学; 2003年Z1期
4刘月秀,李振玲; 我馆建设海洋水产特色数据库的思考 [J];农业图书情报学刊; 2005年05期
5雷静,周家驹; 海洋天然产物信息Web检索系统 [J];计算机与应用化学; 2001年Z1期
6刘月秀,李振玲; 对我馆海洋水产特色数据库建设的思考 [J];科技文献信息管理; 2005年01期
7程翼宇,范骁辉,瞿海斌; 论建立与发展中药信息学 [J];中国中医药信息杂志; 2003年02期
 中国优秀硕士学位论文全文数据库找到 5 条
 
1陶怡; 利用本体论(Ontology)研究脑科学相关基因信息 [D];东南大学; 2006年
2王攀; 神经系统相关生物信息二级数据库的构建 [D];华中科技大学; 2004年
3姬鹏; 有害藻华监测与预报系统研究 [D];西安科技大学; 2006年
4罗芳; 基于XML的生物数据的组织与处理 [D];中南大学; 2007年
5祝帅; 基于信息自动获取构建生物信息平台及序列比对算法研究 [D];电子科技大学; 2006年
 【共引文献】 共(37)篇 
 中国期刊全文数据库找到 10 条
 
1黄美珍; 海洋药物开发与生物技术 [J];福建水产; 2002年03期
2张真庆,于广利,赵峡,李倩,管华诗; 几种糖醛酸及其寡糖的薄层层析分析 [J];分析化学; 2005年12期
3陈轶林,张承来; 微生物源活性物质的开发与化学新农药的创制 [J];广东农业科学; 2005年03期
4黄美珍,李志棠; 海洋药物研究开发趋势 [J];福建水产; 2006年03期
5卞俊; 国内外海洋药物研究进展和展望 [J];海军医学杂志; 2007年01期
6褚世栋,李英霞,耿美玉,宋妮,管华诗; 基于Internet的海洋药物虚拟研究 [J];中国海洋药物; 2001年02期
7袁华茂,宋金明; 糖类化合物的化学修饰及其生物活性的研究进展 [J];海洋科学; 2003年03期
8雷静,周家驹; 海洋天然产物信息Web检索系统 [J];计算机与应用化学; 2001年Z1期
9刘济宁,余向阳,张存政,洪葵,彭正强,刘贤进; 具有杀虫活性的海洋微生物的筛选 [J];江苏农业学报; 2004年02期
10雷静,周家驹; 海洋天然产物数据库的设计与建立 [J];化学通报; 2002年05期
 中国优秀硕士学位论文全文数据库找到 7 条
 
1李维嘉; 液相中糖与纳米硒相互作用及其光谱研究 [D];暨南大学; 2006年
2田东娜; 知识经济下区域海洋经济的可持续发展研究——以大连市海洋经济发展为例 [D];辽宁师范大学; 2001年
3王欣; 龙须菜多糖的提取、分析及其生理活性的研究 [D];汕头大学; 2006年
4郭刚; 海洋微生物抗稻瘟菌(Pyricularia grisea)活性菌株的筛选 [D];华南热带农业大学; 2003年
5徐大伦; 浒苔主要化学组分的分析及多糖活性的研究 [D];中国海洋大学; 2004年
6马辉; 海洋粘细菌活性菌株筛选及菌株HW-1次生代谢产物研究 [D];华东师范大学; 2007年
7余成艳; 邻苯二甲酰基化κ-卡拉胶的合成及其生物活性 [D];汕头大学; 2007年
 中国博士学位论文全文数据库找到 4 条
 
1方再光; 中国南海厚指海绵Pachylina sp.和皮海绵Suberites sp.体内真细菌和古细菌多样性研究 [D];华南热带农业大学; 2004年
2赵权宇; 海绵细胞在微载体表面贴附特征与规律的研究 [D];中国科学院研究生院(大连化学物理研究所); 2005年
3李宪璀; 海藻中α-葡萄糖苷酶抑制剂的分离鉴定及其活性机理的研究 [D];中国科学院海洋研究所; 2001年
4王佃亮; 一种新型海洋纤溶酶的研究 [D];中国海洋大学; 2006年
 中国重要会议论文全文数据库找到 2 条
 
1段振华; 海南省水产品资源的现状可持续发展与对策探讨 [A];中国科协2004年学术年会海南论文集 [C]; 2004年
2熊利霞,李建中,孔繁祚; 南戴河和天津大港地区海洋微生物的分离与杀虫活性筛选 [A];微生物生态学研究进展——第五届微生物生态学术研讨会论文集 [C]; 2003年
 【同被引文献】 共(141)篇 
 中国期刊全文数据库找到 10 条
 
1尚彤,刘贝,张其鹏,张丹,谭耀麟; 蛋白质、核酸序列信息的获取、管理和发布 [J];北京大学学报(医学版); 2002年01期
2程翼宇,余杰,钟建毅; 基于分形维数的分析信号自适应中值滤波 [J];分析化学; 2001年11期
3钟建毅,程翼宇,陈闽军; 基于小波变换的多组分药物计算光度分析法 [J];光谱学与光谱分析; 2000年01期
4程翼宇,赵明洁; 一类基于模糊神经元的复杂非线性化学模式识别方法 [J];高等学校化学学报; 2001年11期
5程翼宇,陈闽军,方慧生; 一类用于多元光度分析的小波基主成分回归法 [J];分析化学; 1999年02期
6郭红梅; 脑研究的困境与出路 [J];广东教育学院学报; 2003年02期
7董雁适,程翼宇; 基于小波理论的化学谱图数据自适应滤波方法研究 [J];高等学校化学学报; 1999年03期
8刘平,程翼宇; 辨识药物定量构效关系的模糊神经网络方法研究 [J];高等学校化学学报; 2000年10期
9邓志鸿,唐世渭,张铭,杨冬青,陈捷; Ontology研究综述 [J];北京大学学报(自然科学版); 2002年05期
10袁激光,金人超,李红涛; 基于A~*算法的启发式算法求解多序列比对问题 [J];华中科技大学学报(自然科学版); 2003年09期
 中国优秀硕士学位论文全文数据库找到 1 条
 
1王攀; 神经系统相关生物信息二级数据库的构建 [D];华中科技大学; 2004年
 中国重要会议论文全文数据库找到 1 条
 
1沈钧贤; 迎接“人类脑计划”,加强神经信息学研究 [A];首届中国神经信息学讨论会摘要 [C]; 2000年
 西文参考文献找到 10 条
 
1Faulkner D J; Marine natural products [M];Nat Prod Rep; 2000年
2GREEN J L, ANGELL C A; Phase relations and vitrification in saccharide-water solutions and the trehalose anomaly [M];J Phys Chem; 1989年
3Stephan Philippi; Light - weight integration of molecular biological databases [M];Bioinformatics; 2004年
4Oefner P J, Underhill P A; Current Protocols in Human Genetics [M];New York: Wiley; 1998年
5L. Hass, P. Schwartz, P. Kodali, et al; DiscoveryLink: a system for integr ating life science data [M];IBM System Journal; 2001年
6Akmal B Chaudhri,Awais Rashid,RobertoZicari; XML Data Management: Na tive XML and XMLoEnabled Database Systems [M];; 2003年
7Shankar S; Bioformatics and computational biology[EB/OL] [M];http://www.bioeng.ucsd.edu/research-groups/compbio/index.html; 2001-10-25年
8Akmal B Chaudhri,Awais Rashid,RobertoZicari; XML Data Management :Native XML and XML-Enabled Database Systems [M];; 2003年
9D. C. Jamison; Editorial: OPEN BIOINFORMATICS [M];Nucleic Acids Research; 2003年
10 NCBI HomePage [M];http://www.ncbi.nlm.nih.gov/.; 2006年
 【二级参考文献】 共(5)篇 
 中国期刊全文数据库找到 3 条
 
1郭跃伟; 海洋天然产物的应用前景展望 [J];中国海洋药物; 2000年02期
2韦成礼,李玲,游丽云; 国内外从海洋微生物开发新型药物的研究概况 [J];生物技术通报; 1998年02期
3王洛伟,韩燕,龚国川; 海洋药物开发现状及展望 [J];中华航海医学杂志; 1999年01期
 西文参考文献找到 2 条
 
1Joseph R; Pawlik.Marine invertebrate chemical defenses [M];Chem Rev; 1993年
2Okamyi H; Marine Microorganisms as sources of Bioactive Agents [M];Microbiol Ecology; 1986年
 【二级引证文献】 共(14)篇 
 中国期刊全文数据库找到 10 条
 
1冯红君,周俊林; 化学分子结构在计算机中的表示方法 [J];电脑知识与技术(学术交流); 2007年09期
2麦裕华,肖信; 基于控件集成技术的分子结构可视化教学 [J];化学教学; 2007年03期
3雷静; ISIS Base化学数据库向关系数据库的迁移 [J];计算机与应用化学; 2005年11期
4栗青生,邱建新; 个性化多媒体化学课件开发与集成系统的可视化设计与实现 [J];计算机与应用化学; 2005年05期
5肖信,袁中直; 三维分子结构的制作、显示和格式转换 [J];计算机与应用化学; 2005年08期
6郑振容; 水产科技数据库的建设与思考 [J];图书馆建设; 2006年06期
7岳艳明; 数字时代图书馆的海洋信息服务 [J];图书情报工作; 2006年05期
8顾骏; 医学信息学的研究现状及发展趋势 [J];医学情报工作; 2006年01期
9王毅,程翼宇; 中药组效关系辨识方法学与计算理论研究思路与策略 [J];中国天然药物; 2003年03期
10崔蒙,尹爱宁,李海燕,谢琪,范为宇,朱冬生,张华敏; 论建立中医药信息学 [J];中医杂志; 2008年03期
 中国优秀硕士学位论文全文数据库找到 4 条
 
1宋静静; 嵌入式分布数据库的查询优化算法研究 [D];山东大学; 2007年
2陶怡; 利用本体论(Ontology)研究脑科学相关基因信息 [D];东南大学; 2006年
3于志强; 海洋环境在线监测与实时信息发布系统的研究 [D];山东大学; 2007年
4王佩佩; 中药色谱数据智能化分析处理 [D];南京航空航天大学; 2006年
 【相似文献】 
 中国期刊全文数据库
 
1裴剑锋,雷静,彭涛,周家驹; 基于XML的海洋天然产物数据库 [J];计算机与应用化学; 2001年04期; 66-70
2刘智,张轮,朱铁丹; XML与面向Web的数据挖掘技术 [J];吉林化工学院学报; 2001年04期; 81-83
3于工,周祖荣; 新一代的网络语言XML [J];青岛化工学院学报(自然科学版); 2002年03期; 65-69
4卿秀华; 基于XML的异构数据库数据交换 [J];武汉科技学院学报; 2003年05期; 68-71
5姚俊,孙济庆; 基于XML的中间件技术在档案信息系统中的应用 [J];华东理工大学学报; 2002年06期; 107-110
6余有明,孙慧瑜,张晓明; 基于网络新语言XML的数据库程序开发 [J];北京石油化工学院学报; 2002年03期; 26-30
7黄婉秋,黄筱霞,贾旭光; XML语言及其应用 [J];北京工商大学学报(自然科学版); 2002年03期; 25-30
8李钰; 利用ASP和XML技术动态显示数据库数据的研究 [J];武钢技术; 2003年02期; 29-31
9何薇; XML与Web数据库信息交换方法的应用研究 [J];北京印刷学院学报; 2003年01期; 13-18
10殷丽凤,赵硕; XML局部函数依赖 [J];齐齐哈尔大学学报; 2005年04期; 57-58+77
 中国优秀硕士学位论文全文数据库
 
1张彦; 面向XML的搜索引擎研究 [D];哈尔滨工程大学; 2005年
2赵宏鑫; 基于Web平台的工作流管理系统的设计与实现 [D];西北工业大学; 2005年
3程志军; 基于Web Services的企业应用集成(EAI)研究 [D];同济大学; 2006年
4王小庆; 基于J2EE和XML技术构建电子政务系统的方法研究 [D];华中师范大学; 2006年
5林涛; 基于XML的RETSS顾客系统的开发与研究 [D];吉林大学; 2006年
6张志民; 基于XML智能电子表单管理系统的研究与实现 [D];吉林大学; 2005年
7王荃; NEXT系统中元数据管理与索引技术研究 [D];东北大学; 2005年
8郑丹; 基于XML的工作流的研究和实现 [D];北京交通大学; 2007年
9郭玉珂; XML面向对象数据模型研究及应用 [D];中南大学; 2005年
10陈敏; 基于XML和Java的异构数据库集成的应用研究 [D];武汉理工大学; 2006年
 中国博士学位论文全文数据库
 
1汪源; XML事务模型及并发控制研究 [D];浙江大学; 2006年
2朱晓冬; 数字博物馆关键技术研究 [D];西北大学; 2004年
3陈亚华; 企业应用集成架构研究与实现 [D];复旦大学; 2005年
4连剑波; 基于XML的地质数据集成及WebGIS发布研究 [D];中国科学院研究生院(广州地球化学研究所); 2006年
5雷向欣; XML索引和过滤查询若干关键技术研究 [D];复旦大学; 2005年
6戴敏; 多工序制造过程质量分析方法与信息集成技术研究 [D];东南大学; 2006年
7覃如府; 中国岩石圈三维结构数据库集成及其管理系统开发研究 [D];吉林大学; 2006年
8蒋哲远; 基于Web服务的特定领域软件体系结构及其关键技术研究 [D];合肥工业大学; 2006年
9王建涛; 基于Web的地理信息服务的研究与实践 [D];中国人民解放军信息工程大学; 2005年
10秦杰; Web环境中半结构化数据存储与查询技术研究 [D];国防科学技术大学; 2005年
 中国重要会议论文全文数据库
 
1常小慧,李宏伟; 基于C#的GML文档解析 [A];中国地理信息系统协会第八届年会论文集 [C]; 2004年
2秦兵,裘杭萍,何明; XML在XMSF中的应用 [A];系统仿真技术及其应用(第7卷)——'2005系统仿真技术及其应用学术交流会论文选编 [C]; 2005年
3胡孔法,董逸生,陈崚; 空间数据仓库与OLAP技术研究 [A];'2005数字江苏论坛——电子政务与地理信息技术论文专辑 [C]; 2005年
4胡孔法,董逸生,陈崚; 空间数据仓库与OLAP技术研究 [A];'2005数字江苏论坛电子政务与地理信息技术论文专辑 [C]; 2005年
5李颖,刘连忠; 基于数据绑定技术的数据交换系统的设计与实现 [A];2006中国控制与决策学术年会论文集 [C]; 2006年
6王焱,郑俊辉,范锐; XML技术及其在电子商务中的应用 [A];全国第十五届计算机科学与技术应用学术会议论文集 [C]; 2003年
7马彪,董平军,杨保安; 基于异构知识的智能决策支持系统结构框架设计 [A];2004中国控制与决策学术年会论文集 [C]; 2004年
8徐宗昌,周健,刘义乐; 基于XML的智能FMEA知识表示 [A];第一届维修工程国际学术会议论文集 [C]; 2006年
9于瑞祥,严隽薇,凌卫青; 关系型数据库与XML数据映射研究 [A];全国先进制造技术高层论坛暨制造业自动化、信息化技术研讨会论文集 [C]; 2005年
10丛日建,孙国强; 基于QB编码的数据检索方法 [A];第三届全国信息获取与处理学术会议论文集 [C]; 2005年
 中国重要报纸全文数据库
 
1北京邮电大学 张剑; XML技术预览 [N];计算机世界; 2001年
2湖北 张海; 编程日日帖 [N];电脑报; 2005年
3北京邮电大学 张剑; XML技术入门 [N];计算机世界; 2001年
4 字符如何编码③ [N];软件报; 2000年
5孤独笑 乌咪; 打造你的音乐万年历(上) [N];电脑报; 2003年
6Robots; XML编辑看过来 [N];软件报; 2003年
7陕西 冯杰; XML在 .net平台下的自定义控件的应用 [N];软件报; 2003年
8上海 无闻; SVG入门 [N];软件报; 2002年
9方正技术研究院XML中国论坛网(www.xml.net.cn 董欣; XML的语法 [N];网络世界; 2000年
10杭州商学院 徐建平; 使用ASP访问XML文件 [N];计算机世界; 2001年