《自然杂志》1995年01期 加入收藏    获取最新 
 Z曲线,显示和分析DNA序列的直观工具
 张任,张春霆
   基于正四面体的对称性,我们将一DNA序列与三维空间中一条曲线,称为Z曲线,建立起一、一对应映射。对于任一给定DNA序列,可求出唯一的一条Z曲线与之对应,反之亦然。Z曲线一般是具有丰富的折叠结构的三维空间曲线,它反映了DNA序列中碱基分布的局部细节与总体特征。Z曲线的对称性、渐近性、回路性等性质被全面加以介绍。并探讨了Z曲线在分子生物学中可能的应用。Z曲线的提出,开创了一个利用几何学分析和研究DNA序列的崭新领域。我们深信,利用现代计算机图形学装备起来的Z曲线,将成为研究和分析DNA序列的新的强大工具。
【作者单位】:上海医科大学(张任);天津大学(张春霆)
【关键词】:Z曲线;DNA序列;碱基分布;几何学分析;计算机图形学
【分类号】:Q523;Q617;TP391.
【DOI】:cnki:ISSN:0253-9608.0.1995-01-009
【正文快照】:
  一、问题的提出当前我们处于信息爆炸的时代,首先是生物信息的爆炸.自从DNA双螺旋结构发现以来,至令不过40余年,人类关于DNA序列的知识以惊人的速度增长着.近年来,积累的DNA序列每两年翻一翻.特别是“人体基因组计划”的实施,计划在公元2005年以前将人细胞内约30亿个碱基的DNA序列的排列顺序全部测出,更加快了这种速度.绝大部分生物的遗传信息隐藏在DNA序列之中.通常,用A、C、G和T四种字母来代表四种碱基.由不同数量的这四种字母按不同顺序排列的一维链就构成了DNA序列.若把人体中30亿个碱基的DNA序列全部印出,则相当于13套大英百…
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